趋化因子受体4与胃癌患者预后的相关性及潜在机制探索

目的探讨趋化因子受体4(CXCR4)对胃癌患者预后相关性及潜在机制。方法从TCGA数据库下载胃癌患者的RNA表达及临床数据,按CXCR4表达水平分为高表达组(188例)和低表达组(187例),比较2组患者生存时间、不同肿瘤分期胃癌患者的CXCR4表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR4表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析以及所编码的蛋白质之间的相互作用。结果CXCR4高表达组胃癌患者中位生存时间低于CXCR4低表达组(P<0.01)。病理分期Ⅰ期患者CXCR4表达水平显著低于Ⅱ~Ⅳ期,T1期患者CXCR4表达水平显著低于T2~T4期,M0期患者CXCR4表达水平低于M1期(均P<0.05);N分期4组间CXCR4表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。在检测的20225个基因中,有11623个基因与CXCR4存在相关性,选取与CXCR4表达相关系数最高的前50个基因,其中氢电压门控通道1和RCSD结构域1与CXCR4表达水平的相关系数最高(r=0.749、0.738,P<0.001)。GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程包括对刺激的反应、生物调节、细胞通讯,主要定位的细胞组分为膜、囊泡、细胞质,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、分子换能器活动、酶调节剂活性。KEGG通路富集分析可见,主要涉及的信号通路为负性胸腺T细胞选择、B细胞活化参与免疫反应、免疫球蛋白介导的免疫反应;编码蛋白之间的相互作用网络可见,酪氨酸蛋白激酶BTK、胞质分裂蛋白2脱除剂、受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C是处于网络核心的蛋白。结论CXCR4高表达与胃癌患者远期生存率降低及肿瘤分级更高相关,这可能与其通过调控免疫系统而促进肿瘤细胞免疫逃逸有关。

大鼠挤压伤解压后各时间点蛋白质组学差异

目的通过对挤压伤大鼠血清进行检测,筛选出相关差异表达蛋白,了解疾病的发展及转归,为挤压伤的临床治疗提供依据。方法将大鼠随机分为对照组(C组)、0 h组(Z组)、12 h组(T组)、72 h组(S组),每组10只,使用自研挤压平台对大鼠进行挤压造模,运用iTRAQ技术对大鼠血清进行蛋白质组学检测,并运用蛋白组学分析方法对结果进行分析。结果本实验共鉴定出568个蛋白,汇总筛选出变化趋势相同的蛋白共得到110个共同差异蛋白。剔除变化小于1.5倍(包括1.5倍)的蛋白,得到上调蛋白18个,下调蛋白11个。STRING网络互作分析得到Pkm、Pgam2、Aldoa、Pygm、Serpina3n、Hp、A2m、Fgg、Fn1、Lcn2、Adssl1、Pvalb、Serpina6、Afm处于关键节点。差异蛋白KEGG通路富集结果糖酵解/糖异生、胰高血糖素信号通路、碳代谢、癌症中的中枢碳代谢均为与糖代谢有关的通路。结论糖酵解对挤压伤的进展有重要意义,相关糖代谢酶类Aldoa、Pgam2、Pkm及14-3-3蛋白ε、维生素E结合蛋白可能对判断疾病进程有一定参考价值,CK作为既往血液指标与疾病进程相关。血清白蛋白可能在治疗挤压伤中有一定作用。