胶质瘤细胞H4中与多梳蛋白NSPc1相互作用的长链非编码RNA的鉴定

【目的】鉴定胶质瘤H4细胞系中与多梳家族(polycomb group)蛋白NSPc1可能相互作用的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)。【方法】在胶质瘤H4细胞系中,利用RNA结合蛋白免疫共沉淀RIP(RNA binding protein immunoprecipitation,IP)技术联合实时定量PCR技术在生物信息学预测与NSPc1蛋白结合评分较高的候选lnc RNAs中验证相互作用的lnc RNAs。【结果】鉴定出MALAT1、MEG3和SOX2OT可能与NSPc1蛋白相互作用。【结论】胶质瘤细胞中多梳蛋白NSPc1可能通过与lnc RNAs相互作用参与着肿瘤的发生发展、迁移、侵袭甚至肿瘤干细胞干性的维持。