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酿酒葡萄LOX基因家族成员鉴定及冷胁迫下的表达分析
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作者 李洋 胡焕平 +4 位作者 王岩峰 李茂峰 张井刚 刘凯 王红霞 《中外葡萄与葡萄酒》 北大核心 2024年第6期10-18,共9页
脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员... 脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)是被多种逆境激活后的转录产物,在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫方面具有重要作用。为了解酿酒葡萄LOX家族成员结构特征及冷胁迫下的表达,本研究利用生物信息学技术从酿酒葡萄基因组数据库中挖掘LOX家族成员,分析其理化性质、基因结构、保守基序、启动子结合元件、蛋白互作等结构特征,进一步分析其表达。结果表明,酿酒葡萄LOX家族共10个成员,开放阅读框540~2763 bp,编码10条蛋白质序列,编码氨基酸179~920个,等电点在5.60~8.25;对酿酒葡萄、拟南芥、番茄和水稻LOX家族蛋白进行了系统发育分析,结果发现,酿酒葡萄分为13-LOX和9-LOX两个亚组;qPCR分析结果显示,10个基因均可以被冷胁迫诱导表达,在不同组织出现特异性表达。本研究结果将为阐明LOX家族生物学功能提供理论依据。 展开更多
关键词 酿酒葡萄 脂氧合酶 生物信息分析 逆境胁迫
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关于鲁北地区林业产业对盐碱地改良的研究
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作者 李翔宇 范旭东 《生态与资源》 2024年第3期0077-0079,共3页
文章旨在探讨鲁北地区林业产业对盐碱地改良的实证研究,通过对该地区盐碱地概况、林业产业发展现状以及影响林业产业对盐碱地改良的因素进行分析。研究结果表明,林业产业对鲁北地区盐碱地改良效果显著,为盐碱地修复提供了可行的途径。
关键词 林业产业 盐碱地改良 鲁北地区 植物修复
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核桃JrbHLH转录因子家族鉴定与响应冷胁迫基因表达分析 被引量:1
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作者 刘凯 李洋 +4 位作者 张强 王红霞 张井刚 何富强 陈春晴 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期50-62,共13页
为了探究核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用,本研究通过转录组数据结合隐马尔可夫模型筛选技术在核桃全基因组挖掘出bHLH转录因子家族成员并进行结构分析,进一步对该家族成员响应冷胁迫的差异表达基因进行冷胁迫不同时间与... 为了探究核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用,本研究通过转录组数据结合隐马尔可夫模型筛选技术在核桃全基因组挖掘出bHLH转录因子家族成员并进行结构分析,进一步对该家族成员响应冷胁迫的差异表达基因进行冷胁迫不同时间与不同组织中的表转录水平分析。结果表明,核桃bHLH转录因子家族包含72个基因,编码72条蛋白,开放阅读框为393-1839 bp,编码的蛋白长度为130-612个氨基酸,等电点为4.61-9.51,均为亲水性蛋白;各成员均含有典型的碱性区域和螺旋-环-螺旋结构域;与拟南芥同家族聚类分析发现,核桃bHLH家族成员可分布到15个亚群,且同源性较高。结合转录组数据筛选到16个响应冷胁迫的差异表达基因,在冷胁迫不同时间后出现不同程度响应,并且在不同组织中存在特异性表达。本研究将为核桃bHLH转录因子家族在响应冷胁迫过程中的作用研究奠定基础。 展开更多
关键词 核桃 冷胁迫 bHLH转录因子家族 表达分析
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