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cyclin D1表达模式深度学习识别和预测模型对HPV阴性口腔鳞状细胞癌和口咽鳞状细胞癌患者预后的预测作用
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作者 杨可 孙雅楠 +4 位作者 胡雅英 吕宜楠 郑小风 李易玮 张佳莉 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期308-315,共8页
目的:通过评估cyclin D1的表达状态与HPV阴性口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)及口咽鳞状细胞癌(oropharyngeal squamous cell carcinoma, OPSCC)患者预后的关系,建立基于cyclin D1表达模式的图像识别评分和生存预... 目的:通过评估cyclin D1的表达状态与HPV阴性口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)及口咽鳞状细胞癌(oropharyngeal squamous cell carcinoma, OPSCC)患者预后的关系,建立基于cyclin D1表达模式的图像识别评分和生存预测模型。方法:回顾性分析610例HPV阴性OSCC和OPSCC患者的临床病理资料。通过比较cyclin D1在不同评价方式以及联合p16/p53表达等多种因素评价体系下患者总体生存(OS)及无进展生存(PFS)的差异,检测cyclin D1对OSCC、OPSCC患者预后的预测作用。利用YOLOv5图像识别算法建立cyclinD1表达模式评分模型,并在此基础上用DeepHit和DeepSurv算法分别建立预后模型。结果:cyclin D1在OSCC和OPSCC癌巢中存在三级表达模式。该表达模式与OSCC(P<0.0001)、OPSCC(P<0.05)患者预后显著相关,且优于cyclin D1表达水平与患者预后的相关性。cyclin D1表达模式在OSCC(P<0.0001)及OPSCC(P<0.05)中均为独立的预后风险因素。基于cyclin D1表达模式的评分模型在测试集中的准确率达(78.48±4.31)%。在OS预测中,DeepHit算法建立的模型在测试集中的C-index为0.709±0.019,DeepSurv算法建立模型测试集中C-index为0.715±0.029。结论:基于深度学习的cyclin D1表达模式评分模型联合生存预测模型对HPV阴性OSCC和OPSCC总体生存预后具有较好的预测作用。 展开更多
关键词 cyclin D1 口腔鳞状细胞癌 口咽鳞状细胞癌 预后 深度学习
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口腔黏膜异常增生中基因甲基化研究现况
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作者 孙雅楠 佘文婷 +1 位作者 张佳莉 陈新明 《口腔生物医学》 2016年第1期46-49,共4页
约90%口腔鳞状细胞癌(OSCC)在临床上都出现过癌前病变即口腔上皮异常增生(OED)。OED的病因是多因素的,在不同肿瘤的癌前病变中,越来越多的研究发现肿瘤发生相关基因出现启动子甲基化。为了明确口腔癌前病变的甲基化的研究现状,本文针对... 约90%口腔鳞状细胞癌(OSCC)在临床上都出现过癌前病变即口腔上皮异常增生(OED)。OED的病因是多因素的,在不同肿瘤的癌前病变中,越来越多的研究发现肿瘤发生相关基因出现启动子甲基化。为了明确口腔癌前病变的甲基化的研究现状,本文针对口腔上皮异常增生中的启动子甲基化的研究进行概述与分析。 展开更多
关键词 口腔上皮异常增生 口腔癌前病变 启动子甲基化 口腔鳞状细胞癌
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IGF2BP2的异常表达影响口腔鳞状细胞癌的增殖和侵袭 被引量:3
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作者 胡雅英 陈文 张佳莉 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期354-359,共6页
目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)中异常表达的胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)对增殖和侵袭的影响。方法:将4对OSCC组织及癌旁组织进行mRNA高通量测序,筛选差异表达RNA结合蛋白;在OSCC细胞系中利用RNA干扰沉默技术降低IGF2BP2... 目的:探讨口腔鳞状细胞癌(OSCC)中异常表达的胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)对增殖和侵袭的影响。方法:将4对OSCC组织及癌旁组织进行mRNA高通量测序,筛选差异表达RNA结合蛋白;在OSCC细胞系中利用RNA干扰沉默技术降低IGF2BP2的表达;利用CCK-8和Transwell实验检测IGF2BP2对增殖和侵袭的影响。对HSC3细胞系进行改良RIP高通量测序(Improved RIP-seq,iRIP-seq)和mRNA高通量测序分析IGF2BP2的下游靶基因,运用KEGG信号通路富集分析获得IGF2BP2靶标基因的主要富集信号通路。结果:在OSCC癌组织中IGF2BP2为表达丰度和差异上调最为显著的RNA结合蛋白(P=7.11E-06)。下调IGF2BP2抑制OSCC的体内外增殖和体外侵袭。IGF2BP2的潜在靶标基因主要富集到Axon guidance、Focal adhesion、Rap1信号通路、pathways in cancer、MAPK信号通路等。结论:IGF2BP2在OSCC中表达增高并可能通过影响细胞增殖和粘附相关信号通路发挥促进肿瘤的作用。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2 口腔鳞状细胞癌 增殖 侵袭
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缺氧诱导蛋白Endoglin在口腔恶性肿瘤研究中的意义
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作者 张建华 汪说之 陈新明 《国外医学(口腔医学分册)》 2005年第1期19-20,共2页
Endoglin是一种与增殖相关的缺氧诱导蛋白熏又是转化生长因子-覻(TGF-覻)受体复合物之一,主要表达于新生血管内皮细胞。可以作为肿瘤诊断、转移、判断预后的早期指标。
关键词 Endoglin蛋白 新生血管 诊断 转移 预后 口腔恶性肿瘤
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腭部坏死性唾液腺化生1例
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作者 刘泽燏 童文锦 +2 位作者 周刚 张佳莉 卢锐 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期181-184,共4页
坏死性唾液腺化生是一种罕见的、具有自限性的疾病,主要累及唾液腺及周围组织。该病临床及病理表现易与其他疾病,尤其是与恶性肿瘤相混淆,因此掌握坏死性唾液腺化生的相关知识对于正确诊断和治疗,避免误诊及过度治疗具有重要意义。本文... 坏死性唾液腺化生是一种罕见的、具有自限性的疾病,主要累及唾液腺及周围组织。该病临床及病理表现易与其他疾病,尤其是与恶性肿瘤相混淆,因此掌握坏死性唾液腺化生的相关知识对于正确诊断和治疗,避免误诊及过度治疗具有重要意义。本文报告1例表现为腭部深大溃疡的坏死性唾液腺化生病例的诊疗过程,以期为临床诊疗提供参考。 展开更多
关键词 坏死性唾液腺化生 口腔溃疡 鉴别诊断
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人舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1的建立及鉴定 被引量:1
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作者 郑小风 孙雅楠 +4 位作者 胡雅英 吕宜楠 杨可 李易玮 张佳莉 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期357-361,共5页
目的:建立1株人舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1并鉴定其基本生物学特性。方法:将所获得的舌鳞状细胞癌患者手术切除的组织块标本进行原代培养,传代后建立舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1,显微镜下观察并记录其细胞形态和生长特性,行基因组DNA... 目的:建立1株人舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1并鉴定其基本生物学特性。方法:将所获得的舌鳞状细胞癌患者手术切除的组织块标本进行原代培养,传代后建立舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1,显微镜下观察并记录其细胞形态和生长特性,行基因组DNA短串联重复序列分析,并对其倍增时间、凝集反应、细胞表面标记物、染色体核型和裸鼠成瘤能力等特性进行检测。结果:WU-TSC-1可稳定传代50余代,为人源肿瘤细胞,无其他细胞交叉污染。细胞呈卵圆形或方圆形,失去接触抑制。染色体核型为非二倍体染色体。体外细胞倍增时间为51.15 h,体内具有成瘤能力。结论:该研究成功建立了1株人舌鳞状细胞癌细胞系WU-TSC-1,为揭示舌鳞状细胞癌的发病机制,探索诊断指标和治疗方案提供了新的实验细胞系。 展开更多
关键词 舌鳞状细胞癌 细胞系 原代培养
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IL-12A和EBI3在OSCC中的表达及其与免疫微环境的关系
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作者 吕宜楠 胡雅英 +2 位作者 郑小风 杨可 张佳莉 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期533-539,共7页
目的:探讨IL-35两个亚基IL-12A和EBI3在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达,及其与OSCC患者临床病理特征、预后和免疫微环境的关系。方法:通过组织芯片和免疫组织化学法检测186例OSCC患者的正常组织及癌组织中的IL-35亚基IL-12A和EBI3的... 目的:探讨IL-35两个亚基IL-12A和EBI3在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达,及其与OSCC患者临床病理特征、预后和免疫微环境的关系。方法:通过组织芯片和免疫组织化学法检测186例OSCC患者的正常组织及癌组织中的IL-35亚基IL-12A和EBI3的表达水平,中性粒细胞和CD4+T细胞的浸润水平;通过TCGA数据库和TIMER数据库分析IL-12A和EBI3与OSCC无病间期和免疫细胞浸润的关系。结果:IL-12A和EBI3在肿瘤组织中表达显著高于正常上皮(P<0.001)。IL-12A和EBI3在肿瘤组织中的表达具有相关性(r=0.45,P<0.01),IL-12A和EBI3的表达水平只与OSCC的病理分级有关。IL-12A和EBI3低表达患者的预后更佳(P<0.05),无病间期也更长(P<0.05)。免疫浸润分析发现EBI3和中性粒细胞浸润相关(r=0.311,P<0.0001),IL12A与CD4+T细胞有关(r=0.254,P<0.05)。结论:IL-35亚基IL-12A和EBI3在OSCC中表达上升,影响OSCC患者的预后并影响免疫相关细胞浸润水平。 展开更多
关键词 白细胞介素-35 口腔鳞状细胞癌 预后 肿瘤微环境
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单核苷酸多态与头颈部鳞状细胞癌发生风险的研究进展
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作者 黄静 陈新明 《国外医学(口腔医学分册)》 2005年第4期269-271,共3页
核苷酸切除修复是人类最重要的DNA损伤修复机制,ERCC2/XPD和XPC是重要的核苷酸切除修复基因产物,在遗传组学的研究上发挥重要作用。本文就ERCC2/XPD和XPC单核苷酸多态与头颈部鳞状细胞癌发生风险的研究进展作一综述。
关键词 ERCC2/XPD XPC 核苷酸切除修复 单核苷酸多态 头颈部鳞状细胞癌
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