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基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
被引量:
3
1
作者
鲁迪
宋佳卉
+14 位作者
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期277-285,共9页
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序...
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序平台进行高通量测序。分别采用miRBase数据库和miRDeep2工具进行已知miRNA注释和新miRNA预测,并进行差异分析。采用miRanda软件和TargetScan软件分别预测差异表达miRNA靶基因后取交集,进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,匹配可靶向决定Th17细胞和Treg细胞生成的关键转录因子(RORC和FOXP3)或重要调控通路(PI3K⁃Akt和mTOR通路)相关基因的miRNA。结果细粒棘球蚴病患者与健康对照血清中共有53个差异表达miRNA,其中47个上调表达miRNA、6个下调表达miRNA。GO富集分析显示,差异表达miRNA功能涉及DNA转录翻译、细胞成分、细胞形态、神经发育及代谢分解等过程。KEGG富集分析显示,这些差异表达miRNA靶基因涉及的主要信号通路包括MAPK、PI3K⁃Akt、mTOR等信号通路。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,有3个潜在靶向调控RORC的miRNA、15个潜在靶向PI3K⁃Akt、mTOR信号通路的miRNA。结论细粒棘球蚴感染后可使患者血清miRNA表达谱出现明显改变,差异表达miRNA可能通过靶向Th17/Treg关键转录因子或PI3K⁃Akt、mTOR通路而导致Th17/Treg免疫失衡,进而利于细粒棘球蚴在宿主体内长期寄生并慢性致病。
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关键词
细粒棘球蚴
微小RNA
辅助性T细胞17
调节性T细胞
免疫失衡
原文传递
题名
基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
被引量:
3
1
作者
鲁迪
宋佳卉
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
机构
南京
医
科
大学基础医学院
南京
医
科
大学公共卫生学院
宁夏医
科
大学医学
科
学技术
研究
中心、宁夏医学
科
学
研究
所
江苏省南京亿科人群健康研究院
宁夏常见传染病防治
研究
重点实验室、宁夏医
科
大学基础医学院
宁夏回族自治区石嘴山市疾病预防控制中心
南京
医
科
大学国际教育学院
出处
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期277-285,共9页
基金
西藏自治区科技计划项目(XZ201703⁃GB⁃01)
宁夏回族自治区重点研发项目(2018BEG02003)
宁夏回族自治区自然科学基金(2018AAC03209)。
文摘
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序平台进行高通量测序。分别采用miRBase数据库和miRDeep2工具进行已知miRNA注释和新miRNA预测,并进行差异分析。采用miRanda软件和TargetScan软件分别预测差异表达miRNA靶基因后取交集,进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,匹配可靶向决定Th17细胞和Treg细胞生成的关键转录因子(RORC和FOXP3)或重要调控通路(PI3K⁃Akt和mTOR通路)相关基因的miRNA。结果细粒棘球蚴病患者与健康对照血清中共有53个差异表达miRNA,其中47个上调表达miRNA、6个下调表达miRNA。GO富集分析显示,差异表达miRNA功能涉及DNA转录翻译、细胞成分、细胞形态、神经发育及代谢分解等过程。KEGG富集分析显示,这些差异表达miRNA靶基因涉及的主要信号通路包括MAPK、PI3K⁃Akt、mTOR等信号通路。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,有3个潜在靶向调控RORC的miRNA、15个潜在靶向PI3K⁃Akt、mTOR信号通路的miRNA。结论细粒棘球蚴感染后可使患者血清miRNA表达谱出现明显改变,差异表达miRNA可能通过靶向Th17/Treg关键转录因子或PI3K⁃Akt、mTOR通路而导致Th17/Treg免疫失衡,进而利于细粒棘球蚴在宿主体内长期寄生并慢性致病。
关键词
细粒棘球蚴
微小RNA
辅助性T细胞17
调节性T细胞
免疫失衡
Keywords
Echinococcus granulosus
microRNA
T helper type 17
regulatory T cell
Immune imbalance
分类号
R532.32 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
鲁迪
宋佳卉
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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