一株急性散发性戊型肝炎病毒基因结构及核苷酸同源性分析

目的：分析一株长春地区散发戊型肝炎病毒（HEV）的基因结构和核苷酸同源性。方法：采用RT—nPCR方法检测HEVRNA，应用全自动测序仪进行序列测定。结果：所获得的HEV-CCC220全长7193bp，编码2397个氨基酸，由5＇-UTR（nt1-9）、3＇-UTR（nt 7152—7193）和3个开放读码框架（ORFs）组成。与HEVIV型核苷酸同源性明显高于HEVⅠ～Ⅲ型，全基因序列核苷酸同源性为83．2％～85．0％；与ORF2间300nt和98nt部分基因序列核苷酸同源性分别为85．0％～93．9％和80．6％～86．7％。结论：长春地区散发性HEV-CCC220属HEVIV型，ORF2间300nt部分核苷酸序列可以代替全基因序列进行HEV基因型分析。