淋巴瘤细胞10号染色体基因表达的研究

目的 研究淋巴结淋巴瘤细胞不同染色体基因表达情况.方法 将淋巴瘤淋巴结标本液氮速冻,快速冷冻切片,使用激光显微切割技术分离淋巴细胞,提取淋巴细胞中的mRNA与表达谱芯片杂交,通过信号扫描、处理后获得表达基因杂交信号强度.每基因设11～20对探针.杂交信号与错配探针对比,扣除背景值后,使用Wilcoxon符号秩和检验选取与错配杂交信号差异有统计学意义的基因作为分析结果.结果 从快速冷冻保存的淋巴瘤标本中提取了RNA,使用表达谱芯片进行研究,基因表达密度分析显示10号染色体上的基因表达情况与编码基因分布情况有明显差异,10号染色体编码的117条基因在淋巴瘤细胞中表达,且根据胞内定位、基因功能和基因所属的代谢通路3种分类方法对所得基因进行分类分析.结论使用表达谱芯片研究了淋巴瘤细胞不同染色体的基因表达情况,发现10号染色体编码的基因有很大差异.

新基因KIAA0372在淋巴瘤中的表达及其生物信息学分析

目的研究淋巴瘤和反应性增生淋巴结基因表达的差异,并采用生物信息学方法对一条淋巴瘤高表达基因 KIAA0372进行初步分析。方法分别将淋巴瘤淋巴结标本和反应性增生淋巴结标本的 mRNA 与表达谱芯片杂交,通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对一条无功能研究的新基因 KIAA0372进行初步分析,预测它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化分析。结果表达谱芯片共发现了152条差异表达基因。对淋巴瘤相关新基因 KIAA0372的上述性质进行了有效的预测,基本明确了该基因编码一胞外分泌蛋白,可能作为 TGFβ信号通路的一个配基参与淋巴瘤细胞的生成。结论表达谱芯片技术是一种研究肿瘤基因表达差异的有效的高通量研究方法。新基因 KIAA0372是一个有研究价值的新靶点。

激光显微切割技术分离淋巴结血管内皮细胞

目的探讨淋巴瘤发生的分子机制及有关的基因改变,研究分离、分析淋巴结中血管内皮细胞基因表达差异的方法。方法将淋巴瘤淋巴结标本液氮速冻,冷冻切片,快速免疫组化标记血管内皮细胞,使用激光显微切割技术分离血管淋巴细胞,提取血管内皮细胞中的 mRNA,使用 RT-PCR 检测所得 RNA 的质量。结果成功地实现了血管内皮细胞的分离,并保持了血管内皮细胞中 RNA 的完整性。结论确立了一个适于分离淋巴瘤血管内皮细胞的激光显微切割方法。