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猪THRSP基因多态性及其与肉质性状的关联分析
1
作者
李钰洁
周佳伟
+7 位作者
张宇
李梓芃
乔木
张志红
吴俊静
彭先文
梅书棋
徐忠
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期145-149,共5页
肉品质是猪重要经济性状之一,受到人们的广泛关注,而THRSP基因是已知的与肉质性状相关的基因。本研究在硒都黑猪中利用Sanger测序检测THRSP基因内的SNP位点,并与肉质性状进行关联分析,旨在为猪育种工作提供新的分子标记。结果发现,在TH...
肉品质是猪重要经济性状之一,受到人们的广泛关注,而THRSP基因是已知的与肉质性状相关的基因。本研究在硒都黑猪中利用Sanger测序检测THRSP基因内的SNP位点,并与肉质性状进行关联分析,旨在为猪育种工作提供新的分子标记。结果发现,在THRSP基因的第1外显子区域检测到5个SNPs位点,其中rs81214375 G>A与肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)含量和水分性状显著相关,rs3475235261 G>A和rs3474350215 A>T与肉色评分L1h、肉色评分L24h显著关联。本研究可为猪肉质性状的改良提供新的研究思路。
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关键词
猪
THRSP基因
肉质性状
SNP
肌内脂肪含量
下载PDF
职称材料
硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测
2
作者
任双
吴俊静
+5 位作者
彭先文
张志红
周佳伟
梅书棋
乔木
杜志强
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期116-121,128,共7页
本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生...
本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区,根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物,以硒都黑猪血液基因组DNA为模板,通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体,以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测,并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明,NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290~+109bp的位置(ATG作为+1),该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。
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关键词
硒都黑猪
NT5C1A
核心启动子区
转录因子
生物信息学
下载PDF
职称材料
题名
猪THRSP基因多态性及其与肉质性状的关联分析
1
作者
李钰洁
周佳伟
张宇
李梓芃
乔木
张志红
吴俊静
彭先文
梅书棋
徐忠
机构
动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室
武汉轻工大学动物科学与营养工程学院湖北省家畜种业技术创新中心
江夏区农业农村局农业行政执法大队
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期145-149,共5页
基金
湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003)
武汉市重大专项(202202130202485)
+4 种基金
湖北省科技重大专项项目(2021ABA005)
国家生猪产业技术体系(CARS-35)
湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2021-620-000-001-018)
湖北省自然科学基金项目(2022CFB918)
湖北省科技创新团队项目。
文摘
肉品质是猪重要经济性状之一,受到人们的广泛关注,而THRSP基因是已知的与肉质性状相关的基因。本研究在硒都黑猪中利用Sanger测序检测THRSP基因内的SNP位点,并与肉质性状进行关联分析,旨在为猪育种工作提供新的分子标记。结果发现,在THRSP基因的第1外显子区域检测到5个SNPs位点,其中rs81214375 G>A与肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)含量和水分性状显著相关,rs3475235261 G>A和rs3474350215 A>T与肉色评分L1h、肉色评分L24h显著关联。本研究可为猪肉质性状的改良提供新的研究思路。
关键词
猪
THRSP基因
肉质性状
SNP
肌内脂肪含量
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测
2
作者
任双
吴俊静
彭先文
张志红
周佳伟
梅书棋
乔木
杜志强
机构
长江大学动物科学技术学院
湖北省
农业
科学院畜牧兽医研究所
江夏区农业农村局农业行政执法大队
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期116-121,128,共7页
基金
湖北省自然科学基金杰出青年项目(2023AFA091)
国家重点研发计划项目(2021YFD1301101)
+1 种基金
国家生猪产业技术体系项目(CARS-35)
湖北洪山实验室重大项目(2021hszd 003)。
文摘
本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区,根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物,以硒都黑猪血液基因组DNA为模板,通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体,以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测,并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明,NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290~+109bp的位置(ATG作为+1),该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。
关键词
硒都黑猪
NT5C1A
核心启动子区
转录因子
生物信息学
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪THRSP基因多态性及其与肉质性状的关联分析
李钰洁
周佳伟
张宇
李梓芃
乔木
张志红
吴俊静
彭先文
梅书棋
徐忠
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测
任双
吴俊静
彭先文
张志红
周佳伟
梅书棋
乔木
杜志强
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
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