鸡传染性支气管炎病毒HQ P_(10)毒株非编码区序列分析

研究旨在探讨鸡传染性支气管炎病毒（IBV）的遗传变异情况,为鸡传染性支气管炎的防控提供基础数据.通过对IBV HQ毒株第10代鸡胚培养病毒的5＇端非编码区（5＇UTR）和3＇UTR序列进行cDNA末端快速扩增（RACE）和序列分析.结果表明：HQP10的5＇UTR长度为525 nt,相较于Beaudette毒株,序列中发生4个位点的碱基缺失突变,1个位点的碱基插入突变,导致其SL1-SL4茎环结构有所改变,与参考毒株的相应序列同源性在94％～99％之间;而3＇UTR长度为363 nt,与参考毒株相应序列的同源性在45％～98％之间,与H120的同源性在93.3％,而与H52株、M41株的同源性则较低,分别为46.4％和45.9％.UTR对病毒RNA的合成具有重要作用,HQP10毒株UTR中的突变对病毒复制效率的影响还有待进一步研究.

鸡传染性支气管炎病毒GZ株的分离鉴定及3CL^(pro)基因片段序列分析

从福建某鸡场发病鸡的气管和肾脏组织中分离到1株病毒,通过病毒对SPF鸡胚的致病性特征、血凝特性、电镜观察及RT-PCR鉴定等方面的研究,证实该病毒为鸡传染性支气管炎病毒(IBV),并命名为GZ毒株。通过RT-PCR对该毒株的3CLpro基因片段进行扩增,随后进行克隆与测序。该序列与参考毒株的核苷酸序列分析显示,GZ株的3CLpro基因片段与参考毒株的同源性为85.9%~98.5%,与Beaudette毒株核苷酸序列同源性最高(98.5%),而与H120株同源性为89.7%,与LX4株同源性最低(85.9%)。遗传演化分析显示,GZ分离株与参考株可以划分为3个群,GZ分离株与Beaudette毒株处于同一分支,而与LX4、BJ及Massachusetts毒株亲缘关系较远。