无创产前检测技术在胎儿性染色体非整倍体筛查中的应用价值

目的探讨无创产前检测(NIPT)技术在胎儿性染色体非整倍体(SCA)检测中的应用价值。方法对223例NIPT提示SCA高风险的孕妇的NIPT结果、介入性产前诊断结果、外周血核型检查结果及妊娠结局进行分析。以介入性产前诊断结果为标准,分析NIPT技术诊断SCA的阳性预测值(PPV)。结果223例SCA孕妇中,检出X染色体减少的孕妇比例最高(57.85%),其次是X染色体增加且有Y染色体(24.66%)、X染色体增加但无Y染色体(12.56%)的孕妇,检出Y染色体增加的孕妇比例最低(4.93%)。180例孕妇接受了进一步的介入性产前诊断,其中有66例确诊为SCA,NIPT的总PPV为36.67%,在X染色体减少病例中的PPV最低(19.81%),在Y染色体增加病例中的PPV最高(90.01%)。在66例确诊为SCA的孕妇中,有8例NIPT结果提示的性染色体异常类型和介入性产前诊断的性染色体异常类型不符,有3例孕妇自身存在性染色体异常。确诊为SCA的孕妇终止妊娠率为57.58%(38/66)。结论NIPT技术对SCA的产前筛查具有一定的价值,尤其是在性染色体三体病例中的PPV较高,但其在X染色体减少的病例中的检测准确性仍有待提高,孕妇自身的染色体异常可导致假阳性结果。

一个遗传性低镁血症继发低钙血症家系的TRPM6基因变异分析

目的对1例遗传性低镁血症继发低钙血症患儿的TRPM6基因进行变异分析,探讨其分子遗传学发病机制。方法应用Sanger测序法对患儿及父母的TRPM6基因进行变异分析。结果测序结果显示患儿TRPM6基因存在c.3311C>T(p.Pro1104Leu)纯合变异,其父母均为c.3311C>T(p.Pro1104Leu)杂合变异携带者。经查询相关数据库c.3311C>T变异为未报道过的新变异,蛋白功能分析软件预测其具有高致病风险。结论TRPM6基因c.3311C>T(p.Pro1104Leu)变异可能是患儿的致病原因,新变异的发现丰富了TRPM6基因变异谱。

14例眼皮肤白化病Ⅱ型患者P基因变异分析

目的对14例临床拟诊眼皮肤白化病(oculocutaneous albinism,OCA)患者及核心家系TYR及P基因进行变异分析,为家系的遗传咨询及产前诊断提供依据.方法应用直接测序的方法对患者及家系成员进行TYR及P基因变异检测,寻找可能的致病变异位点,对新发现的变异采用SIFT及PolyPhen-2生物信息学软件进行蛋白功能预测.结果测序结果显示TYR基因筛查均未检出变异,P基因共检出了9种变异类型,26个变异位点,分别为c.803-3C>G(7/26)、c.1327G>A(p.Val443Ile)(5/26)、c.632C>T(p.Pr0211Leu)(4/26)、c.1832T>C(p.Leu611Pro)(3/26)、c.1349C>A(p.Thr450Lys)(2/26)、c.2363C>T(p.Ser788Leu)(2/26)、c.2228C>T(p.Pr0743Leu)(1/26)、c.1525A>G(p.Thr509Ala)(1/26)、c.1349C>T(p.Thr450Met)(1/26),其中2个家系只检出1个杂合位点.c.2363C>T(p.Ser788Leu)、c.1832T>C(p.Leu611Pro)、c.1525A>G(p.Thr509Ala)3个变异位点未见报道,蛋白功能预测均为有害变异.结论本地区眼皮肤白化病以Ⅱ型为主,P基因以c.803-3C>G和c.1327G>A(p.Va1443Ile)变异最为常见,新变异的发现丰富了P基因的变异谱.

一个婴儿神经轴索营养不良家系的基因变异分析

目的对1个临床拟诊婴儿神经轴索营养不良(infantile neuroaxonal dystrophy,INAD)家系的患儿及父母进行基因变异分析,明确其致病原因为遗传咨询及产前诊断提供依据。方法应用高通量测序方法对患儿相关致病基因进行初步筛查,再通过直接测序对患儿及父母可疑致病基因进行验证,寻找可能的致病突变位点,采用SIFT及PolyPhen-2生物信息学软件对变异位点进行致病性预测。结果高通量测序筛查显示患儿PLA2G6基因第5和第16外显子存在可疑致病突变;Sanger测序结果显示患儿PLA2G6基因第5外显子c.668C>A(p.Pro223Gln)和第16外显子c.2266C>T(p.Gln756Ter)复合杂合变异,父亲携带c.668C>A杂合变异,母亲携带c.2266C>T杂合变异。c.668C>A变异导致PLA2G6基因编码的第223位脯氨酸被谷氨酰胺替代,为已报道的致病变异;c.2266C>T变异导致编译第756位谷氨酰胺的密码子变为终止密码,使肽链合成提前终止,该变异尚未见文献报道,蛋白功能预测为有害变异;患儿的复合杂合变异分别来自父母。结论PLA2G6基因第5外显子c.668C>A(p.Pro223Gln)和第16外显子c.2266C>T(p.Gln756Ter)变异可能是患儿的致病原因,新变异的发现丰富了PLA2G6基因变异谱。

一个原发性肉碱缺乏症家系的基因突变分析及产前诊断

目的分析1例原发性肉碱缺乏症(primary carnitine deficiency,PCD)患儿及其父母SLC22A5基因的突变类型,为其家系成员提供遗传咨询及产前诊断。方法采集患儿和父母的外周血样,提取基因组DNA,用PCR及Sanger测序对SLC22A5基因10个外显子的编码区及剪接区进行检测。患儿母亲于孕中期抽取羊水,分离羊水细胞进行SLC22A5基因的突变分析。结果患儿,男,10天,新生儿疾病筛查血液酯酰肉碱谱分析示游离肉碱偏低,尿有机酸分析未见异常,患儿母亲血游离肉碱谱筛查未见异常,高度怀疑原发性肉碱缺乏症。Sanger测序发现患儿SLC22A5基因存在已知致病突变c.1195C>T(p.Arg399Try)和未报道的变异c.517delC(p.Leu173Cysfs*3),父母双方均为携带者。其母第3胎羊水细胞SLC22A5基因未检出上述变异。胎儿出生后血液酰基肉碱谱正常,发育正常。结论通过家系SLC22A5基因分析,成功对下一胎进行了产前诊断。新突变的发现丰富了SLC22A5基因的突变谱。

三例戊二酸血症Ⅰ型患儿的临床特点及GCDH基因变异分析

目的 对3例临床拟诊为戊二酸血症I型(glutaric aciduria typeⅠ,GA-Ⅰ)的患儿的临床特点及GCDH基因进行变异分析,为其家系的遗传咨询及产前诊断提供依据.方法 应用直接测序法对患儿及家系成员进行GCDH基因变异检测.结果Sanger测序结果显示例1 GCDH基因存在c.532G>A(p.Gly178Arg)和c.655G>A(p.Ala219Thr)复合杂合变异,父亲携带c.532G>A(p.Gly178Arg)杂合变异,母亲携带c.655G>A(p.Ala219Thr)杂合变异;例2 GCDH基因存在c.532G>A(p.Gly178Arg)和c.1060 G>T(p.Gly354Cys)复合杂合变异,父亲携带c.532G>A(p.Gly178Arg)杂合变异,母亲携带c.1060G>T(p.Gly354Cys)杂合变异;例3 GCDH基因存在c.532G>A(p.Gly178Arg)纯合变异,父母均为c.532G>A(p.Gly178Arg)杂合变异携带者.因此3例患儿的变异均分别来自其父母.其中c.1060G>T变异为未报道过的新变异.结论 GCDH 基因变异为 3 例患儿的致病原因,新变异的发现丰富了 GCDH 基因变异谱.