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基于长链非编码RNA特征的列线图提高卵巢癌的生存预测
被引量:
2
1
作者
张雪梅
高琴
杨学
《生物医学工程与临床》
CAS
2020年第3期322-327,共6页
目的长链非编码RNA(lncRNA)在卵巢癌中各种作用引起了越来越多的关注。研究确定基于lncRNA的特征,用于建立卵巢癌患者的生存预测。方法从基因表达数据库(GEO)下载GSE9891卵巢癌285例基因表达数据集及相应的临床数据。采用单因素Cox回归...
目的长链非编码RNA(lncRNA)在卵巢癌中各种作用引起了越来越多的关注。研究确定基于lncRNA的特征,用于建立卵巢癌患者的生存预测。方法从基因表达数据库(GEO)下载GSE9891卵巢癌285例基因表达数据集及相应的临床数据。采用单因素Cox回归分析筛选与卵巢癌总生存率(OS)显著相关的lncRNA,并用最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)回归进一步缩减变量。最终采用多因素Cox回归分析确定的lncRNA构建风险评分系统。所有患者根据风险评分的中位值分为高或低风险组。评分系统与临床变量合并后再用多因素Cox回归分析识别出独立的预后因素来建立列线图。采用区分度、校准图和临床实用性用于评价列线图的预测准确度。结果采用多因素Cox回归分析共获得15个与卵巢癌预后显著相关的lncRNA(NORAD、DHRS4-AS1、SNHG18、LINC00174、PCAT6、HOXA-AS2、PCAT19、DOCK9-DT、HDAC4-AS1、TENM3-AS1、DPP10-AS1、FAM201A、RBMS3-AS3、LINC00558、LINC01527),并用于建立一个风险评估系统。风险评分系统成功地将患者分为高风险组和低风险组。最终确定了紫杉醇治疗、国际妇产联合会(FIGO)分期和15个lncRNA特征作为卵巢癌的独立预后因子。结合这些预测因子的列线图显示良好的区分度及校准图,C-index为0.76(95%可信区间为0.717~0.803),优于FIGO分期(C-index为0.65;95%可信区间为0.600~0.700)。此外,决策分析曲线表明列线图提供了优于FIGO分期系统的优势,带来了更多的临床净收益。结论基于lncRNA的风险评分系统能明显区分高风险组和低风险组卵巢癌患者的生存率。新建立的列线图可以较FIGO分期系统更有效地预测卵巢癌患者的总生存率。该列线图较高的预测能力可以帮助临床医生制定合适的个体治疗并进行个性化的预后评估。
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关键词
长链非编码RNA(lncRNA)
卵巢癌
生存率
风险分析
列线图
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职称材料
miR-196b通过调控BACH1对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的作用机制研究
被引量:
1
2
作者
张雪梅
高琴
杨学
《中国性科学》
2022年第5期101-105,共5页
目的探讨miR-196b/BTB-CNC同源体1(BACH1)分子轴对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的调控机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测人绒毛膜癌JEG-3细胞中miRNAs的表达水平,双荧光素酶报告基因验证miR-196b和BACH1的靶向性。...
目的探讨miR-196b/BTB-CNC同源体1(BACH1)分子轴对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的调控机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测人绒毛膜癌JEG-3细胞中miRNAs的表达水平,双荧光素酶报告基因验证miR-196b和BACH1的靶向性。外源性调节miR-196b和BACH1的表达水平后,通过噻唑蓝(MTT)和Transwell实验分别检测JEG-3细胞增殖、侵袭和迁移;通过流式细胞术检测JEG-3细胞的凋亡率;通过Western blotting检测JEG-3细胞中BACH1的表达。结果qRT-PCR结果显示,JEG-3细胞中miR-196b、miR-495、miR-218及miR-378-5p异常低表达(P<0.05),且miR-196b的表达水平最低。双荧光素酶报告基因结果显示,BACH1是miR-196b的靶基因(P<0.05)。过表达miR-196b或敲降BACH1可显著抑制JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移,并促进其凋亡(P<0.05);进一步同时敲降miR-196b和BACH1后,JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移水平及凋亡率与对照(NC)组差异无统计学意义(P>0.05)。结论miR-196b靶向下调BACH1抑制JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移,并促进其凋亡。
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关键词
绒毛膜癌
miR-196b
BTB-CNC同源体1
增殖
侵袭
迁移
凋亡
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职称材料
题名
基于长链非编码RNA特征的列线图提高卵巢癌的生存预测
被引量:
2
1
作者
张雪梅
高琴
杨学
机构
武汉科技大学普仁医院妇产科
出处
《生物医学工程与临床》
CAS
2020年第3期322-327,共6页
文摘
目的长链非编码RNA(lncRNA)在卵巢癌中各种作用引起了越来越多的关注。研究确定基于lncRNA的特征,用于建立卵巢癌患者的生存预测。方法从基因表达数据库(GEO)下载GSE9891卵巢癌285例基因表达数据集及相应的临床数据。采用单因素Cox回归分析筛选与卵巢癌总生存率(OS)显著相关的lncRNA,并用最小绝对值收敛和选择算子(LASSO)回归进一步缩减变量。最终采用多因素Cox回归分析确定的lncRNA构建风险评分系统。所有患者根据风险评分的中位值分为高或低风险组。评分系统与临床变量合并后再用多因素Cox回归分析识别出独立的预后因素来建立列线图。采用区分度、校准图和临床实用性用于评价列线图的预测准确度。结果采用多因素Cox回归分析共获得15个与卵巢癌预后显著相关的lncRNA(NORAD、DHRS4-AS1、SNHG18、LINC00174、PCAT6、HOXA-AS2、PCAT19、DOCK9-DT、HDAC4-AS1、TENM3-AS1、DPP10-AS1、FAM201A、RBMS3-AS3、LINC00558、LINC01527),并用于建立一个风险评估系统。风险评分系统成功地将患者分为高风险组和低风险组。最终确定了紫杉醇治疗、国际妇产联合会(FIGO)分期和15个lncRNA特征作为卵巢癌的独立预后因子。结合这些预测因子的列线图显示良好的区分度及校准图,C-index为0.76(95%可信区间为0.717~0.803),优于FIGO分期(C-index为0.65;95%可信区间为0.600~0.700)。此外,决策分析曲线表明列线图提供了优于FIGO分期系统的优势,带来了更多的临床净收益。结论基于lncRNA的风险评分系统能明显区分高风险组和低风险组卵巢癌患者的生存率。新建立的列线图可以较FIGO分期系统更有效地预测卵巢癌患者的总生存率。该列线图较高的预测能力可以帮助临床医生制定合适的个体治疗并进行个性化的预后评估。
关键词
长链非编码RNA(lncRNA)
卵巢癌
生存率
风险分析
列线图
Keywords
long non-coding RNA(lncRNA)
ovarian cancer
survival rate
risk analysis
nomogram
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
miR-196b通过调控BACH1对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的作用机制研究
被引量:
1
2
作者
张雪梅
高琴
杨学
机构
武汉科技大学普仁医院妇产科
出处
《中国性科学》
2022年第5期101-105,共5页
文摘
目的探讨miR-196b/BTB-CNC同源体1(BACH1)分子轴对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的调控机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测人绒毛膜癌JEG-3细胞中miRNAs的表达水平,双荧光素酶报告基因验证miR-196b和BACH1的靶向性。外源性调节miR-196b和BACH1的表达水平后,通过噻唑蓝(MTT)和Transwell实验分别检测JEG-3细胞增殖、侵袭和迁移;通过流式细胞术检测JEG-3细胞的凋亡率;通过Western blotting检测JEG-3细胞中BACH1的表达。结果qRT-PCR结果显示,JEG-3细胞中miR-196b、miR-495、miR-218及miR-378-5p异常低表达(P<0.05),且miR-196b的表达水平最低。双荧光素酶报告基因结果显示,BACH1是miR-196b的靶基因(P<0.05)。过表达miR-196b或敲降BACH1可显著抑制JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移,并促进其凋亡(P<0.05);进一步同时敲降miR-196b和BACH1后,JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移水平及凋亡率与对照(NC)组差异无统计学意义(P>0.05)。结论miR-196b靶向下调BACH1抑制JEG-3细胞增殖、侵袭、迁移,并促进其凋亡。
关键词
绒毛膜癌
miR-196b
BTB-CNC同源体1
增殖
侵袭
迁移
凋亡
Keywords
Choriocarcinoma
miR-196b
BTB and CNC homology 1
Invasion
Migration
Apoptosis
分类号
R711 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于长链非编码RNA特征的列线图提高卵巢癌的生存预测
张雪梅
高琴
杨学
《生物医学工程与临床》
CAS
2020
2
下载PDF
职称材料
2
miR-196b通过调控BACH1对绒毛膜癌细胞增殖、侵袭和迁移的作用机制研究
张雪梅
高琴
杨学
《中国性科学》
2022
1
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职称材料
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