流体剪切下软骨祖细胞的转录组响应分析

目的:探讨下颌髁突软骨祖细胞对流体剪切力的反应。方法:对体外培养的软骨祖细胞施以可致细胞退变的流体剪切力刺激,然后做第二代高通量RNA测序。使用DESeq2软件筛选差异基因,做基因本体(GO)功能富集分析、京都基因和基因百科全书(KEGG)通路富集分析及蛋白互相网络分析(PPI),对PPI筛选的核心基因进行qRT-PCR验证。结果:共得到1 996个差异表达基因,主要包括炎症反应及细胞周期相关分子。其中Acta1、Atf3、Ccl2、Il6、Nfkbia、Ret、Vcam1被鉴定为核心基因。结论:流体剪切力刺激通过作用于软骨祖细胞的炎症反应和细胞周期相关信号通路,影响软骨祖细胞功能。