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全基因组关联分析显示基因ANXA8和C10orf11为影响肌少症的候选基因
1
作者
冉姝
何笑
+2 位作者
蒋自璇
刘宝林
邓红文
《上海理工大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期305-310,共6页
为了寻找与瘦体重(lean body mass,LBM)相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及易感基因,在1 000个不相关的白人中采用Affymetix 500K芯片扫描了500 000个SNPs,并进行全基因组关联分析(genome-wide associati...
为了寻找与瘦体重(lean body mass,LBM)相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及易感基因,在1 000个不相关的白人中采用Affymetix 500K芯片扫描了500 000个SNPs,并进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),显著结果在1 625个中国人样本和2 283个欧洲白人样本中进行验证,并将验证结果与研究结果进行荟萃分析。研究发现SNPsrs7905603,rs9416083,rs4409772,rs2894310与LBM关联,其中rs7905603位于基因ANXA8,其他3个SNPs位于基因C10orf11。荟萃分析得到的合并p值分别为2.08×10^-5,7.44×10^-6,6.73×10^-6,6.76×10^-6。ANXA8和C10orf11基因是影响LBM变异的候选基因,这对肌少症的认识提供了新的理论依据。
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关键词
肌少症
单核苷酸多态性
全基因组关联分析
瘦体重
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题名
全基因组关联分析显示基因ANXA8和C10orf11为影响肌少症的候选基因
1
作者
冉姝
何笑
蒋自璇
刘宝林
邓红文
机构
上海理工
大学
医疗器械与食品
学院
杜兰大学公共健康医学院
出处
《上海理工大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期305-310,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31571291)。
文摘
为了寻找与瘦体重(lean body mass,LBM)相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及易感基因,在1 000个不相关的白人中采用Affymetix 500K芯片扫描了500 000个SNPs,并进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),显著结果在1 625个中国人样本和2 283个欧洲白人样本中进行验证,并将验证结果与研究结果进行荟萃分析。研究发现SNPsrs7905603,rs9416083,rs4409772,rs2894310与LBM关联,其中rs7905603位于基因ANXA8,其他3个SNPs位于基因C10orf11。荟萃分析得到的合并p值分别为2.08×10^-5,7.44×10^-6,6.73×10^-6,6.76×10^-6。ANXA8和C10orf11基因是影响LBM变异的候选基因,这对肌少症的认识提供了新的理论依据。
关键词
肌少症
单核苷酸多态性
全基因组关联分析
瘦体重
Keywords
sarcopenia
single nucleotide polymorphisms(SNPs)
genome-wide association study(GWAS)
lean body mass(LBM)
分类号
S330.21 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全基因组关联分析显示基因ANXA8和C10orf11为影响肌少症的候选基因
冉姝
何笑
蒋自璇
刘宝林
邓红文
《上海理工大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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