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2013-2016年柳州市手足口病病原监测结果分析 被引量:6
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作者 余钧池 黄萍 陈柳军 《国际检验医学杂志》 CAS 2017年第17期2377-2379,共3页
目的掌握柳州市2013-2016年手足口病病原学流行特征及病原谱变化情况,为制定柳州市手足口病预防控制措施提供科学依据。方法收集柳州市2013-2016年医院和县级疾病预防控制中心送检的手足口病病例咽拭子、肛拭子及疱疹液标本,应用实时荧... 目的掌握柳州市2013-2016年手足口病病原学流行特征及病原谱变化情况,为制定柳州市手足口病预防控制措施提供科学依据。方法收集柳州市2013-2016年医院和县级疾病预防控制中心送检的手足口病病例咽拭子、肛拭子及疱疹液标本,应用实时荧光定量-聚合酶链反应(real-time PCR)技术对标本中的肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)及非EV71和CoxA16的其他肠道病毒(EV)进行核酸检测。结果 2013-2016年共收集临床诊断手足口病病例标本3 503份,实验室确诊EV阳性标本2 720份;2013-2016年柳州市每年手足口病主要病原体均有变化,除EV71和CoxA16外,还存在着较高比例的EV;手足口病发病有明显季节性,主要集中在每年3-9月;5岁以下儿童为主要发病的人群,其中1~3岁儿童发病最多,男性发病例数高于女性;EV71为引起重症及死亡手足口病的主要病原体,死亡病例未见CoxA16。结论 EV是引起柳州市2013-2016年手足口病流行的主要病原体,但每年病原谱在不断变化,EV71是引起重症及死亡手足口病的主要病原体。 展开更多
关键词 手足口病 病原监测 肠道病毒71型 柯萨奇病毒A组16型
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2014-2016年柳州市重症手足口病柯萨奇病毒A2型病毒株基因特征分析 被引量:7
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作者 黄萍 陈柳军 余钧池 《中国病毒病杂志》 CAS 2017年第2期120-123,共4页
目的了解2014-2016年柳州地区重症手足口病肠道病毒A2型病原基因的特征。方法收集2014年1月至2016年12月手足口病重症儿童样本176份,提取病毒核酸,采用实时荧光逆转录-聚合酶链反应筛选,获得阳性病毒株。采用RT-PCR法扩增病毒5′UTR-VP4... 目的了解2014-2016年柳州地区重症手足口病肠道病毒A2型病原基因的特征。方法收集2014年1月至2016年12月手足口病重症儿童样本176份,提取病毒核酸,采用实时荧光逆转录-聚合酶链反应筛选,获得阳性病毒株。采用RT-PCR法扩增病毒5′UTR-VP4-VP2区序列,PCR阳性扩增产物进行测序,经Blast比对确定病毒基因型,并与国内外代表株进行核苷酸同源性比较,构建系统进化树。结果本研究共检出41株非CV-A16、非EV-A71毒株,其中25株病毒株为CV-A2型(25/41,61.0%)。同源性比对及系统进化分析显示,25株CV-A2型病毒株之间核苷酸同源性为76.8%~99.9%,与原始株CVA2Fleetwood同源性为64.6%~80.5%。结论 2014-2016年柳州市儿童重症手足口病CV-A2病毒成为非CV-A16、非EV-A71型别的重要病原,CV-A2型与原始株遗传距离较远,CV-A2型之间同源性较高且分布集中,构成一个独立的进化分支。需加强对CV-A2型肠道病毒株的持续监测和分子特征分析。 展开更多
关键词 重症手足口病 柯萨奇病毒A2 进化关系 基因型
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2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析 被引量:2
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作者 黎明强 黄萍 +3 位作者 陈柳军 余钧池 刘鑫 冯献湘 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期781-784,共4页
目的了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布、流行毒株情况。方法从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩... 目的了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布、流行毒株情况。方法从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序。合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树。结果得到合格的gag基因片段98条序列。来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株(circulate recombinant forms,CRFs)的重组亚型CRF01_AE占95.9%(94/98),异性传播比例为79.8%(75/94);重组亚型CRF07_BC占4.1%(4/98)。样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0%,100.0%,两两之间传播途径不同。结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01_AE为主。柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延。利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证。 展开更多
关键词 HIV-1 基因 gag 获得性免疫缺陷综合征
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柳州市2016年流感暴发流行期H3N2流感病毒血凝素基因特征分析
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作者 余钧池 黄萍 陈柳军 《中华传染病杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期429-432,共4页
H3N2流感病毒自1968年第1次引起流感大流行以来,一直在人群中呈现季节性流行并不断发生变异,因此,世界各国均对其进行监测分析。柳州市CDC微生物检验科自2009年加入国家流感监测网络实验室以来,一直对柳州市的流感病毒进行监测,据... H3N2流感病毒自1968年第1次引起流感大流行以来,一直在人群中呈现季节性流行并不断发生变异,因此,世界各国均对其进行监测分析。柳州市CDC微生物检验科自2009年加入国家流感监测网络实验室以来,一直对柳州市的流感病毒进行监测,据监测数据显示,柳州市每年均有H3N2流感病毒流行,并间隔一段时间就有一次不同规模的疫情发生。 展开更多
关键词 流感病毒血凝素 H3N2 柳州市 基因特征 流感暴发 流行期 监测分析 流感大流行
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广东省和广西壮族自治区部分地区2014—2016年宋内志贺菌病原学特征分析 被引量:5
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作者 李柏生 陈柳军 +7 位作者 柯碧霞 林洁敏 徐励琴 谭海玲 何冬梅 梁宇恒 柯昌文 张永慧 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1541-1545,共5页
目的 了解2014-2016年广东省和广西壮族自治区部分地区宋内志贺菌暴发分离株及散发分离株的病原学特征.方法 对2014-2016年广东省和广西壮族自治区柳州市分离的14株宋内志贺菌暴发菌株和6株散发菌株进行抗生素敏感性试验和PFGE分析,并... 目的 了解2014-2016年广东省和广西壮族自治区部分地区宋内志贺菌暴发分离株及散发分离株的病原学特征.方法 对2014-2016年广东省和广西壮族自治区柳州市分离的14株宋内志贺菌暴发菌株和6株散发菌株进行抗生素敏感性试验和PFGE分析,并选择其中6株代表菌株进行全基因组测序,与NCBI上获取的51株国内外宋内志贺菌的基因组进行遗传进化分析.结果 抗生素敏感性检测结果显示,试验菌株对氨苄西林、四环素、庆大霉素、复方新诺明和萘啶酸有较高的耐药性,对阿奇霉素、氯霉素和亚胺培南完全敏感.PFGE分子分型显示,不同地区不同来源的分离株之间PFGE指纹图谱有很高的相似度(93.2%),基于全基因组的遗传进化分析显示,广东省和广西壮族自治区柳州市的宋内志贺菌分离株同处在一个进化分支上,与来自韩国的菌株亲缘关系最为接近.结论 广东省和广西壮族自治区部分地区分离的宋内志贺菌对常用抗生素具有较高的耐药性,对阿奇霉素、氯霉素和亚胺培南有较高的敏感性.试验菌株之间具有相似的PFGE指纹图谱,遗传进化关系相近. 展开更多
关键词 宋内志贺菌 病原学特征 脉冲场凝胶电泳 全基因组测序
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