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基于细胞焦亡基因前列腺癌预后模型的构建及肿瘤微环境分析
1
作者
邵波
万水
+3 位作者
田申
马园园
陈丹霞
杜沂宸
《癌症进展》
2024年第2期176-182,共7页
目的基于细胞焦亡基因构建前列腺癌(PCa)预后模型并分析其肿瘤微环境。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取502例PCa患者和51例健康者的基因转录组数据、基因突变数据,提取差异表达的细胞焦亡基因。从基因表达综合(GEO)数据库中获...
目的基于细胞焦亡基因构建前列腺癌(PCa)预后模型并分析其肿瘤微环境。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取502例PCa患者和51例健康者的基因转录组数据、基因突变数据,提取差异表达的细胞焦亡基因。从基因表达综合(GEO)数据库中获取96例PCa患者的临床特征及细胞焦亡基因表达数据,筛选出与预后相关的细胞焦亡基因。从ImmPort数据库中下载免疫细胞数据。采用聚类分析确定PCa患者的最佳亚型分组并采用主成分分析(PCA)进行验证。对不同亚型PCa患者的差异交集基因进行基因本位(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。将单因素Cox分析获得的显著差异表达基因纳入Lasso回归模型,获取与预后相关的基因。将PCa患者随机均等分为训练集和测试集,分别进行Lasso回归分析,根据训练集风险评分的中位值将训练集、测试集分为高风险组和低风险组。采用多因素Cox回归模型分析PCa患者预后的独立影响因素并构建预后模型。应用R语言包分析细胞焦亡基因与免疫细胞含量、干细胞含量与风险评分的相关性及高低风险组患者的肿瘤突变负荷差异。结果差异分析获得37个显著差异表达的细胞焦亡基因。根据细胞焦亡基因的表达量及临床数据分析,获得10个与PCa预后相关的细胞焦亡基因。根据累积分布函数图的K值将PCa分为A、B、C三个亚型,且经PCA分析验证分型结果可靠。GO及KEGG富集分析结果显示,109个差异交集基因主要通过细胞外基质组织(EMO)、细胞外结构组织(ESO)、肽基酪氨酸磷酸化(PTP)、肽基酪氨酸修饰(PTM)等通路激活蛋白酪氨酸激酶(PTK)、跨膜受体蛋白激酶(TRPK)等分子功能。Lasso回归模型筛选出B细胞淋巴瘤/白血病3(BCL3)、骨形成蛋白2(BMP2)、C-C趋化因子受体5(CCR5)、几丁质酶3样蛋白2(CHI3L2)、肝癌缺失蛋白1(DLC1)、主要组织相容性复合体Ⅱ类DQ alpha 2(HLA-DQA2)、分泌球蛋白家族3A成员1(SCGB3A1)、serpin家族E成员1(SERPINE1)、溶质载体家族14成员1(SLC14A1)9个与预后相关的基因。差异分析显示,训练集与测试集预后情况大致相同,且随着风险评分的升高,患者死亡人数增加。多因素Cox分析结果显示,年龄、肿瘤分期(T分期、N分期)、风险程度均是PCa患者预后的独立影响因素。预后模型预测PCa患者第6、9、12年的生存情况与患者的实际生存情况比较相符。相关性分析显示,免疫细胞与细胞焦亡基因存在相关性(P﹤0.01)。对高风险组(n=376)与低风险组(n=126)进行差异分析,结果显示,高风险组患者的基质细胞评分和肿瘤突变负荷均明显高于低风险组,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。干细胞含量与风险评分呈正相关(P﹤0.01)。结论本文成功构建了基于细胞焦亡基因的PCa预后模型,并进行了肿瘤微环境分析,发现了BCL3、BMP2、CCR5、CHI3L2、DLC1、HLA-DQA2、SCGB3A1、SERPINE1、SLC14A19个细胞焦亡基因,可预测PCa患者的预后和免疫治疗反应,有利于进一步指导临床实践。
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关键词
细胞焦亡基因
前列腺癌
预后模型
肿瘤微环境
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职称材料
基于多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗慢性前列腺炎的临床疗效
被引量:
4
2
作者
张春和
王耀武
+6 位作者
孙萍萍
张鹤云
周成刚
赵恒太
李家高
郭付祥
白强民
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期831-836,共6页
目的:采用多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗湿热瘀滞证型慢性前列腺炎(CP)的临床疗效,以期为临床应用提供依据。方法:纳入1352例CP患者,在其常规治疗的基础上服用龙金通淋胶囊治疗,一次3粒,一日3次,饭后30 min口服,4周为1个疗...
目的:采用多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗湿热瘀滞证型慢性前列腺炎(CP)的临床疗效,以期为临床应用提供依据。方法:纳入1352例CP患者,在其常规治疗的基础上服用龙金通淋胶囊治疗,一次3粒,一日3次,饭后30 min口服,4周为1个疗程,观察治疗2个疗程。分析治疗前后NIH-CPSI评分(包括疼痛症状评分、排尿症状评分及生活质量评分),治疗前后中医证候分级量化积分情况及单项症状积分变化情况,并观察不良反应。结果:治疗后总有效率为93.64%,其中治疗前后NIH-CPSI评分分别为(24.27±6.04)、(8.17±4.21)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);疼痛症状治疗前后评分分别为(9.63±3.65)、(3.02±2.23)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);排尿症状治疗前后评分分别为(5.65±2.15)、(1.62±1.36)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);生活质量治疗前后评分分别为(8.96±2.32)、(3.16±1.89)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05)。另外,中医证候治疗后较治疗前得到明显改善,总有效率达94.67%,单项症状总有效率在82.4%~95.9%,其中,尿频(95.9%)、尿痛(90.4%)、小便短赤(91.4%)症状治疗后较治疗前显著改善。结论:龙金通淋胶囊联合常规治疗能够显著改善湿热瘀滞证CP患者的临床症状,尤其在治疗尿频、尿痛、小便短赤症状方面效果明显。同时该药对改善湿热瘀滞证CP患者的生活质量方面具有一定的优势。
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关键词
慢性前列腺炎
湿热瘀滞证
龙金通淋胶囊
真实世界研究
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职称材料
题名
基于细胞焦亡基因前列腺癌预后模型的构建及肿瘤微环境分析
1
作者
邵波
万水
田申
马园园
陈丹霞
杜沂宸
机构
昭通市中医医院泌尿外科
芜湖市
中医医院
泌
尿
外科
芜湖市
中医医院
皮肤科
芜湖市
中医医院
肛肠科
出处
《癌症进展》
2024年第2期176-182,共7页
基金
芜湖市科技计划项目(2021cg07,2022cg37)
云南中医药大学校院联合基金项目(XYLH202352)。
文摘
目的基于细胞焦亡基因构建前列腺癌(PCa)预后模型并分析其肿瘤微环境。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取502例PCa患者和51例健康者的基因转录组数据、基因突变数据,提取差异表达的细胞焦亡基因。从基因表达综合(GEO)数据库中获取96例PCa患者的临床特征及细胞焦亡基因表达数据,筛选出与预后相关的细胞焦亡基因。从ImmPort数据库中下载免疫细胞数据。采用聚类分析确定PCa患者的最佳亚型分组并采用主成分分析(PCA)进行验证。对不同亚型PCa患者的差异交集基因进行基因本位(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。将单因素Cox分析获得的显著差异表达基因纳入Lasso回归模型,获取与预后相关的基因。将PCa患者随机均等分为训练集和测试集,分别进行Lasso回归分析,根据训练集风险评分的中位值将训练集、测试集分为高风险组和低风险组。采用多因素Cox回归模型分析PCa患者预后的独立影响因素并构建预后模型。应用R语言包分析细胞焦亡基因与免疫细胞含量、干细胞含量与风险评分的相关性及高低风险组患者的肿瘤突变负荷差异。结果差异分析获得37个显著差异表达的细胞焦亡基因。根据细胞焦亡基因的表达量及临床数据分析,获得10个与PCa预后相关的细胞焦亡基因。根据累积分布函数图的K值将PCa分为A、B、C三个亚型,且经PCA分析验证分型结果可靠。GO及KEGG富集分析结果显示,109个差异交集基因主要通过细胞外基质组织(EMO)、细胞外结构组织(ESO)、肽基酪氨酸磷酸化(PTP)、肽基酪氨酸修饰(PTM)等通路激活蛋白酪氨酸激酶(PTK)、跨膜受体蛋白激酶(TRPK)等分子功能。Lasso回归模型筛选出B细胞淋巴瘤/白血病3(BCL3)、骨形成蛋白2(BMP2)、C-C趋化因子受体5(CCR5)、几丁质酶3样蛋白2(CHI3L2)、肝癌缺失蛋白1(DLC1)、主要组织相容性复合体Ⅱ类DQ alpha 2(HLA-DQA2)、分泌球蛋白家族3A成员1(SCGB3A1)、serpin家族E成员1(SERPINE1)、溶质载体家族14成员1(SLC14A1)9个与预后相关的基因。差异分析显示,训练集与测试集预后情况大致相同,且随着风险评分的升高,患者死亡人数增加。多因素Cox分析结果显示,年龄、肿瘤分期(T分期、N分期)、风险程度均是PCa患者预后的独立影响因素。预后模型预测PCa患者第6、9、12年的生存情况与患者的实际生存情况比较相符。相关性分析显示,免疫细胞与细胞焦亡基因存在相关性(P﹤0.01)。对高风险组(n=376)与低风险组(n=126)进行差异分析,结果显示,高风险组患者的基质细胞评分和肿瘤突变负荷均明显高于低风险组,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。干细胞含量与风险评分呈正相关(P﹤0.01)。结论本文成功构建了基于细胞焦亡基因的PCa预后模型,并进行了肿瘤微环境分析,发现了BCL3、BMP2、CCR5、CHI3L2、DLC1、HLA-DQA2、SCGB3A1、SERPINE1、SLC14A19个细胞焦亡基因,可预测PCa患者的预后和免疫治疗反应,有利于进一步指导临床实践。
关键词
细胞焦亡基因
前列腺癌
预后模型
肿瘤微环境
Keywords
pyroptosis gene
prostate cancer
prognostic model
tumor microenvironment
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
基于多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗慢性前列腺炎的临床疗效
被引量:
4
2
作者
张春和
王耀武
孙萍萍
张鹤云
周成刚
赵恒太
李家高
郭付祥
白强民
机构
云南省
中医医院
/云南
中医
药大学第一附属
医院
男科
云南
中医
药大学第一临床医学院
昭通市中医医院泌尿外科
昆明市延安
医院
泌
尿
外科
昆明医科大学第一附属
医院
泌
尿
外
大理市第一人民
医院
泌
尿
外科
罗平县
中医
医
泌
尿
外科
腾冲市
中医医院
门诊部
曲靖市妇幼保健院
中医
科
出处
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期831-836,共6页
基金
云南省卫生科技计划项目(2017NS151)。
文摘
目的:采用多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗湿热瘀滞证型慢性前列腺炎(CP)的临床疗效,以期为临床应用提供依据。方法:纳入1352例CP患者,在其常规治疗的基础上服用龙金通淋胶囊治疗,一次3粒,一日3次,饭后30 min口服,4周为1个疗程,观察治疗2个疗程。分析治疗前后NIH-CPSI评分(包括疼痛症状评分、排尿症状评分及生活质量评分),治疗前后中医证候分级量化积分情况及单项症状积分变化情况,并观察不良反应。结果:治疗后总有效率为93.64%,其中治疗前后NIH-CPSI评分分别为(24.27±6.04)、(8.17±4.21)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);疼痛症状治疗前后评分分别为(9.63±3.65)、(3.02±2.23)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);排尿症状治疗前后评分分别为(5.65±2.15)、(1.62±1.36)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05);生活质量治疗前后评分分别为(8.96±2.32)、(3.16±1.89)分,且治疗后与治疗前相比差异具统计学意义(P<0.05)。另外,中医证候治疗后较治疗前得到明显改善,总有效率达94.67%,单项症状总有效率在82.4%~95.9%,其中,尿频(95.9%)、尿痛(90.4%)、小便短赤(91.4%)症状治疗后较治疗前显著改善。结论:龙金通淋胶囊联合常规治疗能够显著改善湿热瘀滞证CP患者的临床症状,尤其在治疗尿频、尿痛、小便短赤症状方面效果明显。同时该药对改善湿热瘀滞证CP患者的生活质量方面具有一定的优势。
关键词
慢性前列腺炎
湿热瘀滞证
龙金通淋胶囊
真实世界研究
Keywords
chronic prostatitis
damp-heat stasis syndrome
Longjintonglin Capsules
real-world study
分类号
R697.33 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于细胞焦亡基因前列腺癌预后模型的构建及肿瘤微环境分析
邵波
万水
田申
马园园
陈丹霞
杜沂宸
《癌症进展》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于多中心真实世界研究再评价龙金通淋胶囊治疗慢性前列腺炎的临床疗效
张春和
王耀武
孙萍萍
张鹤云
周成刚
赵恒太
李家高
郭付祥
白强民
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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