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水稻多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白家族OsPGIP结构及基因表达特征分析
被引量:
2
1
作者
陈夕军
唐滔
+4 位作者
李丽丽
陈宸
陈煜文
张亚芳
左示敏
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1884-1893,共10页
植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibitingprotein,PGIP)可特异性识别病原菌PG(polygalacturonase),从而提高植物的抗病能力。研究表明水稻中共存在7个OsPGIP基因,为明确OsPGIP家族的蛋白质结构及基因表达特征,从水稻...
植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibitingprotein,PGIP)可特异性识别病原菌PG(polygalacturonase),从而提高植物的抗病能力。研究表明水稻中共存在7个OsPGIP基因,为明确OsPGIP家族的蛋白质结构及基因表达特征,从水稻cDNA中扩增各OsPGIP基因序列,经克隆、测序后进行生物信息学分析与蛋白质结构模拟,并测定其在生物逆境与非生物逆境胁迫下的表达量变化。经多序列比较与系统发育进化分析发现,相同或相近物种PGIP往往具有较高的相似性,虽然多数OsPGIP亲缘关系较近,但它们并不能完全聚类在一起。7个OsPGIP蛋白均具有一个信号肽和9~11个LRR片段,各LRR片段中均含有PGIP的特征结构域xxLxLxx。二级结构由α-螺旋、β-折叠和随机卷曲组成,且多以随机卷曲为主,这些二级结构以重复的随机卷曲—α-螺旋—随机卷曲—β-折叠组成线圈状结构,并按右手螺旋规则形成一个特定的凹面,负责OsPGIP与有害生物PG的互作。7个OsPGIP蛋白多较稳定,且均为疏水蛋白、脂溶性好、具有跨膜结构、定位于细胞外、有1到多个N-糖基化位点、在大肠杆菌中原核表达后基本不溶。经生物和非生物逆境处理后,水稻中不同OsPGIP基因的表达量上下调差异较大,但表达量总和明显上调,说明在逆境条件下水稻可通过调节自身OsPGIP基因的表达量,从而提高其抗逆性。
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关键词
表达特征
蛋白结构
分析
多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白
水稻
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题名
水稻多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白家族OsPGIP结构及基因表达特征分析
被引量:
2
1
作者
陈夕军
唐滔
李丽丽
陈宸
陈煜文
张亚芳
左示敏
机构
扬州大学
园艺与植物保护
学
院
江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部功能基因组学重点实验室/扬州大学
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1884-1893,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0300800)
国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08001002)资助。
文摘
植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibitingprotein,PGIP)可特异性识别病原菌PG(polygalacturonase),从而提高植物的抗病能力。研究表明水稻中共存在7个OsPGIP基因,为明确OsPGIP家族的蛋白质结构及基因表达特征,从水稻cDNA中扩增各OsPGIP基因序列,经克隆、测序后进行生物信息学分析与蛋白质结构模拟,并测定其在生物逆境与非生物逆境胁迫下的表达量变化。经多序列比较与系统发育进化分析发现,相同或相近物种PGIP往往具有较高的相似性,虽然多数OsPGIP亲缘关系较近,但它们并不能完全聚类在一起。7个OsPGIP蛋白均具有一个信号肽和9~11个LRR片段,各LRR片段中均含有PGIP的特征结构域xxLxLxx。二级结构由α-螺旋、β-折叠和随机卷曲组成,且多以随机卷曲为主,这些二级结构以重复的随机卷曲—α-螺旋—随机卷曲—β-折叠组成线圈状结构,并按右手螺旋规则形成一个特定的凹面,负责OsPGIP与有害生物PG的互作。7个OsPGIP蛋白多较稳定,且均为疏水蛋白、脂溶性好、具有跨膜结构、定位于细胞外、有1到多个N-糖基化位点、在大肠杆菌中原核表达后基本不溶。经生物和非生物逆境处理后,水稻中不同OsPGIP基因的表达量上下调差异较大,但表达量总和明显上调,说明在逆境条件下水稻可通过调节自身OsPGIP基因的表达量,从而提高其抗逆性。
关键词
表达特征
蛋白结构
分析
多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白
水稻
Keywords
expression profile
protein structure
analysis
PGIP
rice
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白家族OsPGIP结构及基因表达特征分析
陈夕军
唐滔
李丽丽
陈宸
陈煜文
张亚芳
左示敏
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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职称材料
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