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甘薯等10种作物基因的生物信息学分析
1
作者
杨冬静
徐振
+3 位作者
张成玲
孙厚俊
赵永强
谢逸萍
《江西农业学报》
CAS
2017年第11期7-12,20,共7页
采用生物信息学相关软件对甘薯等10种NAC1蛋白的氨基酸序列及其理化性质、磷酸化位点、疏水性或亲水性、二级结构和三级结构、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位以及保守结构域等进行了预测和分析。结果表明:供试10种NAC1蛋白的磷酸化位...
采用生物信息学相关软件对甘薯等10种NAC1蛋白的氨基酸序列及其理化性质、磷酸化位点、疏水性或亲水性、二级结构和三级结构、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位以及保守结构域等进行了预测和分析。结果表明:供试10种NAC1蛋白的磷酸化位点主要为丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸;这些NAC1蛋白均为亲水性蛋白,属于非分泌蛋白,不具有信号肽,没有明显的跨膜结构域;在它们的二级结构中,无规则卷曲所占比例最高;MtNAC1和CaNAC1可能定位于叶绿体,NtNAC1和GmNAC1可能定位于线粒体,甘薯及其他6种作物的NAC1蛋白可能定位于细胞核;甘薯等NAC1蛋白的三级结构与水稻NAC1蛋白具有一定的相似性;10种NAC1蛋白均含有1个NAM(No apical meristem)功能结构域。氨基酸序列比对和进化树分析显示IbNAC1与CaNAC1的亲缘关系最近。
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关键词
甘薯
NAC1
生物信息学
功能结构域
亚细胞定位
基因
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职称材料
不同培养基对甘薯干腐病菌产孢的影响
被引量:
1
2
作者
杨冬静
孙厚俊
+2 位作者
张成玲
徐振
谢逸萍
《金陵科技学院学报》
2017年第3期51-54,共4页
为明确甘薯干腐病病原物腐皮镰刀菌的产孢条件,采用马铃薯蔗糖和改良的绿豆汁培养基进行摇培,结果表明:25℃摇培条件下马铃薯蔗糖液体培养基摇培产孢数量远远多于4种绿豆汁培养基,而随着绿豆添加量的增加,产孢量也随之增加;此外,马铃薯...
为明确甘薯干腐病病原物腐皮镰刀菌的产孢条件,采用马铃薯蔗糖和改良的绿豆汁培养基进行摇培,结果表明:25℃摇培条件下马铃薯蔗糖液体培养基摇培产孢数量远远多于4种绿豆汁培养基,而随着绿豆添加量的增加,产孢量也随之增加;此外,马铃薯蔗糖培养基产生的孢子都是大小均匀形态整齐的镰刀状孢子,而4种不同绿豆添加量的培养基产生的孢子有小型分生孢子,也有大型镰刀状孢子。研究明确了该病原菌的产孢条件,为甘薯干腐病抗病鉴定和室内药剂筛选中孢子萌发抑制等研究奠定基础。
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关键词
腐皮镰刀菌
产孢
绿豆汤培养基
马铃薯蔗糖培养基
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职称材料
解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)XZ-1发酵条件的优化
被引量:
6
3
作者
杨冬静
赵永强
+3 位作者
孙厚俊
张成玲
徐振
谢逸萍
《江西农业学报》
CAS
2017年第10期35-39,共5页
采用单因素试验和正交试验,对解淀粉芽孢杆菌菌株XZ-1的发酵培养基成分和发酵条件进行了优化。结果表明:XZ-1的发酵培养基的最佳碳源、氮源和无机盐分别为糊精、蛋白胨和氯化钾;其培养基最佳组分为糊精10 g/L,蔗糖5 g/L,蛋白胨10 g/L,...
采用单因素试验和正交试验,对解淀粉芽孢杆菌菌株XZ-1的发酵培养基成分和发酵条件进行了优化。结果表明:XZ-1的发酵培养基的最佳碳源、氮源和无机盐分别为糊精、蛋白胨和氯化钾;其培养基最佳组分为糊精10 g/L,蔗糖5 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠7 g/L;最佳发酵培养条件为培养基初始p H值6,发酵温度27℃,发酵时间36 h,装液量100 m L/250 m L,接种量3%,转速150 r/min。
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关键词
解淀粉芽孢杆菌
单因素试验
正交试验
发酵条件
优化
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职称材料
题名
甘薯等10种作物基因的生物信息学分析
1
作者
杨冬静
徐振
张成玲
孙厚俊
赵永强
谢逸萍
机构
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
出处
《江西农业学报》
CAS
2017年第11期7-12,20,共7页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-11-B-09)
江苏省政府留学奖学金项目(JS-2014-120)
教育部农作物生物灾害综合治理重点实验室/农业部华东作物有害生物综合治理重点实验室开放基金项目
文摘
采用生物信息学相关软件对甘薯等10种NAC1蛋白的氨基酸序列及其理化性质、磷酸化位点、疏水性或亲水性、二级结构和三级结构、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位以及保守结构域等进行了预测和分析。结果表明:供试10种NAC1蛋白的磷酸化位点主要为丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸;这些NAC1蛋白均为亲水性蛋白,属于非分泌蛋白,不具有信号肽,没有明显的跨膜结构域;在它们的二级结构中,无规则卷曲所占比例最高;MtNAC1和CaNAC1可能定位于叶绿体,NtNAC1和GmNAC1可能定位于线粒体,甘薯及其他6种作物的NAC1蛋白可能定位于细胞核;甘薯等NAC1蛋白的三级结构与水稻NAC1蛋白具有一定的相似性;10种NAC1蛋白均含有1个NAM(No apical meristem)功能结构域。氨基酸序列比对和进化树分析显示IbNAC1与CaNAC1的亲缘关系最近。
关键词
甘薯
NAC1
生物信息学
功能结构域
亚细胞定位
基因
Keywords
Sweet potato
NAC1
Bioinformatics
Functional domain
Subcellular localization
Gene
分类号
S531 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
不同培养基对甘薯干腐病菌产孢的影响
被引量:
1
2
作者
杨冬静
孙厚俊
张成玲
徐振
谢逸萍
机构
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
出处
《金陵科技学院学报》
2017年第3期51-54,共4页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-11-B-09)
江苏省政府留学奖学金项目(JS-2014-120)
文摘
为明确甘薯干腐病病原物腐皮镰刀菌的产孢条件,采用马铃薯蔗糖和改良的绿豆汁培养基进行摇培,结果表明:25℃摇培条件下马铃薯蔗糖液体培养基摇培产孢数量远远多于4种绿豆汁培养基,而随着绿豆添加量的增加,产孢量也随之增加;此外,马铃薯蔗糖培养基产生的孢子都是大小均匀形态整齐的镰刀状孢子,而4种不同绿豆添加量的培养基产生的孢子有小型分生孢子,也有大型镰刀状孢子。研究明确了该病原菌的产孢条件,为甘薯干腐病抗病鉴定和室内药剂筛选中孢子萌发抑制等研究奠定基础。
关键词
腐皮镰刀菌
产孢
绿豆汤培养基
马铃薯蔗糖培养基
Keywords
Fusarium solani
spore production
mung bean soup medium
potato sucrose medium
分类号
S435.31 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)XZ-1发酵条件的优化
被引量:
6
3
作者
杨冬静
赵永强
孙厚俊
张成玲
徐振
谢逸萍
机构
江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
出处
《江西农业学报》
CAS
2017年第10期35-39,共5页
基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-11-B-09)
文摘
采用单因素试验和正交试验,对解淀粉芽孢杆菌菌株XZ-1的发酵培养基成分和发酵条件进行了优化。结果表明:XZ-1的发酵培养基的最佳碳源、氮源和无机盐分别为糊精、蛋白胨和氯化钾;其培养基最佳组分为糊精10 g/L,蔗糖5 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化钠7 g/L;最佳发酵培养条件为培养基初始p H值6,发酵温度27℃,发酵时间36 h,装液量100 m L/250 m L,接种量3%,转速150 r/min。
关键词
解淀粉芽孢杆菌
单因素试验
正交试验
发酵条件
优化
Keywords
Bacillus amyloliquefaciens
Single-factor test
Orthogonal test
Fermentation condition
Optimization
分类号
S482.292 [农业科学—农药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘薯等10种作物基因的生物信息学分析
杨冬静
徐振
张成玲
孙厚俊
赵永强
谢逸萍
《江西农业学报》
CAS
2017
0
下载PDF
职称材料
2
不同培养基对甘薯干腐病菌产孢的影响
杨冬静
孙厚俊
张成玲
徐振
谢逸萍
《金陵科技学院学报》
2017
1
下载PDF
职称材料
3
解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)XZ-1发酵条件的优化
杨冬静
赵永强
孙厚俊
张成玲
徐振
谢逸萍
《江西农业学报》
CAS
2017
6
下载PDF
职称材料
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