浅谈“5M1E”分析法在NGS实验室管理中的应用

质量管理对NGS实验室非常重要。本文基于"5M1E"分析法对影响实验室检测结果的准确性和可靠性的多个因素进行了分析阐述。该套分析方法可以应用在日常质量管理中,包括人员资质培训、设备的验证标识、试剂耗材管理、检测样本管理、标准操作、环境布局控制和检测结果提升等方面。

“质量源于设计”在基因检测产品设计中的应用

“质量源于设计”的理念和原则在基因检测产品的研发起着非常重要的作用。文章基于“QbD”理念从目标产品质量、关键物质属性、关键工艺参数、风险分析、设计空间的构建、控制策略、持续改进等方面在基因检测产品方面的应用进行了分析阐述。

硝唑尼特改善西方饮食诱导的ApoE^(-/-)小鼠脂肪肝作用的代谢组学研究

硝唑尼特(nitazoxanide)是一种临床抗原虫药物,本课题组前期研究发现口服途径给予硝唑尼特可改善西方饮食(Westerndiet,WD)诱导的ApoE小鼠肝脏脂肪样变,尚待深入阐明其机制。本文通过非靶向代谢组学研究硝唑尼特对西方饮食诱导的ApoE^(-/-)小鼠肝脏代谢谱的影响,进而通过细胞水平实验研究其潜在机制。采用UPLC-MS联用法对小鼠的肝脏组织代谢物进行非靶向代谢组学研究;筛选差异代谢物,并对差异代谢物进行富集分析和通路分析;采用硝唑尼特的体内代谢产物替唑尼特处理肝细胞,在代谢组学发现的基础上研究硝唑尼特改善肝脏脂代谢异常的潜在机制。硝唑尼特改善西方饮食诱导的ApoE^(-/-)小鼠肝脏代谢紊乱,主要通过调控甘油磷脂代谢、D-谷氨酰胺和谷氨酸代谢、谷胱甘肽代谢和精氨酸生物合成。硝唑尼特的体内活性代谢产物替唑尼特(tizoxanide)增加HepG2细胞谷胱甘肽(glutathione,GSH)含量并促进谷氨酸半胱氨酸连接酶(glutamate-cysteine ligasecatalytic subunit,Gcl-c)和谷胱甘肽还原酶(glutathionereductase,Gsr)的mRNA表达;增加肝细胞胱硫醚β合酶(cystathionineβ-synthase,CBS)和磷脂酰乙醇胺N-甲基转移酶(phosphatidylethanolamineN-methyltransferase,PEMT)蛋白水平,抑制游离脂肪酸(free fattyacid,FFA)诱导的肝细胞脂质蓄积;替唑尼特可增加FFA刺激下HepG2细胞及小鼠原代肝细胞中S-腺苷同型半胱氨酸水解酶(S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase,SAHH)蛋白表达;替唑尼特提高HepG2细胞N-乙酰谷氨酸合酶(N-acetylglutamate synthase,Nags)和氨基甲酰磷酸合成酶1(carbamoylphosphate synthetase1,Cps1)mRNA表达水平。综上所述,硝唑尼特改善西方饮食诱导的ApoE^(-/-)小鼠肝脏脂肪样变的潜在机制包括增加CBS表达、提高肝细胞内谷胱甘肽含量,增加肝细胞PEMT蛋白水平,增加肝细胞Nags和Cps1的表达。