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薄壳山核桃SCAR标记开发及其在品种间的多态性
被引量:
3
1
作者
彭华正
金群英
+2 位作者
汪琳悦
叶华琳
朱汤军
《经济林研究》
北大核心
2021年第1期1-8,59,共9页
【目的】获得品种间具有多态性且稳定可靠的序列特异性标记,用于薄壳山核桃杂交育种中的分子鉴定。【方法】选取5个性状差异较大的品种Van Deman、Moore、Nacono、Davis和Pawnee,提取高质量基因组DNA,经合适的限制性内切酶酶切后分别构...
【目的】获得品种间具有多态性且稳定可靠的序列特异性标记,用于薄壳山核桃杂交育种中的分子鉴定。【方法】选取5个性状差异较大的品种Van Deman、Moore、Nacono、Davis和Pawnee,提取高质量基因组DNA,经合适的限制性内切酶酶切后分别构建文库,利用Illumina HiSeq高通量测序仪获得每种样品的简化基因组数据。再进行序列与基因库的比对和各品种间的差异片段比对,获得差异片段和位点,设计适合特异性片段扩增的PCR引物。然后通过试验筛选这些引物,并进行多个品种的多态性分析。【结果】5个品种的基因组DNA经简化基因组测序后,共获得25963442个reads,合计3816.62 Mb碱基,其(A+T)/(C+G)的值约为1.63,长度质量指标Q20%大于95%,Q30%大于90%。经初步组装、精确组装和品种序列差异比对后,共获得特异序列3916条,在差异位点上设计3893对引物,然后进一步分析引物扩增可靠性,包括二级结构、碱基比例等,挑选其中1133对引物,再根据理论扩增产物与核桃基因组的同源性,挑选出扩增产物同源性最高的候选引物473对,占可用引物数量的40%。利用PCR技术,测试这473对引物在23个山核桃品种中的多态性差异,最终获得能产生多态性位点的86对引物,占被筛选引物对1/5左右。将其中80对单一条带用于品种鉴定和亲缘关系分析。利用这些引物对的组合,可以将其中17个品种鉴定出来。基于这些多态性片段进行的亲缘关系分析结果表明,聚类结果与实际的亲缘关系有部分一致性,如揭示了Choctaw与Dependable、Moore与barton之间的亲缘关系。【结论】利用简化基因组测序方法可以挖掘出薄壳山核桃品种的序列特异性分子标记,运用这些标记引物的组合可以进行大量品种的鉴定。所开发的80对引物可用于山核桃杂交育种中亲本组合的选择。
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关键词
薄壳山核桃
简化基因组测序
SCAR标记
亲缘关系分析
品种鉴定
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职称材料
‘马罕’单株果实及子代性状分析
2
作者
黄国帅
朱汤军
+4 位作者
沈建军
彭华正
金群英
吴超群
叶华琳
《浙江林业科技》
2018年第5期1-6,共6页
2011年10月在浙江省桐庐县美国山核桃Carya illinoensis种质资源园内采集9个单株的9年生‘马罕’C.illinoensis ‘Mahan’果实,测定坚果质量、果长和果径。2012年1月播种育苗,2015年1月对每株苗的苗高和地径进行测量,2018年1月再次测量...
2011年10月在浙江省桐庐县美国山核桃Carya illinoensis种质资源园内采集9个单株的9年生‘马罕’C.illinoensis ‘Mahan’果实,测定坚果质量、果长和果径。2012年1月播种育苗,2015年1月对每株苗的苗高和地径进行测量,2018年1月再次测量。结果表明,‘马罕’果实性状在不同单株间具有极显著差异(P<0.01);变异幅度最大的是坚果质量,平均变异系数23.91%。不同单株子代间,3年生苗苗高与地径都表现出极显著差异(P<0.01),高径比为显著差异(P<0.05),各子代平均苗高45.95~78.67 cm,平均地径5.75~9.30 mm,平均高径比6.95~8.88;相关分析表明苗高、地径的生长量与其坚果质量显著相关(P<0.05),相关系数分别达到0.63,0.71。6年生苗子代间苗高、地径和高径比均未表现出显著性差异(P>0.05)。综合分析认为,‘马罕’果实性状分化较大,其坚果质量与子代苗木的生长在3年生时显著相关(P<0.05),而在6年生时无显著性差异(P>0.05),其坚果质量对其影响会逐渐减小。
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关键词
'马罕'
果实
苗木
变异
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职称材料
无花果功能咀嚼片的制备工艺研究
被引量:
13
3
作者
冯爱博
郑光耀
+3 位作者
程俊文
王衍彬
刘于
贺亮
《食品工业》
CAS
北大核心
2019年第2期34-38,共5页
以无花果为主要原料,采用亚临界水技术,一次性提取无花果中的大量多糖、黄酮,和少量补骨脂素、佛手柑内酯,采用粉末直接压片技术,选取片质量差异、崩解时限、硬度、脆碎度的综合评定值为评价指标,通过响应面法确定无花果咀嚼片最佳配方...
以无花果为主要原料,采用亚临界水技术,一次性提取无花果中的大量多糖、黄酮,和少量补骨脂素、佛手柑内酯,采用粉末直接压片技术,选取片质量差异、崩解时限、硬度、脆碎度的综合评定值为评价指标,通过响应面法确定无花果咀嚼片最佳配方。结果表明,无花果咀嚼片的最佳配方为:无花果多糖及黄酮用量60%、无花果粉末用量20%、木糖醇用量5%、玉米糊精用量3%及其他辅料用量12%。制成的咀嚼片表面光滑、色泽均一、硬度适中;研究通过辅助强制加料配合直接压片技术,对无花果咀嚼片的配方工艺进行研究,旨在为产品的功能营养价值提供一定理论支持。
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关键词
咀嚼片
亚临界水提
多糖
响应面分析法
原文传递
题名
薄壳山核桃SCAR标记开发及其在品种间的多态性
被引量:
3
1
作者
彭华正
金群英
汪琳悦
叶华琳
朱汤军
机构
浙江省
林业
科学研究院
森林食品资源利用与质量控制国家林业局重点实验室
出处
《经济林研究》
北大核心
2021年第1期1-8,59,共9页
基金
浙江省自然科学基金项目(LY17C150001,LY18C160003)。
文摘
【目的】获得品种间具有多态性且稳定可靠的序列特异性标记,用于薄壳山核桃杂交育种中的分子鉴定。【方法】选取5个性状差异较大的品种Van Deman、Moore、Nacono、Davis和Pawnee,提取高质量基因组DNA,经合适的限制性内切酶酶切后分别构建文库,利用Illumina HiSeq高通量测序仪获得每种样品的简化基因组数据。再进行序列与基因库的比对和各品种间的差异片段比对,获得差异片段和位点,设计适合特异性片段扩增的PCR引物。然后通过试验筛选这些引物,并进行多个品种的多态性分析。【结果】5个品种的基因组DNA经简化基因组测序后,共获得25963442个reads,合计3816.62 Mb碱基,其(A+T)/(C+G)的值约为1.63,长度质量指标Q20%大于95%,Q30%大于90%。经初步组装、精确组装和品种序列差异比对后,共获得特异序列3916条,在差异位点上设计3893对引物,然后进一步分析引物扩增可靠性,包括二级结构、碱基比例等,挑选其中1133对引物,再根据理论扩增产物与核桃基因组的同源性,挑选出扩增产物同源性最高的候选引物473对,占可用引物数量的40%。利用PCR技术,测试这473对引物在23个山核桃品种中的多态性差异,最终获得能产生多态性位点的86对引物,占被筛选引物对1/5左右。将其中80对单一条带用于品种鉴定和亲缘关系分析。利用这些引物对的组合,可以将其中17个品种鉴定出来。基于这些多态性片段进行的亲缘关系分析结果表明,聚类结果与实际的亲缘关系有部分一致性,如揭示了Choctaw与Dependable、Moore与barton之间的亲缘关系。【结论】利用简化基因组测序方法可以挖掘出薄壳山核桃品种的序列特异性分子标记,运用这些标记引物的组合可以进行大量品种的鉴定。所开发的80对引物可用于山核桃杂交育种中亲本组合的选择。
关键词
薄壳山核桃
简化基因组测序
SCAR标记
亲缘关系分析
品种鉴定
Keywords
Carya illinoinensis
reduced-representation genome sequencing
SCAR marker
relative analysis
cultivar identification
分类号
S664.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
‘马罕’单株果实及子代性状分析
2
作者
黄国帅
朱汤军
沈建军
彭华正
金群英
吴超群
叶华琳
机构
浙江农林大学
林业
与生物技术学院
浙江省
林业
科学研究院
森林食品资源利用与质量控制国家林业局重点实验室
浙江省龙游泰畅农林开发有限公司
出处
《浙江林业科技》
2018年第5期1-6,共6页
基金
浙江省重大育种专项(2016C02052-13)
浙江省院合作重大(2016SY04)
+2 种基金
浙江省基金(LY17C150001
Y18C160023)
浙江省属科研院所专项(2017F50004)
文摘
2011年10月在浙江省桐庐县美国山核桃Carya illinoensis种质资源园内采集9个单株的9年生‘马罕’C.illinoensis ‘Mahan’果实,测定坚果质量、果长和果径。2012年1月播种育苗,2015年1月对每株苗的苗高和地径进行测量,2018年1月再次测量。结果表明,‘马罕’果实性状在不同单株间具有极显著差异(P<0.01);变异幅度最大的是坚果质量,平均变异系数23.91%。不同单株子代间,3年生苗苗高与地径都表现出极显著差异(P<0.01),高径比为显著差异(P<0.05),各子代平均苗高45.95~78.67 cm,平均地径5.75~9.30 mm,平均高径比6.95~8.88;相关分析表明苗高、地径的生长量与其坚果质量显著相关(P<0.05),相关系数分别达到0.63,0.71。6年生苗子代间苗高、地径和高径比均未表现出显著性差异(P>0.05)。综合分析认为,‘马罕’果实性状分化较大,其坚果质量与子代苗木的生长在3年生时显著相关(P<0.05),而在6年生时无显著性差异(P>0.05),其坚果质量对其影响会逐渐减小。
关键词
'马罕'
果实
苗木
变异
Keywords
Carya illinoensis‘Mahan'
fruit
seedlings
variation
分类号
S664.1 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
无花果功能咀嚼片的制备工艺研究
被引量:
13
3
作者
冯爱博
郑光耀
程俊文
王衍彬
刘于
贺亮
机构
森林食品资源利用与质量控制国家林业局重点实验室
浙江省
森林
资源
生物与化学
利用
重点
实验室
浙江省
林业
科学研究院
森林
食品
所
中国
林业
科学研究院南京林产化学工业研究所
浙江大学生命科学学院
出处
《食品工业》
CAS
北大核心
2019年第2期34-38,共5页
基金
浙江省林业厅省院合作项目(2015SY03)
文摘
以无花果为主要原料,采用亚临界水技术,一次性提取无花果中的大量多糖、黄酮,和少量补骨脂素、佛手柑内酯,采用粉末直接压片技术,选取片质量差异、崩解时限、硬度、脆碎度的综合评定值为评价指标,通过响应面法确定无花果咀嚼片最佳配方。结果表明,无花果咀嚼片的最佳配方为:无花果多糖及黄酮用量60%、无花果粉末用量20%、木糖醇用量5%、玉米糊精用量3%及其他辅料用量12%。制成的咀嚼片表面光滑、色泽均一、硬度适中;研究通过辅助强制加料配合直接压片技术,对无花果咀嚼片的配方工艺进行研究,旨在为产品的功能营养价值提供一定理论支持。
关键词
咀嚼片
亚临界水提
多糖
响应面分析法
Keywords
chewable tablets
subcritical water extraction
polysaccharides
response surface analysis
分类号
TS218 [轻工技术与工程—粮食、油脂及植物蛋白工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
薄壳山核桃SCAR标记开发及其在品种间的多态性
彭华正
金群英
汪琳悦
叶华琳
朱汤军
《经济林研究》
北大核心
2021
3
下载PDF
职称材料
2
‘马罕’单株果实及子代性状分析
黄国帅
朱汤军
沈建军
彭华正
金群英
吴超群
叶华琳
《浙江林业科技》
2018
0
下载PDF
职称材料
3
无花果功能咀嚼片的制备工艺研究
冯爱博
郑光耀
程俊文
王衍彬
刘于
贺亮
《食品工业》
CAS
北大核心
2019
13
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