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利用宏基因组数据筛选高产核黄素的基因片段
被引量:
2
1
作者
赵越
王晖
+2 位作者
鲍楠
池村淑道
李岭
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2009年第3期380-384,共5页
从基于网络平台的宏基因组数据库入手,通过使用ARSA查询功能确定具有高产核黄素功能蛋白质,并利用BLAST、Orf Finder以及FASTA程序对其相关序列进行筛选和比对,得到一些具有潜在应用价值的基因片段。通过进一步确定这些替代基因的物种...
从基于网络平台的宏基因组数据库入手,通过使用ARSA查询功能确定具有高产核黄素功能蛋白质,并利用BLAST、Orf Finder以及FASTA程序对其相关序列进行筛选和比对,得到一些具有潜在应用价值的基因片段。通过进一步确定这些替代基因的物种来源和物缘关系,筛查出在马尾藻海、巴拿马运河以及加拉帕格斯群岛附近海域存在的一些海洋螺菌属和聚球藻属的微生物。这些微生物的基因组中存在具有高产核黄素能力的基因片段,可望为改进国内现有的核黄素生产技术提供线索。
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关键词
宏基因组
核黄素
rib操纵子
基因
筛选
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职称材料
题名
利用宏基因组数据筛选高产核黄素的基因片段
被引量:
2
1
作者
赵越
王晖
鲍楠
池村淑道
李岭
机构
东北
大学
中荷
生物
医学与信息工程学院
日本长浜生物科学与技术大学生命科学部
出处
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2009年第3期380-384,共5页
基金
2008年国家大学生创新实验计划支持项目
文摘
从基于网络平台的宏基因组数据库入手,通过使用ARSA查询功能确定具有高产核黄素功能蛋白质,并利用BLAST、Orf Finder以及FASTA程序对其相关序列进行筛选和比对,得到一些具有潜在应用价值的基因片段。通过进一步确定这些替代基因的物种来源和物缘关系,筛查出在马尾藻海、巴拿马运河以及加拉帕格斯群岛附近海域存在的一些海洋螺菌属和聚球藻属的微生物。这些微生物的基因组中存在具有高产核黄素能力的基因片段,可望为改进国内现有的核黄素生产技术提供线索。
关键词
宏基因组
核黄素
rib操纵子
基因
筛选
Keywords
metagenome
riboflavin
rib - operon
gene
screening
分类号
Q563.2 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用宏基因组数据筛选高产核黄素的基因片段
赵越
王晖
鲍楠
池村淑道
李岭
《黑龙江大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2009
2
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