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2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析
被引量:
4
1
作者
章惠萍
易文晶
崔大伟
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2017年第4期306-309,共4页
目的通过分析东部沿海地区(江苏、浙江和上海)甲型H1N1流感病毒[A(H1N1)pdm09]的分子特征,为防控A(H1N1)pdm09流感提供科学依据。方法从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013~2016年分离的A(H1N1)pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素(HA)...
目的通过分析东部沿海地区(江苏、浙江和上海)甲型H1N1流感病毒[A(H1N1)pdm09]的分子特征,为防控A(H1N1)pdm09流感提供科学依据。方法从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013~2016年分离的A(H1N1)pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列。运用MEGA6.0软件分析HA和NA的分子特征、关键氨基酸位点和耐药位点的变异情况。结果进化树分析显示江浙沪地区A(H1N1)pdm09病毒株与WHO参考株的HA、NA基因序列差异较小,与WHO推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)间的同源性分别为97.0%~99.5%和97.9%~99.6%;与WHO推荐疫苗株A/South_Africa/3626/2013(H1N1)间的同源性分别为98.0%~99.8%和98.6%~99.9%。病毒氨基酸变异分析显示70株A(H1N1)pdm09病毒的HA蛋白均发生83位(P83S)、203位(S203T)和321位(I321V)突变,且2016年分离株出现A195V突变;HA的裂解位点未发生变异,仍为IQSR↓GLF;2013年有2株NA蛋白出现H275Y耐药位点的变异。结论 2013~2016年东部沿海地区A(H1N1)pdm09流感病毒的HA和NA蛋白与WHO推荐疫苗株具有高度同源性,关键的氨基酸位点发生变异与病毒的毒力及对药物的敏感性相关,因此我们要密切关注A(H1N1)pdm09病毒,防止其再次发生暴发。
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关键词
甲型H1N1流感病毒
分子特征
进化树
变异
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职称材料
题名
2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析
被引量:
4
1
作者
章惠萍
易文晶
崔大伟
机构
杭州市肿瘤医院杭州市第一人民医院吴山院区检验科
江苏大学医学院
检验
医学系
浙江大学医学院附属
第一
医院
检验
科
浙江省临床体外诊断技术重点实验室
出处
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2017年第4期306-309,共4页
基金
浙江省医药卫生科技项目(2015KYB149)
浙江省自然科学基金(LY16H200001)
浙江省教育厅项目(Y201534117)
文摘
目的通过分析东部沿海地区(江苏、浙江和上海)甲型H1N1流感病毒[A(H1N1)pdm09]的分子特征,为防控A(H1N1)pdm09流感提供科学依据。方法从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013~2016年分离的A(H1N1)pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列。运用MEGA6.0软件分析HA和NA的分子特征、关键氨基酸位点和耐药位点的变异情况。结果进化树分析显示江浙沪地区A(H1N1)pdm09病毒株与WHO参考株的HA、NA基因序列差异较小,与WHO推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)间的同源性分别为97.0%~99.5%和97.9%~99.6%;与WHO推荐疫苗株A/South_Africa/3626/2013(H1N1)间的同源性分别为98.0%~99.8%和98.6%~99.9%。病毒氨基酸变异分析显示70株A(H1N1)pdm09病毒的HA蛋白均发生83位(P83S)、203位(S203T)和321位(I321V)突变,且2016年分离株出现A195V突变;HA的裂解位点未发生变异,仍为IQSR↓GLF;2013年有2株NA蛋白出现H275Y耐药位点的变异。结论 2013~2016年东部沿海地区A(H1N1)pdm09流感病毒的HA和NA蛋白与WHO推荐疫苗株具有高度同源性,关键的氨基酸位点发生变异与病毒的毒力及对药物的敏感性相关,因此我们要密切关注A(H1N1)pdm09病毒,防止其再次发生暴发。
关键词
甲型H1N1流感病毒
分子特征
进化树
变异
Keywords
influenza A(H1N1) pdm09 virus
molecular characteristics
phylogenetic tree
variation
分类号
R512.5 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析
章惠萍
易文晶
崔大伟
《临床检验杂志》
CAS
CSCD
2017
4
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