《临床检验杂志》创建过程的回忆

《临床检验杂志》走过了30年的历程,现已成为中国科技论文统计源期刊,中国科学引文数据库医学类核心期刊,中国临床医学、特种医学核心期刊和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊以及中国生物医学核心期刊,中国期刊网、中国学术期刊光盘版全文收录期刊等。作为＂双效期刊＂,2001年进入全国期刊方阵,2005年成为国家期刊奖百种重点期刊,在学术地位上列于国内同类检验杂志的前列。受到我国广大检验工作者的欢迎和好评。

新型冠状病毒核酸全自动PCR检测系统临床应用江苏专家共识

核酸检测作为新型冠状病毒感染筛查和确诊的最重要依据,在疫情防控中发挥着至关重要的作用。新型冠状病毒核酸全自动聚合酶链反应(PCR)检测系统(简称新冠核酸全自动PCR检测系统)集样本识别和转移、核酸提取和纯化、体系构建、基因扩增和检测为一体或组合为一体,实现了核酸检测全过程的自动化,减少了常规新型冠状病毒核酸检测中复杂的人工操作步骤,提高了检测效率和准确率;可适用于急诊、发热门诊、常规以及大规模核酸检测等多种应用场景。然而,在新型冠状病毒核酸检测从“手工—半自动”向“全自动”过渡的过程中出现了一些新问题,需要探讨和解决。为规范新冠核酸全自动PCR检测系统在临床中的使用,该文从实验室的资质要求、人员要求、实验室的设置、仪器设备、试剂耗材、检验前过程、检验过程以及检验后过程等方面,对该系统的临床应用提出江苏省检验界的专家共识。

肿瘤二代测序生物信息学分析规范化管理江苏专家共识

生物信息学分析是二代测序(NGS)技术中不可缺失的重要组成部分,对最终检测结果的准确性起决定性作用。目前各种生物信息分析软件和数据库参差不齐、分析流程的建立及其验证尚无统一认识、质量控制和管理规范缺乏统一标准,以致对同一份NGS测序数据,由于生物信息学分析差异产生不同的分析结果,进而影响临床诊疗决策。为此,特制定本专家共识,以推动肿瘤NGS生物信息学分析过程的规范管理。

食管癌患者循环DNA的定量分析及其临床应用价值

目的探讨食管癌患者循环DNA的来源、临床应用价值及可能的影响因素。方法收集53例食管癌患者术前和术后2h的静脉血，用SYBR green I荧光染色法和检测CEA—mRNA表达的实时荧光定量RT—PCR法，分别检测血浆中的DNA水平和循环中的肿瘤细胞数。结果食管癌组术前循环DNA水平为（67，46±59．78）μg／L，显著高于良性肿瘤组（23．52±22．94）μg／L和健康组（11．97±12．35）μg／L，均P〈0．001，ROC曲线下的面积为0，798。术后DNA水平迅速上升．达（122，36±71．41）μg／L，显著高于手术前（P〈0．001）。CEA mRNA^＋循环肿瘤细胞数在术后也显著高于手术前，其中位数水平分别为1513（95％CI，660～7974）／ml全血和188（95％CI，155～498）／ml全血，P〈0．01。血浆DNA水平与循环肿瘤细胞数之间．无论在术前还是术后均无显著性关联（r=0．200，P=0．156和r=0．206，P=0．138），与临床病理分期也无相关性（r〈0．030．P〉0．05）。结论食管癌患者循环DNA水平增高，可为疾病诊断提供一定的辅助信息，但没有足够的敏感性和特异性成为诊断或监测癌症的独立标志物。

葡萄球菌粘质的检测及临床意义

葡萄球菌粘质的检测及临床意义程梅（江苏省临床检验中心，２１０００９）赵旺盛（江苏省人民医院）我们收集临床上引起感染的葡萄球菌苗株１２０株，正常人体表的凝固酶阴性葡萄球菌（ＣＮＳ）２０株，检测其胞外粘质物（ＥＳＳ）产生情况并对临床感染菌株做药敏试验，结...

基于TCGA数据筛选乳腺癌预后相关的tsRNA标志物

目的筛选乳腺癌中差异表达的转运RNA衍生小RNA(tsRNA),构建与乳腺癌患者预后相关的预测模型。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者的tsRNA表达谱以及临床相关数据,利用最小绝对值收敛和选择算子算法(LASSO)筛选出关键tsRNA,构建风险评分模型和列线图预测模型。结果从乳腺癌差异表达的106条tsRNA中识别了11条非零系数的tsRNA,据此构建了评估乳腺癌预后的风险评分模型和列线图预测模型,经测试集和校准曲线证实两模型均具有良好的预测能力。进一步预测上述11条tsRNA的靶基因,发现其富集了8条KEGG通路,包括多条与肿瘤的进展相关的通路;经相关性分析发现,NR2C2和ZNFX1与tRF-21-YBOZZ7ND的表达水平呈负相关。结论成功构建了风险评分模型和列线图预测模型,有望为乳腺癌的预后评估提供新的方法。

中国临床实验室标本可接受性质量指标室间质量调查研究

目的分析中国临床实验室标本可接受性质量指标(QI)的现状并制定初步质量规范。方法使用基于Web的室间质量评价软件,收集从2015年~2017年(截至6月15日)参加"临床检验专业医疗质量控制指标"室间质评的实验室数据,包括2015年1次,2016年2次和2017年1次的标本类型错误率、标本容器错误率、标本采集量错误率和抗凝标本凝集率。用率和西格玛两种方式度量评价。采用各指标总体分布的P25和P75制定初步的高、中等和低性能规范。结果分别有5 346,7 593,5 950和6 874家实验室回报了有效数据。生化(除标本采集量错误率外)、免疫和微生物专业4项指标的P50达到6σ水平。临检专业除标本容器错误率外,其它指标的P50为4σ~6σ水平不等。连续3年的QI数据没有明显变化。以2017年第一次结果为依据制定初步质量规范,标本类型错误率的P25为0,P75为0.084 4%;标本容器错误率的P25为0,P75为0.047 6%;标本采集量错误率的P25为0,P75为0.114 2%;抗凝标本凝集率的P25为0,P75为0.0784%。结论大部分实验室生化、免疫和微生物4项指标表现良好,临检专业有待加强。实验室应加强信息系统建设,保证采集数据真实可靠,从而长期纵向监控实现质量改进。

2016—2020年江苏地区血培养分离菌的耐药性变迁

目的分析江苏地区血培养常见分离菌的构成及耐药性变迁。方法对2016—2020年纳入“江苏省细菌耐药监测网”的155所医院的血培养分离菌,采用纸片扩散法或自动化仪器法进行药物敏感性试验,按CLSI 2020年版标准判断结果,用WHONET 5.6软件进行统计分析。结果收集血培养分离菌167755株,前5位常见分离菌属排序无变化,分别为凝固酶阴性葡萄球菌(32.1%~37.2%)、大肠埃希菌(20.8%~23.3%)、克雷伯菌属(9.5%~12.8%)、金黄色葡萄球菌(6.3%~7.1%)和肠球菌属(4.3%~4.9%)。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)、耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)检出率逐年下降。未检出对万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁耐药的葡萄球菌。屎肠球菌和粪肠球菌对万古霉素的敏感率均超过97%。大肠埃希菌对碳青霉烯类、阿米卡星、哌拉西林-他唑巴坦、替加环素的耐药率均≤5%。肺炎克雷伯菌对头孢曲松、头孢吡肟和碳青霉烯类药物的耐药率不断升高。铜绿假单胞菌对阿米卡星、庆大霉素和多黏菌素B的耐药率均低于10%。鲍曼不动杆菌对大部分监测的抗菌药物的耐药率都高于60%,但对多黏菌素B的耐药率低于8%。结论江苏地区血培养常见分离菌构成基本稳定,革兰阳性耐药菌(MRSA、MRCNS和VRE)检出率呈逐年下降趋势,耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌检出率增长明显,耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌的检出率变化不大。

血清可溶性CD44变异性外显子6测定对结直肠癌的临床意义

目的 探讨血清可溶性CD4 4变异性外显子 6 (sCD4 4v6 )对结直肠癌的临床应用价值。方法 96例不同Dukes 分期结直肠癌患者和 2 4例健康者 ,分别采用 (ELISA)定量检测血清sCD4 4v6含量 ,时间分辨免疫荧光法检测CEA含量 ,并结合临床资料进行分析。结果 结直肠癌患者sCD4 4v6浓度为 (2 75 .3± 1 1 5 .8)ng/ml,显著高于健康对照组 (6 1 .3± 7.8)ng/ml,P <0 .0 5 ,若以健康对照组的 x +2s(76 .9ng/ml)作为正常值上限 ,阳性率为 74 .0 % ;sCD4 4v6水平随癌肿分期和肿瘤转移呈现递增趋势 (P <0 .0 5 )。与CEA相比 ,sCD4 4v6水平在反映癌组织浸润和转移程度上更敏感。结论 结直肠癌患者sCD4 4v6水平和阳性率均显著增高 ,并与肿瘤分期和扩散转移相关 ;术前血清sCD4

2017年江苏地区碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的分布特点和耐药性分析

目的了解2017年"江苏省细菌耐药监测网"耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)的分布特点及其耐药性。方法收集2017年1月至12月监测网内10 560株CRE菌株,药物敏感性试验采用纸片扩散法(K-B法)和自动化仪器MIC法,结果判断参照2017年版美国临床和实验室标准化协会(CLSI)M100-S27标准。结果 10 560株CRE菌株中,克雷伯菌属、大肠埃希菌、肠杆菌属分别占57.6%、12.3%、9.8%;标本来源和科室分布最多者为呼吸道标本(占59.4%)和重症监护室(占31.5%);全省CRE的平均检出率为8.4%,其中徐州地区高达16.3%,泰州仅为4.0%。CRE菌株对多种临床常用抗菌药物高度耐药,除阿米卡星的耐药率(42.7%)较低外,对其他抗菌药物的耐药率为56.0%~94.6%;儿童分离菌株对氨曲南、阿米卡星、庆大霉素、环丙沙星、妥布霉素的耐药率均低于成人分离株,差异有统计学意义(P<0.01);但对氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林、头孢他啶、头孢西丁、亚胺培南的耐药率却高于成人分离株,差异有统计学意义(P<0.01)。结论 CRE菌株对多数临床常用抗菌药物呈高度耐药,菌株分布呈现地区和院内不同病区的差异性。应对之进行流行病学调查,并采取有效的感染防控措施以遏制其在医院中的播散。

临床化学常规项目检测结果的可比性调查

目的探讨临床化学常规项目检验结果的室间可比性。方法用新鲜混合人血清,对44家医院进行17项临床化学检验的现场调查。结果在常规条件下,不同项目的室间平均变异系数(CV%)为9.52%;各实验室用各自的校准品校准后,室间平均CV%为9.22%;用同一批号的cfas校准品校准后,室间平均CV%为9.44%;用赋值的新鲜混合人血清校准后,室间平均CV%为4.10%。结论用赋值的新鲜混合人血清校准实验室的日常检测工作,可明显提高检验结果的室间可比性。

循环肿瘤细胞在临床应用中的挑战

循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)的临床应用价值已经得到广泛认可,尤其作为"液体活检"的主要资源用于肿瘤精准医疗备受关注。然而,CTCs在患者血液中的含量极为稀少,灵敏度一直是CTCs检测及应用的主要瓶颈。目前,CTCs分离、富集、体外原代培养技术,获得细胞的生物学特性研究及其临床应用价值都还在不断探索和发展中,对它们的深层次和全方位的分析将有助于指导并推动CTCs的临床应用。

宏基因组测序技术检测感染性病原体江苏专家共识(2020版)

宏基因组测序(mNGS)基于宏基因组学和高通量测序技术,可检测并分析各种临床来源样本中细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体/衣原体等所有已知及未知的病原体,特别是未知新发病原体(如新型冠状病毒等)。该技术规避了绝大多数病原体不能培养或难培养的缺点,可直接检测临床样本中的病原体核酸,解决了新发或突发、复杂或混合感染、罕见病原体鉴定难的问题。该文从实验室建设的基本要求、实验方法学的性能确认、质量控制体系的建立和健全、结果的分析和解读及在感染性疾病诊断中的价值等方面,对mNGS技术用于感染性病原体检测作一共识。

2016—2018年江苏省血液EGFR基因突变检测室间质量评价

目的 对 2016—2018年江苏省血液表皮生长因子受体( EGFR )基因突变检测室间质量评价的总体情况及存在问题进行分析和探讨,为临床实验室检测流程的规范和检测质量的保证提供依据。方法 室间质评每年1次,2016年样本盘为4支cfDNA(cell-free DNA)样本,2017和2018年样本盘均为5支含cfDNA的血浆样本,要求各参评实验室收到样本后在规定的时间内检测并将所需填报的信息及测定结果上传至江苏省临床检验中心数据库;依据回报结果计算各实验室的成绩,分析每批样本的总体符合率、假阴性率、假阳性率及问题与风险。结果 3次室间质评分别收到10份、16份和20份有效回报结果。检测结果完全符合的实验室分别为30.0%(3/10)、37.5%(6/16)和10.0%(2/20);以得分≥80分为合格,合格率分别为90.0%(9/10)、56.2%(9/16)和50.0%(10/20);假阴性率分别为70.0%(7/10)、56.2%(9/16)和88.9%(16/18),而假阳性率分别为0%(0/10)、25.0%(4/16)和22.2%(4/18)。测定方法敏感性和cfDNA提取效率不高是假阴性的主要原因,污染和阈值设置缺乏验证是假阳性的主要原因。结论 针对血液标本的肿瘤相关基因突变检测需选择高敏感性测定方法、优化核酸提取效率、规范检验流程和强化结果的分析和验证。

长三角地区医学实验室检验同质化管理现状及对策

目的 明确长三角地区医学实验室检验同质化管理的内涵、目标和实现路径,以推进长三角地区检验结果互认。方法 采用文献法、专家访谈法和问卷调查法对当前长三角地区医学实验室检验同质化管理现状及存在的问题和困难进行梳理。结果 当前长三角地区已开展小范围的检验同质化管理工作,但仍存在一定的问题和困难,如缺少统一的质量管理标准、基层医疗卫生机构发展受限、牵头医院帮扶力度较弱、信息数据无法大范围互认共享等。结论 长三角地区医学实验室检验同质化管理正以局部作为试点,并逐渐由点成片,未来需要重视分层管理、标准引领、学科带动、考核激励、政策加持、信息支撑、研究创新等方面,以进一步提升长三角地区检验质量,推进检验结果互认,促进长三角地区卫生健康一体化发展。

血液HBsAg、抗HCV复检中应采用不同试剂和设置低限灰区

临床用血前复检采用不同试剂和设置低限灰区，可有效地防止ＨＢｓＡｇ和抗ＨＣＶ的漏检，减少输血后肝炎的发生。随机抽取被淘汰血液的部分标本进行ＰＣＲ检测，发现ＥＬＩＳＡ阳性及灰区标本均有一定的阳性率（ＨＢｓＡｇ为５７％，抗ＨＣＶ为２１％）。