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参与发育的基因家族 被引量:24
1
作者 周荣家 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期86-88,共3页
本文简述了同源框基因 (HOX)和SOX基因两大家族的特征及其在发育过程中的作用。个体发育从受精卵开始就受发育调控串基因的有序启动与关闭的控制。基因表达的调节主要在转录水平上进行 ,并且转录调控子多是一类DNA结合蛋白 ,通过其与受... 本文简述了同源框基因 (HOX)和SOX基因两大家族的特征及其在发育过程中的作用。个体发育从受精卵开始就受发育调控串基因的有序启动与关闭的控制。基因表达的调节主要在转录水平上进行 ,并且转录调控子多是一类DNA结合蛋白 ,通过其与受控基因启动子或其他调控元件的结合来调节目标基因的表达。HOX、SOX和DMRT基因三大家族正是通过上述机制参与广泛的发育调控过程。 展开更多
关键词 转录调控 基因家族 发育
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黄鳝β-actin基因的克隆及其在鱼类中的系统发生分析(英文) 被引量:14
2
作者 夏来新 程汉华 +1 位作者 郭一清 周荣家 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第7期689-695,共7页
βactin是actin家族的一员,在维持细胞结构,细胞内运动,细胞分裂等细胞生理活动方面发挥着重要的作用。克隆的黄鳝βactin基因的cDNA全长1860bp,编码375个氨基酸,在脊椎动物中不同物种的βactin基因之间的序列同源性超过了98%。RTPCR表... βactin是actin家族的一员,在维持细胞结构,细胞内运动,细胞分裂等细胞生理活动方面发挥着重要的作用。克隆的黄鳝βactin基因的cDNA全长1860bp,编码375个氨基酸,在脊椎动物中不同物种的βactin基因之间的序列同源性超过了98%。RTPCR表明克隆的黄鳝βactin基因在睾丸、卵巢、心、肝、脾、脑等组织中广谱表达。基于目前已知的全部鱼类βactincds,构建了进化树。星形辐射的树型结构一致支持将鱼类βactin基因划分为4类。到目前为止,所有的鱼都没有发现拥有全部4个βactin基因。这暗示伴随着鱼类的辐射式进化历程,可能发生了种系特异性的βactin的丢失。 展开更多
关键词 Β-ACTIN 黄鳝 性反转 系统发生
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脊椎动物Sox基因家族的系统发生分析 被引量:15
3
作者 汪锐 程汉华 +1 位作者 郭一清 周荣家 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第11期990-994,共5页
脊椎动物Sox基因是一类高度保守的基因家族 ,它们编码一类转录因子 ,参与多种发育过程的调控。这个家族的共有特征是Sox蛋白具有一个约 79个氨基酸 ,可与DNA特异结合的HMG盒区。该基因家族成员众多复杂 ,对它们的基因结构、功能及进化... 脊椎动物Sox基因是一类高度保守的基因家族 ,它们编码一类转录因子 ,参与多种发育过程的调控。这个家族的共有特征是Sox蛋白具有一个约 79个氨基酸 ,可与DNA特异结合的HMG盒区。该基因家族成员众多复杂 ,对它们的基因结构、功能及进化关系的研究有助于对该基因家族的全面认识。利用已克隆的全部脊椎动物全长核苷酸 /蛋白质数据 ,对这些数据进行序列比对及进化树的构建 ,分析Sox基因家族成员的分类及分子进化模式。 展开更多
关键词 脊椎动物 SOX基因家族 系统发生分析 HMG盒
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脊椎动物DMRT基因家族的系统发生及同线性分析 被引量:11
4
作者 郭一清 程汉华 +1 位作者 高尚 周荣家 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第10期1103-1108,共6页
利用本室克隆的DMRT/Dmrt基因以及多个基因数据库中收集的DMRT/Dmrt基因全 (或部分 )序列 ,构建了DMRT/Dmrt基因的系统发生树 ,DMRT/Dmrt基因明显地聚为 7类 (DMRT/Dmrt 1~DMRT/Dmrt7)。以已克隆的斑马鱼Dmrt 1基因序列及数据库中人和... 利用本室克隆的DMRT/Dmrt基因以及多个基因数据库中收集的DMRT/Dmrt基因全 (或部分 )序列 ,构建了DMRT/Dmrt基因的系统发生树 ,DMRT/Dmrt基因明显地聚为 7类 (DMRT/Dmrt 1~DMRT/Dmrt7)。以已克隆的斑马鱼Dmrt 1基因序列及数据库中人和小鼠的DMRT/Dmrt基因序列 ,结合基因组数据的比对分析 ,发现脊椎动物DMRT/Dmrt基因家族成员在基因组中的定位呈现高度保守的同线性 ,主要集中于两大同线群 ,即DMRT/Dmrt 1~ 3和DMRT/Dmrt 5~ 6。 展开更多
关键词 DM结构域 同线性 基因家族 性别分化
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大熊猫Dmrt基因家族 4个成员基因的克隆 被引量:10
5
作者 水怡 余红仕 +3 位作者 夏来新 郭一清 程汉华 周荣家 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期468-473,共6页
果蝇Doublesex基因、线虫Mab 3基因和人类DMRT1基因均含有一个新的具有DNA结合能力的保守基序 ,即DM结构域。它们在性别决定和分化发育的调控过程中具有相似的功能。通过简并PCR克隆技术 ,扩增和克隆了大熊猫基因组中的DM结构域 ,得到... 果蝇Doublesex基因、线虫Mab 3基因和人类DMRT1基因均含有一个新的具有DNA结合能力的保守基序 ,即DM结构域。它们在性别决定和分化发育的调控过程中具有相似的功能。通过简并PCR克隆技术 ,扩增和克隆了大熊猫基因组中的DM结构域 ,得到了 4个具有不同DM序列的克隆。结果显示 ,在大熊猫基因组中存在Dmrt基因家族的多个成员。该基因家族在脊椎动物和非脊椎动物都具有高度的进化保守性。 展开更多
关键词 大熊猫 DM结构域 简并PCR 基因家族
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黄鳝性腺高表达的核糖体蛋白基因 被引量:11
6
作者 商璇 何焱 +6 位作者 张雷 何春江 夏来新 高尚 郭一清 程汉华 周荣家 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期227-230,共4页
采用高密点阵技术从黄鳝雄性性腺cDNA文库中获得 8 个克隆,序列分析和 BLAST结果显示它们编码的蛋白质分别与40S核糖体蛋白S4,S9,S16,S17,S20 和 60S核糖体蛋白 L7, L18a,L29 高度同源。根据黄鳝 RP蛋白序列和其他物种的相应同源序列构... 采用高密点阵技术从黄鳝雄性性腺cDNA文库中获得 8 个克隆,序列分析和 BLAST结果显示它们编码的蛋白质分别与40S核糖体蛋白S4,S9,S16,S17,S20 和 60S核糖体蛋白 L7, L18a,L29 高度同源。根据黄鳝 RP蛋白序列和其他物种的相应同源序列构建ML系统发生树,显示核糖体蛋白基因在进化中高度保守。核糖体蛋白基因不仅可作为分子进化分析的有利工具,而且从它们的表达模式显示 RP 基因除具有看家基因的功能外,很有可能参与包括性腺分化等过程的发育调控。 展开更多
关键词 核糖体蛋白 黄鳝 性别决定
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BACFISH在植物基因组研究中的应用 被引量:17
7
作者 覃瑞 魏文辉 宋运淳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第1期20-23,共4页
细菌人工染色体与荧光原位杂交合成技术(BACFISH)是90年代开始发展起来的一种新的定位技术.由于该技术较常规荧光原位杂交(FISH)技术的信号检出率高得多,近年来在植物基因组研究中得到了越来越多的应用.运用该技术已将一些重要的功能基... 细菌人工染色体与荧光原位杂交合成技术(BACFISH)是90年代开始发展起来的一种新的定位技术.由于该技术较常规荧光原位杂交(FISH)技术的信号检出率高得多,近年来在植物基因组研究中得到了越来越多的应用.运用该技术已将一些重要的功能基因定位到相应植物染色体上. 展开更多
关键词 植物基因组 原位杂交 基因定位 BAC-FISH
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Ca^(2+)诱导水稻细胞DNA片段化的研究 被引量:4
8
作者 杨征 蔡陈崚 +2 位作者 何光存 覃瑞 宋运淳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期707-711,共5页
用CaCl_2处理水稻愈伤组织,研究钙离子在水稻细胞凋亡过程中的作用.结果发现,水稻愈伤组织经150mmol/LCaCl_2处理1~2 h后,DNA无明显降解;处理3h后,DNA降解为5kb以上的大片段;处理8h后,DNA几乎完全降解成200bp~1kb的小片段.由此推测,... 用CaCl_2处理水稻愈伤组织,研究钙离子在水稻细胞凋亡过程中的作用.结果发现,水稻愈伤组织经150mmol/LCaCl_2处理1~2 h后,DNA无明显降解;处理3h后,DNA降解为5kb以上的大片段;处理8h后,DNA几乎完全降解成200bp~1kb的小片段.由此推测,细胞外高浓度的Ca^2+对诱导凋亡细胞的DNA片段化起了重要作用.研究还发现,一定浓度的Mg^2+和放线菌酮也能诱导细胞DNA片段化,Zn^2+则不能诱导细胞DNA片段化.细胞凋亡过程中的DNA片段化可以由多种途径诱导产生. 展开更多
关键词 细胞凋亡 水稻 愈伤组织 DNA片段化 钙离子
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盐胁迫诱导的植物细胞凋亡——植物抗盐的可能生理机制 被引量:26
9
作者 宁顺斌 宋运淳 +1 位作者 王玲 李霞 《实验生物学报》 CSCD 2000年第3期245-253,共9页
近来的研究表明,一定条件的盐胁迫可导致植物细胞程序性死亡。本文利用DNA Lad-dering、石蜡切片原位检测以及染色体涂片原位检测,从组织、细胞以及DNA等多个方面对盐胁迫下的玉米、水稻和烟草根尖细胞死亡作了研究,形态特别是生化方面... 近来的研究表明,一定条件的盐胁迫可导致植物细胞程序性死亡。本文利用DNA Lad-dering、石蜡切片原位检测以及染色体涂片原位检测,从组织、细胞以及DNA等多个方面对盐胁迫下的玉米、水稻和烟草根尖细胞死亡作了研究,形态特别是生化方面的证据表明盐胁迫诱导的植物细胞凋亡可能在植物界具有一定的普遍性。但各个物种之间有一定差异。本实验结果对盐胁迫下的植物生理机制提供了新的研究思路。同时,我们还对基于染色体制片和石蜡切片的原位检测方法进行了比较和讨论。我们认为,基于染色体制片的原位标记技术适合于定性和定量检测单个细胞的凋亡,具有一些石蜡切片所不可及的优点。 展开更多
关键词 盐胁迫 植物细胞调亡 植物抗盐 生理机制
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药物诱导的玉米根尖细胞凋亡 被引量:18
10
作者 宁顺斌 宋运淳 +1 位作者 王玲 刘立华 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第7期693-696,共4页
同时应用DNALaddering、DNAGelBlot以及基于染色体涂片的原位末端标记技术 ,从染色体、细胞核和DNA不同水平对细胞毒素类药物放线菌D、放线菌酮和秋水仙碱诱导的玉米 (ZeamaysL .)根尖分生组织细胞死亡作了检测。结果表明 :同动物中一... 同时应用DNALaddering、DNAGelBlot以及基于染色体涂片的原位末端标记技术 ,从染色体、细胞核和DNA不同水平对细胞毒素类药物放线菌D、放线菌酮和秋水仙碱诱导的玉米 (ZeamaysL .)根尖分生组织细胞死亡作了检测。结果表明 :同动物中一样 ,这些药物诱导的玉米根尖分生组织细胞死亡也具有DNALadder、染色质和细胞核浓缩等典型的凋亡特征 ,说明这些细胞毒素类药物能够诱导植物体内的细胞凋亡。 展开更多
关键词 细胞凋亡 植物 细胞毒素类药物 DNALadder
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原癌基因ras在玉米中同源序列的检出及其荧光原位杂交定位 被引量:3
11
作者 杨征 蔡陈崚 +2 位作者 覃瑞 刘立华 宋运淳 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第4期338-343,共6页
原癌基因ras是动物中抑制细胞凋亡的重要基因之一。以人的ras基因为探针,通过Southern杂交技术,确证玉米和水稻中均含有ras基因的同源序列;同时,运用荧光原位杂交技术,首次对ras基因在玉米中的同源序列进行了... 原癌基因ras是动物中抑制细胞凋亡的重要基因之一。以人的ras基因为探针,通过Southern杂交技术,确证玉米和水稻中均含有ras基因的同源序列;同时,运用荧光原位杂交技术,首次对ras基因在玉米中的同源序列进行了定位。结果表明:ras探针在第2号和第7号染色体上均检出了杂交信号,信号检出率分别为10.85%和14.15%,杂交信号与着丝粒的百分距离分别为 54.92± 1.90和 94.62± 2.77。上述研究结果为植物细胞凋亡的进一步研究提供了线索和帮助。 展开更多
关键词 玉米 细胞凋亡 同源序列 基因定位 原癌基因ras
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Physical Mapping of the Sequences Homologous to Disease Resistance Genes myb1 and NDR1 in Maize 被引量:9
12
作者 宁顺斌 宋运淳 +2 位作者 王玲 魏文辉 刘立华 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第6期605-610,共6页
Using fluorescence in situ hybridization, the authors investigated the homology between three plant species, maize (Zea mays L.) and tobacco (Nicotiana tabacum L.), maize and Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. at cy... Using fluorescence in situ hybridization, the authors investigated the homology between three plant species, maize (Zea mays L.) and tobacco (Nicotiana tabacum L.), maize and Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. at cytogenetic level using two probes corresponding to functional disease resistance genes myb1 and NDR1 in Arabidopsis and tobacco respectively. The hybridization signals of the tested probes were detected in maize chromosomes 8 and 5 respectively, and the single location of each of the two probes showed only single copy of them in maize genome. The results provided a valuable insight into searching for genes associated with programmed cell death in plants using heterologous probe with comparative genetic approach. In addition, the improvements of FISH technique using heterologous probes were discussed. 展开更多
关键词 hypersensitive response programmed cell death comparative genetics fluorescence in situ hybridization MAIZE
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基因组原位杂交鉴定玉米的外源染色体片段 被引量:3
13
作者 王玲 宋运淳 +3 位作者 宁顺斌 刘立华 谷明光 郭乐群 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第12期1264-1268,共5页
利用基因组原位杂交技术 ,在稳定遗传的纯系 5 40及其与玉米 (ZeamaysL .)自交系杂交后代F1,即遗单 6号中 ,成功地鉴定了渗入其中的二倍体多年生类玉米 (ZeadiploperennisDoebley ,DP)的染色体片段。采用DAB (Di aminobenzidinetetrahyd... 利用基因组原位杂交技术 ,在稳定遗传的纯系 5 40及其与玉米 (ZeamaysL .)自交系杂交后代F1,即遗单 6号中 ,成功地鉴定了渗入其中的二倍体多年生类玉米 (ZeadiploperennisDoebley ,DP)的染色体片段。采用DAB (Di aminobenzidinetetrahydrochloride)和荧光检出系统 ,二者获得了一致的结果。在纯系 5 40的第 1、2、5和 8号两条同源染色体长臂上均检出杂交信号 ,而仅在遗单 6号第 1、2和 8号染色体长臂上具有信号点。在纯系 5 40和遗单 6号中 ,第 1和 2号染色体上的信号点距着丝粒的百分距离十分一致。遗单 6号的第 8号染色体上的信号点距着丝粒的百分距离比纯系 5 40的小 ,并讨论了产生这种差异性的原因。 展开更多
关键词 玉米 基因组原位杂交 DP 外源染色质 鉴定
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低温胁迫诱导玉米根尖细胞凋亡的形态和生化证据 被引量:23
14
作者 宁顺斌 宋运淳 +1 位作者 王玲 刘立华 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 2000年第3期189-194,共6页
近来体外培养细胞体系研究的结果表明 ,一定条件的低温胁迫可导致植物细胞凋亡。本文利用DNA梯状图谱 (DNAladdering)以及染色体涂片的TUNEL(terminaldeoxynucleotidyltransferase mediateddUTPnickend labeling)原位检测 ,从原位以及... 近来体外培养细胞体系研究的结果表明 ,一定条件的低温胁迫可导致植物细胞凋亡。本文利用DNA梯状图谱 (DNAladdering)以及染色体涂片的TUNEL(terminaldeoxynucleotidyltransferase mediateddUTPnickend labeling)原位检测 ,从原位以及生化水平对低温胁迫下的玉米根尖细胞死亡作了研究 ,形态和生化方面的证据表明 ,同体外一样 ,低温胁迫也能诱导体内植物细胞凋亡。同时对低温胁迫下植物细胞凋亡的形态及生化变化特征和变化次序做了初步观察。 展开更多
关键词 低温胁迫 细胞凋亡 根尖细胞 抗逆机制
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植物同源异型基因及同源异型盒基因的研究进展 被引量:5
15
作者 魏文辉 宋运淳 覃瑞 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第2期136-139,共4页
植物同源异型基因及同源异型盒基因是涉及植物个体发育调节的两类重要转录因子编码基因 .近 10年来的研究表明 ,这两类基因及其产物的结构与功能具有明显的差异 .深入研究这两类基因的结构与功能对揭示植物的发育机制具有重要意义 .
关键词 同源异型基因 同源异型盒基因 发育调节 植物
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水稻原胚和刚启动分化的幼胚cDNA文库的构建与分析 被引量:3
16
作者 陈绍荣 李师弢 +1 位作者 吕应堂 杨弘远 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第2期214-216,共3页
Two cDNA libraries were constructed from microdissected 214 rice proembryos (2-3 d after pollination) and 121 just differentiating young embryos (3-5 d after pollination) respectively through RT_PCR technique. The pri... Two cDNA libraries were constructed from microdissected 214 rice proembryos (2-3 d after pollination) and 121 just differentiating young embryos (3-5 d after pollination) respectively through RT_PCR technique. The primary libraries had a total of 3.7×10 6 phages for the proembryos and a total of 2.5×10 6 phages for the just differentiating young embryos, in which 96% of the phages were recombinants. Insert sizes ranging from 400 bp to 3?500 bp were obtained. All of the above mentioned accorded with the general requirements of cDNA library construction. 展开更多
关键词 水稻 原胚 分化胚 CDNA文库 基因表达
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黄鳝Hprt基因的克隆及表达分析 被引量:2
17
作者 何焱 商璇 +1 位作者 程汉华 周荣家 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期677-682,共6页
次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(Hprt)参与嘌呤核苷酸的补救合成。采用RACE技术克隆了黄鳝的次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶基因,它的全长cDNA为1 452 bp,预测编码218个氨基酸,与人类、小鼠、鸡和斑马鱼等脊椎动物Hprt氨基酸序列之间的同... 次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(Hprt)参与嘌呤核苷酸的补救合成。采用RACE技术克隆了黄鳝的次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖转移酶基因,它的全长cDNA为1 452 bp,预测编码218个氨基酸,与人类、小鼠、鸡和斑马鱼等脊椎动物Hprt氨基酸序列之间的同源性超过76.7%。基于该基因氨基酸序列构建了进化树,显示与斑马鱼Hprt基因更同源。RT-PCR表明黄鳝Hprt基因在多种组织中广谱表达,表明黄鳝该基因在功能和进化上的保守性。 展开更多
关键词 HPRT 性反转 突变 黄鳝
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RNA原位杂交技术及其在植物基因表达研究中的应用 被引量:10
18
作者 陈绍荣 杨弘远 《武汉植物学研究》 CSCD 2000年第1期57-63,共7页
关键词 RNA原位杂交 基因 时空表达 植物
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受精前后烟草卵细胞内玉米素和三类酸性植物激素分布的免疫金电镜观察 被引量:5
19
作者 陈以峰 梁世平 +1 位作者 杨弘远 周燮 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第11期1145-1149,共5页
用胶体免疫金电镜技术观察了受精前后烟草(Nicotianatabacumvarmacrophylla)卵细胞内玉米素(t-Z)、GA7与GA4、(+)ABA与IAA分布的变化。受精前卵细胞内有大量t-Z,主要位于细胞核、内质网与线粒体上;与卵细胞相邻的助细胞合点... 用胶体免疫金电镜技术观察了受精前后烟草(Nicotianatabacumvarmacrophylla)卵细胞内玉米素(t-Z)、GA7与GA4、(+)ABA与IAA分布的变化。受精前卵细胞内有大量t-Z,主要位于细胞核、内质网与线粒体上;与卵细胞相邻的助细胞合点端及中央细胞珠孔端亦有较多t-Z。受精后,合子与宿存助细胞t-z显著减少,正加厚的合子细胞壁中有t-Z分布。未受精卵细胞内GA7与GA4及(+)ABA减少,IAA更少。合子内GA7与GA4及(+)ABA略有增加,IAA仍然很少。初步讨论了上述植物激素与受精作用的关系。 展开更多
关键词 受精 卵细胞 植物激素 免疫金电镜 烟草 玉米素
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黄鳝Nup93基因的分子克隆及其在性腺和肾的显著表达(英文) 被引量:1
20
作者 商璇 何焱 +4 位作者 张雷 陈波 何春江 程汉华 周荣家 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第1期41-48,共8页
核孔蛋白(Nucleoporins,Nups)是核孔复合体(Nuclear pore complexes,NPC)的重要组成成分,核孔复合体可以 控制细胞内信号分子在核质间的双向转运,从而控制基因表达、细胞增殖和分化。在构建的黄鳝精巢SMART cDNA文库 中,采用差异筛选的... 核孔蛋白(Nucleoporins,Nups)是核孔复合体(Nuclear pore complexes,NPC)的重要组成成分,核孔复合体可以 控制细胞内信号分子在核质间的双向转运,从而控制基因表达、细胞增殖和分化。在构建的黄鳝精巢SMART cDNA文库 中,采用差异筛选的方法得到黄鳝核孔蛋白家族中Nup93基因的3′端片段,根据此段序列设计引物,使用兼并PCR和5′RACE 方法克隆得到此基因的全长cDNA。序列比对显示该基因与酵母Nic96、斑马鱼Nup93和人类Nup93的同源性分别为36.5%、 94.6%和90.5%。进化树分析显示,黄鳝Nup93与其他鱼类的Nup93归为一支。采用荧光定量PCR方法对不同性别黄鳝的 性腺和其他组织内该基因的表达作定量分析发现,Nup93在性腺和肾中的表达量远高于其他组织,而且表达量存在一定的 性别差异。这一结果提示Nup93可能与性腺发育相关。 展开更多
关键词 核孔蛋白 Nup93黄鳝 性分化 表达 性腺
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