基于生物信息学筛选胃癌预后相关lncRNAs

目的探讨胃癌预后相关lncRNAs,并构建胃癌预后相关lncRNAs风险模型。方法应用TCGA数据库下载胃癌数据集中lncRNAs表达谱及样本临床信息,首先采用单因素Cox回归筛选胃癌相关预后lncRNAs,其次用筛选后的lncRNAs进行Lasso预后风险模型的构建,Kaplan-Meier生存曲线对lncRNAs进行胃癌预后生存影响的评估,多因素Cox分析明确lncRNAs风险模型为胃癌预后的独立性因素,ROC曲线用来评估lncRNAs预后风险模型的预测准确率。结果筛选出14个胃癌预后相关的关键lncRNAs并构建风险模型,14-lncRNA风险模型可作为影响胃癌患者不良预后的独立性因素[HR 1.21(95%CI:1.05~1.40,P=0.011)];此外,训练集和测试集3年及5年生存期的ROC曲线AUC最大值分别为:0.743、0.837、0.868及0.993,表明14-lncRNA风险模型对胃癌的预后的判定敏感性及特异性均较高。结论构建的14-lncRNA风险模型可对胃癌患者的预后进行有效的判定,14个lncRNAs作为胃癌预后标志物具有重要的临床应用价值。