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基于机器学习方法筛选IgA肾病铁死亡关键基因
1
作者
杨柏新
付少杰
+2 位作者
闫冀
贾冶
徐弘昭
《中国实验诊断学》
2023年第10期1160-1169,共10页
目的本研究利用机器学习探索IgA肾病(IgAN)铁死亡的潜在诊断标志物及其生物学过程,并研究其与IgAN免疫细胞浸润的关系。方法从GEO数据库中下载来自IgAN患者和对照组的肾小球组织的微阵列数据集(GSE93798,GSE104948),通过FerrDb数据库获...
目的本研究利用机器学习探索IgA肾病(IgAN)铁死亡的潜在诊断标志物及其生物学过程,并研究其与IgAN免疫细胞浸润的关系。方法从GEO数据库中下载来自IgAN患者和对照组的肾小球组织的微阵列数据集(GSE93798,GSE104948),通过FerrDb数据库获取全部铁死亡相关基因数据,获得IgAN组和对照组中有差异表达的铁死亡相关基因(P<0.05)。用LASSO回归、支持向量机和随机森林三种机器学习策略来确定潜在的IgAN铁死亡诊断标志物。为了评估这些潜在生物标志物的诊断效果,分别绘制了训练集和验证集的ROC曲线。此外,还采用CIBERSORT算法评估了IgAN肾组织的免疫细胞浸润情况,并研究了生物标志物和免疫细胞浸润之间的关系。结果共鉴定出157个IgAN组中的差异表达基因分析(DEGs);其中64个基因明显上调,93个基因明显下调。IgAN组和对照组中有特别显著差异表达的铁死亡相关基因52个。使用LASSO回归、支持向量机和随机森林三种机器学习策略最终确定了ZFP36被鉴定为IgAN的潜在诊断标志物。ZFP36在训练集的ROC曲线下面积为0.874,在验证集的ROC曲线下面积为0.874。免疫细胞浸润分析结果表明,静止树突细胞、中性粒细胞、单核细胞和静止的NK细胞可能参与了IgAN的发展。此外,ZFP36与这些免疫细胞亚型有不同程度的关联。结论铁死亡与IgAN的发生发展密切相关。ZFP36作为IgAN铁死亡的潜在诊断标志物,将为IgAN的诊断、治疗及预防提供新的靶点。
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关键词
IGA肾病
铁死亡
机器学习
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职称材料
益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎疗效观察
被引量:
4
2
作者
任永强
陈曦
+1 位作者
曹亚南
魏雅娟
《临床合理用药杂志》
2020年第4期78-80,共3页
目的观察益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎的临床疗效。方法选取2012年11月-2017年1月武警北京总队医院收治的慢性肾小球肾炎患者146例,根据治疗方法不同分为观察组80例和对照组66例。对照组给予替米沙坦治疗,观察组在对照...
目的观察益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎的临床疗效。方法选取2012年11月-2017年1月武警北京总队医院收治的慢性肾小球肾炎患者146例,根据治疗方法不同分为观察组80例和对照组66例。对照组给予替米沙坦治疗,观察组在对照组治疗的基础上联合益肾化湿颗粒治疗。比较2组治疗6个月和12个月临床疗效及生化指标。结果治疗6个月后,2组总有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。治疗12个月后,观察组总有效率为93.75%高于对照组的75.76%,24 h尿蛋白水平低于对照组,e GFR高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);观察组治疗12个月总有效率为93.75%高于治疗6个月的83.75%(P<0.05),24 h尿蛋白水平低于治疗6个月(P<0.05),观察组治疗12个月与治疗6个月e GFR比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论替米沙坦联合益肾化湿颗粒治疗慢性肾小球肾炎效果好,可显著改善患者临床症状,保护肾功能,且随着治疗时间的延长,作用更加显著。
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关键词
慢性肾小球肾炎
益肾化湿颗粒
替米沙坦
临床疗效
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职称材料
题名
基于机器学习方法筛选IgA肾病铁死亡关键基因
1
作者
杨柏新
付少杰
闫冀
贾冶
徐弘昭
机构
武警吉林省总队医院肾病科
吉林
大学第一
医院
肾病科
德惠市人民
医院
出处
《中国实验诊断学》
2023年第10期1160-1169,共10页
基金
吉林省自然科学基金(YDZJ202201ZYTS126)
文摘
目的本研究利用机器学习探索IgA肾病(IgAN)铁死亡的潜在诊断标志物及其生物学过程,并研究其与IgAN免疫细胞浸润的关系。方法从GEO数据库中下载来自IgAN患者和对照组的肾小球组织的微阵列数据集(GSE93798,GSE104948),通过FerrDb数据库获取全部铁死亡相关基因数据,获得IgAN组和对照组中有差异表达的铁死亡相关基因(P<0.05)。用LASSO回归、支持向量机和随机森林三种机器学习策略来确定潜在的IgAN铁死亡诊断标志物。为了评估这些潜在生物标志物的诊断效果,分别绘制了训练集和验证集的ROC曲线。此外,还采用CIBERSORT算法评估了IgAN肾组织的免疫细胞浸润情况,并研究了生物标志物和免疫细胞浸润之间的关系。结果共鉴定出157个IgAN组中的差异表达基因分析(DEGs);其中64个基因明显上调,93个基因明显下调。IgAN组和对照组中有特别显著差异表达的铁死亡相关基因52个。使用LASSO回归、支持向量机和随机森林三种机器学习策略最终确定了ZFP36被鉴定为IgAN的潜在诊断标志物。ZFP36在训练集的ROC曲线下面积为0.874,在验证集的ROC曲线下面积为0.874。免疫细胞浸润分析结果表明,静止树突细胞、中性粒细胞、单核细胞和静止的NK细胞可能参与了IgAN的发展。此外,ZFP36与这些免疫细胞亚型有不同程度的关联。结论铁死亡与IgAN的发生发展密切相关。ZFP36作为IgAN铁死亡的潜在诊断标志物,将为IgAN的诊断、治疗及预防提供新的靶点。
关键词
IGA肾病
铁死亡
机器学习
Keywords
immunoglobin A nephropathy
ferroptosis
machine learning strategies
分类号
R589.9 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎疗效观察
被引量:
4
2
作者
任永强
陈曦
曹亚南
魏雅娟
机构
武警
北京
总队
医院
西区门诊部
武警吉林省总队医院肾病科
出处
《临床合理用药杂志》
2020年第4期78-80,共3页
文摘
目的观察益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎的临床疗效。方法选取2012年11月-2017年1月武警北京总队医院收治的慢性肾小球肾炎患者146例,根据治疗方法不同分为观察组80例和对照组66例。对照组给予替米沙坦治疗,观察组在对照组治疗的基础上联合益肾化湿颗粒治疗。比较2组治疗6个月和12个月临床疗效及生化指标。结果治疗6个月后,2组总有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。治疗12个月后,观察组总有效率为93.75%高于对照组的75.76%,24 h尿蛋白水平低于对照组,e GFR高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);观察组治疗12个月总有效率为93.75%高于治疗6个月的83.75%(P<0.05),24 h尿蛋白水平低于治疗6个月(P<0.05),观察组治疗12个月与治疗6个月e GFR比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论替米沙坦联合益肾化湿颗粒治疗慢性肾小球肾炎效果好,可显著改善患者临床症状,保护肾功能,且随着治疗时间的延长,作用更加显著。
关键词
慢性肾小球肾炎
益肾化湿颗粒
替米沙坦
临床疗效
分类号
R692.31 [医药卫生—泌尿科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于机器学习方法筛选IgA肾病铁死亡关键基因
杨柏新
付少杰
闫冀
贾冶
徐弘昭
《中国实验诊断学》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
益肾化湿颗粒联合替米沙坦治疗慢性肾小球肾炎疗效观察
任永强
陈曦
曹亚南
魏雅娟
《临床合理用药杂志》
2020
4
下载PDF
职称材料
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