目的了解杭州市新报告HIV-1感染者独特重组型(unique recombinant forms,URFs)毒株分子流行特征,为艾滋病防控提供理论支持。方法收集杭州市2019—2023年新确诊且未经抗病毒治疗HIV-1感染病例血样,通过逆转录和巢式PCR扩增HIV-1 pol区...目的了解杭州市新报告HIV-1感染者独特重组型(unique recombinant forms,URFs)毒株分子流行特征,为艾滋病防控提供理论支持。方法收集杭州市2019—2023年新确诊且未经抗病毒治疗HIV-1感染病例血样,通过逆转录和巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因并测序。通过系统进化树筛选URFs毒株,并对其进行重组分析。计算URFs序列间遗传距离并构建分子网络。使用校正群体耐药分析程序(Calibrated Populatin Resistance,CPR)分析传播性耐药突变。结果获得222条URFs毒株pol基因序列,占5.0%(222/4471),重组类型分别为CRF01_AE/CRF07_BC(60.4%,134/222)、CRF01_AE/C(11.7%,26/222)、CRF01_AE/B(9.5%,21/222)、CRF01_AE/B/C(8.1%,18/222)、B/C(7.6%,17/222)和CRF55_01B/CRF07_BC(2.7%,6/222)。78.8%(175/222)病例通过男男性行为(men who have sex with man,MSM)感染,MSM平均年龄(31.3±10.5)岁。2019—2023年URFs发现比例从4.0%(34/843)增加到7.4%(60/807)。在1.5%最适基因距离阈值下构建分子网络,入网率49.5%(110/222),鉴别出23个簇;发现1个含有39个病例的同性和异性混合活跃传播大簇,重组型为CRF01_AE/CRF07_BC,平均基因距离0.005。URFs传播性耐药发生率为3.2%(7/222)。结论杭州市新报告HIV-1感染者HIV-1 URFs主要在青壮年MSM中产生和传播,呈逐年递增趋势,存在需要重点关注和有效干预的活跃传播大簇,急需制定有效干预措施防止该簇继续扩张,同时应持续加强监测本市URFs的发生和传播,了解分子簇及耐药动态。展开更多
文摘目的了解杭州市新报告HIV-1感染者独特重组型(unique recombinant forms,URFs)毒株分子流行特征,为艾滋病防控提供理论支持。方法收集杭州市2019—2023年新确诊且未经抗病毒治疗HIV-1感染病例血样,通过逆转录和巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因并测序。通过系统进化树筛选URFs毒株,并对其进行重组分析。计算URFs序列间遗传距离并构建分子网络。使用校正群体耐药分析程序(Calibrated Populatin Resistance,CPR)分析传播性耐药突变。结果获得222条URFs毒株pol基因序列,占5.0%(222/4471),重组类型分别为CRF01_AE/CRF07_BC(60.4%,134/222)、CRF01_AE/C(11.7%,26/222)、CRF01_AE/B(9.5%,21/222)、CRF01_AE/B/C(8.1%,18/222)、B/C(7.6%,17/222)和CRF55_01B/CRF07_BC(2.7%,6/222)。78.8%(175/222)病例通过男男性行为(men who have sex with man,MSM)感染,MSM平均年龄(31.3±10.5)岁。2019—2023年URFs发现比例从4.0%(34/843)增加到7.4%(60/807)。在1.5%最适基因距离阈值下构建分子网络,入网率49.5%(110/222),鉴别出23个簇;发现1个含有39个病例的同性和异性混合活跃传播大簇,重组型为CRF01_AE/CRF07_BC,平均基因距离0.005。URFs传播性耐药发生率为3.2%(7/222)。结论杭州市新报告HIV-1感染者HIV-1 URFs主要在青壮年MSM中产生和传播,呈逐年递增趋势,存在需要重点关注和有效干预的活跃传播大簇,急需制定有效干预措施防止该簇继续扩张,同时应持续加强监测本市URFs的发生和传播,了解分子簇及耐药动态。