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皱纹盘鲍4个群体与九孔鲍16S rRN A基因遗传差异分析
被引量:
1
1
作者
陈丽
申欣
+3 位作者
向治楚
秦银银
林权享
孟学平
《水产科学》
CAS
北大核心
2014年第11期702-707,共6页
采用PCR方法扩增了皱纹盘鲍(4个群体)和九孔鲍(1个群体)共5个群体(53个样本)16S rRNA基因片段(16S),测序获得了1000 bp核苷酸序列,其中669 bp核苷酸序列用于遗传差异分析,旨在评估我国皱纹盘鲍不同群体间及其与九孔鲍间的遗...
采用PCR方法扩增了皱纹盘鲍(4个群体)和九孔鲍(1个群体)共5个群体(53个样本)16S rRNA基因片段(16S),测序获得了1000 bp核苷酸序列,其中669 bp核苷酸序列用于遗传差异分析,旨在评估我国皱纹盘鲍不同群体间及其与九孔鲍间的遗传差异。从52个序列中共检测到17种单倍型,其中皱纹盘鲍4个群体有13种单倍型,九孔鲍1个群体(9个样本)有4种单倍型。单倍型核苷酸序列比对显示,变异位点占比对位点的20.5%,基于单倍型的皱纹盘鲍4个群体间的遗传距离为0.002~0.011,平均为0.005;九孔鲍群体内的平均遗传距离为0.004,两种鲍间的平均遗传距离为0.218;两种鲍间的遗传分化系数 F‐统计量 FST平均为0.982,皱纹盘鲍4群体间的 FST值为0.0051~0.0065。本研究显示2种鲍群体内16S变异很小。系统发育分析鲍属11种鲍的聚类关系,显示皱纹盘鲍与盘鲍、日本鲍交叉聚为一支,九孔鲍与杂色鲍也交叉聚为一支,4个种类未聚成单系支。
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关键词
皱纹盘鲍
九孔鲍
16S
RRNA基因
遗传差异
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职称材料
题名
皱纹盘鲍4个群体与九孔鲍16S rRN A基因遗传差异分析
被引量:
1
1
作者
陈丽
申欣
向治楚
秦银银
林权享
孟学平
机构
江
苏
省
海洋
资源开发研究院
江办省海洋生物产业技术协同创新中心
淮海工学院
海洋
学院
出处
《水产科学》
CAS
北大核心
2014年第11期702-707,共6页
基金
江苏省自然科学基金资助项目(BK20131210)
连云港市产学研联合研究项目(CXY1219)
+2 种基金
江苏省海洋资源开发研究院科技开放基金资助项目(JSIMR11B19)
江苏省水产三新工程重大项目(DY2012-4-2)
江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
文摘
采用PCR方法扩增了皱纹盘鲍(4个群体)和九孔鲍(1个群体)共5个群体(53个样本)16S rRNA基因片段(16S),测序获得了1000 bp核苷酸序列,其中669 bp核苷酸序列用于遗传差异分析,旨在评估我国皱纹盘鲍不同群体间及其与九孔鲍间的遗传差异。从52个序列中共检测到17种单倍型,其中皱纹盘鲍4个群体有13种单倍型,九孔鲍1个群体(9个样本)有4种单倍型。单倍型核苷酸序列比对显示,变异位点占比对位点的20.5%,基于单倍型的皱纹盘鲍4个群体间的遗传距离为0.002~0.011,平均为0.005;九孔鲍群体内的平均遗传距离为0.004,两种鲍间的平均遗传距离为0.218;两种鲍间的遗传分化系数 F‐统计量 FST平均为0.982,皱纹盘鲍4群体间的 FST值为0.0051~0.0065。本研究显示2种鲍群体内16S变异很小。系统发育分析鲍属11种鲍的聚类关系,显示皱纹盘鲍与盘鲍、日本鲍交叉聚为一支,九孔鲍与杂色鲍也交叉聚为一支,4个种类未聚成单系支。
关键词
皱纹盘鲍
九孔鲍
16S
RRNA基因
遗传差异
Keywords
H aliotis discus hannai
H .diversicolor supertexta
16S rRNA gene
genetic variation
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
皱纹盘鲍4个群体与九孔鲍16S rRN A基因遗传差异分析
陈丽
申欣
向治楚
秦银银
林权享
孟学平
《水产科学》
CAS
北大核心
2014
1
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