小桐子ACO1基因的克隆与表达分析

为探讨ACO1基因在小桐子抗逆中的作用,本研究基于小桐子最新注释的基因组数据库,首次克隆了小桐子ACO1基因的全长CDNA序列,命名为Jc ACO1,并对其功能结构域、系统进化、基因结构及器官和低温表达特性进行了分析。结果表明,克隆的Jc ACO1基因全长为1 022bp,编码319个氨基酸,预测分子量为36. 0kDa,等电点5. 5。序列比对表明,小桐子Jc ACO1在序列中部保守性较高,具有1个Pcbc superfamily保守结构域。进化树分析显示,小桐子Jc ACO1基因与毛果杨、橡胶树、木薯的同源性较高。qRT-PCR表达分析表明,小桐子幼苗Jc ACO1基因存在器官表达特异性,在叶与茎中表达量较高,而在根中表达量较低。另外,Jc ACO1基因在三种器官中都受低温诱导,低温胁迫24h时,基因在根与茎中表达量最大。说明Jc ACO1基因表达量升高,以响应小桐子的抗冷胁迫。