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杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究
被引量:
16
1
作者
钱昕
于新芬
+3 位作者
赵敏
寇宇
李钧
周银燕
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期255-260,共6页
目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型(HPIV-3)的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0—11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本,共856份(男性553例,女性303例)。采用逆...
目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型(HPIV-3)的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0—11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本,共856份(男性553例,女性303例)。采用逆转录荧光定量PCR(qRT.PER)法检测HPIV-3,阳性样本用特异性引物扩增HN基因进行基因测序,将测序所得序列用ClustalX2.0软件进行比对,然后使用MEGA6.0软件,采用邻接法建立系统进化树。同时,用qRT-PCR法检测与其他呼吸道病原体的合并感染情况。采用x2检验比较不同特征患儿单一感染与合并感染情况。结果856例患儿中,HPIV-3阳性84例(9.6%)。男性患儿HPIV-3感染阳性率为10.0%(55/553),女性患儿阳性率为9.6%(29/303)(x2=0.03,P=0.860)。84例HPIV.3阳性病例的合并感染率为49%(41例),其中与鼻病毒合并感染检出率较高,为41%(17例);1岁以下患儿的合并感染率为54%(36/67),高于单一感染率【46%(31/67)](X2=4.78,P=0.029);单一感染患儿伴有肺炎症状占93%(37/40),高于合并感染组【76%(29/38)](x2=3.92,P=0.048)。同源性分析结果显示,56例患儿HPIV.3的HN基因编码区核苷酸和氨基酸序列一致性均较高,一致性分别为96.9%~100.0%和98.6%.100%。基于HN基因的进化树分析表明,杭州株均归属于c3亚群。结论杭州市婴幼儿的急性呼吸道感染与HPIV-3有关;HPIV-3HN基因型变异较小,但进化具有一定地域特征;与其他呼吸道病毒的合并感染率较高。
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关键词
副流感病毒3型
人
感染
遗传
原文传递
题名
杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究
被引量:
16
1
作者
钱昕
于新芬
赵敏
寇宇
李钧
周银燕
机构
杭州市
疾病预防控制中心微生物检验科
杭州市儿童医院监察室
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期255-260,共6页
基金
杭州市医学重点专病专科项目(20120533Q24)
文摘
目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型(HPIV-3)的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0—11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本,共856份(男性553例,女性303例)。采用逆转录荧光定量PCR(qRT.PER)法检测HPIV-3,阳性样本用特异性引物扩增HN基因进行基因测序,将测序所得序列用ClustalX2.0软件进行比对,然后使用MEGA6.0软件,采用邻接法建立系统进化树。同时,用qRT-PCR法检测与其他呼吸道病原体的合并感染情况。采用x2检验比较不同特征患儿单一感染与合并感染情况。结果856例患儿中,HPIV-3阳性84例(9.6%)。男性患儿HPIV-3感染阳性率为10.0%(55/553),女性患儿阳性率为9.6%(29/303)(x2=0.03,P=0.860)。84例HPIV.3阳性病例的合并感染率为49%(41例),其中与鼻病毒合并感染检出率较高,为41%(17例);1岁以下患儿的合并感染率为54%(36/67),高于单一感染率【46%(31/67)](X2=4.78,P=0.029);单一感染患儿伴有肺炎症状占93%(37/40),高于合并感染组【76%(29/38)](x2=3.92,P=0.048)。同源性分析结果显示,56例患儿HPIV.3的HN基因编码区核苷酸和氨基酸序列一致性均较高,一致性分别为96.9%~100.0%和98.6%.100%。基于HN基因的进化树分析表明,杭州株均归属于c3亚群。结论杭州市婴幼儿的急性呼吸道感染与HPIV-3有关;HPIV-3HN基因型变异较小,但进化具有一定地域特征;与其他呼吸道病毒的合并感染率较高。
关键词
副流感病毒3型
人
感染
遗传
Keywords
Parainfluenza virus 3, human
Infection
Heredity
分类号
R725.6 [医药卫生—儿科]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究
钱昕
于新芬
赵敏
寇宇
李钧
周银燕
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
16
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