山茶属植物EST-SSR序列分析

研究通过SSR、EST-SSR分子标记技术对179种山茶属植物进行亲缘关系分析。采用改良的CTAB法提取茶花基因组DNA,用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度,用2%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物。扩增产物测序结果显示,EST-SSR序列片段大小为194 bp,序列最长的是崇左金花茶,长度为210 bp,序列最短为凹脉金花茶,长度为152 bp。在NCBI上寻找同源系列,用Cluster软件进行系列比对,发现不同山茶属植物EST-SSR系列差异较大,其中缺失位点为1752个,突变位点813个。用MEGA6.0软件画系统树,对茶花进行亲缘关系分析,39种茶花聚为红山茶组、金花茶组、糙果茶组、连蕊茶组四组,结果与张宏达形态学分类结果基本一致。结论:EST-SSR分子标记用于茶花系统分类及物种鉴定效果较好。