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基于生物信息学分析LIX1基因在前列腺癌中的表达与免疫浸润的关系
1
作者
黎金连
周青鸟
+1 位作者
林军
吴群英
《临床医学进展》
2023年第1期152-162,共11页
目的:探讨肢体和中枢神经系统表达因子1 (Limb and CNS expressed 1, LIX1)在前列腺癌(prostate cancer, PCa)中的表达及临床意义。方法:利用Oncomine和UALCAN数据库分析LIX1在PCa组织中的表达;利用R3.6.3软件绘制受试者工作特征曲线(Re...
目的:探讨肢体和中枢神经系统表达因子1 (Limb and CNS expressed 1, LIX1)在前列腺癌(prostate cancer, PCa)中的表达及临床意义。方法:利用Oncomine和UALCAN数据库分析LIX1在PCa组织中的表达;利用R3.6.3软件绘制受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic curve,ROC曲线)和临床基线表,分析LIX1表达与PCa患者临床特征参数的关系;应用CANCERTOOL、GEPIA和TIMEER数据库分析LIX1表达水平与PCa患者预后及其与免疫细胞浸润的关系。利用LinkedOmics数据库筛选LIX1共表达基因及进行GSEA分析,探讨LIX1在PCa中潜在作用的信号通路。结果:LIX1 mRNA在PCa组织中表达水平显著降低且对PCa的诊断具有一定准确性。LIX1表达水平与PCa患者的TNM分期、Gleason分期、年龄和PSA水平显著负相关。LIX1低表达患者预后不佳,具有更高的复发风险。LIX1表达水平与PCa巨噬细胞的浸润水平呈正相关。LIX1及其共表达的基因主要富集在线粒体呼吸链复合物的组装,胞质分裂,核糖体和细胞周期途径等信号通路。结论:LIX1在PCa中表达降低,且与免疫浸润有关,可作为PCa诊断和不良预后的新型标志物。
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关键词
LIX1
前列腺癌
预后标记物
TCGA数据库
免疫浸润
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职称材料
题名
基于生物信息学分析LIX1基因在前列腺癌中的表达与免疫浸润的关系
1
作者
黎金连
周青鸟
林军
吴群英
机构
桂林医学院智能医学与生物技术学院遗传教研室
南宁中心血站
广西医科大学基础
医学院
生物
化学与分子
生物
学
教研室
出处
《临床医学进展》
2023年第1期152-162,共11页
文摘
目的:探讨肢体和中枢神经系统表达因子1 (Limb and CNS expressed 1, LIX1)在前列腺癌(prostate cancer, PCa)中的表达及临床意义。方法:利用Oncomine和UALCAN数据库分析LIX1在PCa组织中的表达;利用R3.6.3软件绘制受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic curve,ROC曲线)和临床基线表,分析LIX1表达与PCa患者临床特征参数的关系;应用CANCERTOOL、GEPIA和TIMEER数据库分析LIX1表达水平与PCa患者预后及其与免疫细胞浸润的关系。利用LinkedOmics数据库筛选LIX1共表达基因及进行GSEA分析,探讨LIX1在PCa中潜在作用的信号通路。结果:LIX1 mRNA在PCa组织中表达水平显著降低且对PCa的诊断具有一定准确性。LIX1表达水平与PCa患者的TNM分期、Gleason分期、年龄和PSA水平显著负相关。LIX1低表达患者预后不佳,具有更高的复发风险。LIX1表达水平与PCa巨噬细胞的浸润水平呈正相关。LIX1及其共表达的基因主要富集在线粒体呼吸链复合物的组装,胞质分裂,核糖体和细胞周期途径等信号通路。结论:LIX1在PCa中表达降低,且与免疫浸润有关,可作为PCa诊断和不良预后的新型标志物。
关键词
LIX1
前列腺癌
预后标记物
TCGA数据库
免疫浸润
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析LIX1基因在前列腺癌中的表达与免疫浸润的关系
黎金连
周青鸟
林军
吴群英
《临床医学进展》
2023
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