铜死亡相关基因在肺腺癌中的生物学特征和临床意义

目的基于癌症基因组图谱的多组学数据,探讨铜死亡相关基因在肺腺癌中的生物学特征及临床意义。方法从2022年3月发表于Science杂志上的一篇研究中,获取铜死亡相关基因。利用癌症基因组图谱全基因组数据揭示铜死亡相关基因在肺腺癌中的突变谱及拷贝数变异景观,并分析其对转录组表达的影响。利用Metascape分析对铜死亡相关基因进行注释,以进一步了解这些基因参与的通路或功能。随后采用单因素Cox分析及Kaplan-Meier方法确定这些基因与肺腺癌患者预后的关系,并用CellMiner分析识别可能靶向铜死亡相关基因的潜在抗癌药物。结果铜死亡相关基因在肺腺癌中的突变频率较低,而基因突变对转录组表达的影响可能取决于突变的类型。基因拷贝数变异是导致铜死亡相关基因表达紊乱的重要因素。16个铜死亡相关基因主要参与了乙醛酸代谢和甘氨酸降解、铜离子进入、蛋白质脂酰化、细胞氨基酸分解代谢过程、氧化应激反应等,其中6个基因(DLD、FDX1、DLAT、DLST、PDHA1、CDKN2A)是肺腺癌患者的预后危险基因。CellMiner分析提示有13种药物与7个铜死亡相关基因存在相关性,他们可能是靶向铜死亡的潜在抗癌药物。结论本研究首次揭示了铜死亡相关基因在肺腺癌中的生物学特征及临床意义,为后续开展铜死亡在癌症中的研究提供了一定参考与理论依据。