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基于三代测序技术的植物信号通路相关基因在胡杨异形叶发生中的功能分析
1
作者
秦少伟
闫伟伟
+4 位作者
李才林
吴海柱
何志贵
邱欣
赵利峰
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第20期6688-6697,共10页
胡杨异形叶发生的分子机制目前仍不清楚。为了探究胡杨不同叶形的发生机制,本研究利用三代测序(TGS)结合二代测序技术,完善了胡杨的转录组数据,建立了胡杨条形叶、披针形叶、卵圆形叶和宽卵形叶的基因表达谱,并进一步分析了胡杨异形叶...
胡杨异形叶发生的分子机制目前仍不清楚。为了探究胡杨不同叶形的发生机制,本研究利用三代测序(TGS)结合二代测序技术,完善了胡杨的转录组数据,建立了胡杨条形叶、披针形叶、卵圆形叶和宽卵形叶的基因表达谱,并进一步分析了胡杨异形叶发生过程中植物信号通路相关基因的表达模式和作用。结果表明,胡杨叶组织中共有59004个mRNA,其中新发现的mRNA有9328个;根据胡杨中全部mRNA的表达趋势将其分为27种模式,其中两个模式(模式4和模式23)中总计4284个基因表达趋势与叶形指数变化完全一致或完全相反,是胡杨异形叶发生相关基因;胡杨异形叶发生相关基因中,参与脱落酸(ABA)信号通路的基因有9个、生长素(IAA)信号通路的有29个、细胞分裂素(CTK)信号通路的有10个、赤霉素(GA)信号通路的有3个,这些基因的功能和表达趋势表明,大多数促进这些信号通路的基因从条形叶到宽卵形叶表达量持续上调,大多数抑制这些信号通路的基因的表达量则持续下调。本研究结果表明,胡杨从条形叶到宽卵形叶的转变与ABA、IAA、CTK和GA信号通路的活跃程度增加密切相关,这些发现对揭示胡杨异形叶形成的分子机制和胡杨培育保护都有重要的意义。
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关键词
胡杨
异形叶
形态发生
分子机制
三代测序
植物信号通路
原文传递
题名
基于三代测序技术的植物信号通路相关基因在胡杨异形叶发生中的功能分析
1
作者
秦少伟
闫伟伟
李才林
吴海柱
何志贵
邱欣
赵利峰
机构
桂林
旅游
学院
休闲与健康
学院
桂林旅游学院食品科学与技术研究中心
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第20期6688-6697,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32160235)
广西省自然科学基金项目(2021GXNSFAA220090)
+3 种基金
桂林旅游学院高层次人才启动基金项目(KQ2001)
广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2022KY0824
2023KY0856
2023KY0857)共同资助
文摘
胡杨异形叶发生的分子机制目前仍不清楚。为了探究胡杨不同叶形的发生机制,本研究利用三代测序(TGS)结合二代测序技术,完善了胡杨的转录组数据,建立了胡杨条形叶、披针形叶、卵圆形叶和宽卵形叶的基因表达谱,并进一步分析了胡杨异形叶发生过程中植物信号通路相关基因的表达模式和作用。结果表明,胡杨叶组织中共有59004个mRNA,其中新发现的mRNA有9328个;根据胡杨中全部mRNA的表达趋势将其分为27种模式,其中两个模式(模式4和模式23)中总计4284个基因表达趋势与叶形指数变化完全一致或完全相反,是胡杨异形叶发生相关基因;胡杨异形叶发生相关基因中,参与脱落酸(ABA)信号通路的基因有9个、生长素(IAA)信号通路的有29个、细胞分裂素(CTK)信号通路的有10个、赤霉素(GA)信号通路的有3个,这些基因的功能和表达趋势表明,大多数促进这些信号通路的基因从条形叶到宽卵形叶表达量持续上调,大多数抑制这些信号通路的基因的表达量则持续下调。本研究结果表明,胡杨从条形叶到宽卵形叶的转变与ABA、IAA、CTK和GA信号通路的活跃程度增加密切相关,这些发现对揭示胡杨异形叶形成的分子机制和胡杨培育保护都有重要的意义。
关键词
胡杨
异形叶
形态发生
分子机制
三代测序
植物信号通路
Keywords
s Populus euphratica,Heterophyll
Morphogenesis
Molecular mechanism
Third-generation sequencing
Plant signaling pathway
分类号
S792.11 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于三代测序技术的植物信号通路相关基因在胡杨异形叶发生中的功能分析
秦少伟
闫伟伟
李才林
吴海柱
何志贵
邱欣
赵利峰
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023
0
原文传递
已选择
0
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参考文献
引证文献
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