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长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌患者外周血中的表达
被引量:
1
1
作者
胡云
曹秀峰
唐薇薇
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期745-747,共3页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ~Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ~Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例,采用T...
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ~Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ~Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例,采用TRIzol试剂提取总RNA,将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA,纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交。两两比较筛选出相对表达量比值在2倍以上且差异有统计学意义的lncRNA作为差异表达的lncRNA。应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证lncTCONS00011689在ESCC样本中的表达情况,并分析其与ESCC患者临床病理特征及预后的关系,随访日期截止2019年12月31日。应用GraphPad Prism 5.0统计学软件分析,采用配对t检验和Log-rank生存分析。结果在组别1比对照组中上调的lncRNA有1 620条,下调的lncRNA有102条。在组别2比对照组中上调的lncRNA有17条,下调的lncRNA有129条。在组别2比组别1中上调的lncRNA有9条,下调的lncRNA有73条。生信数据分析显示这些差异表达基因的功能与细胞间相互作用、代谢、免疫应答、细胞黏附分子等功能均具有显著相关(r>0.99,P<0.05)。不同组别差异表达的lncRNA与差异表达的mRNA共表达分析显示表达结果中关联度最大的前1 000个关系对(r>0.99,P<0.05)。lncTCONS00011689在ESCC患者血浆中表达与正常人比较明显降低,其在ESCC患者血浆中的表达为5.12±0.31,在正常人血浆中的表达为4.03±0.26,差异有统计学意义(t=2.187,P<0.05)。lncTCONS00011689与ESCC临床TNM分期呈负相关(t=2.716,P<0.05),而与年龄、性别、分化程度以及淋巴结转移均无明显相关(P>0.05)。随访结果显示lncTCONS00011689表达低的ESCC患者总生存期相比于高表达的患者更短(F=0.048,P<0.05)。结论建立不同分期的ESCC患者外周血中差异lncRNA表达谱。lncTCONS00011689可作为食管鳞癌诊断、分期及预后监测的血浆分子标志物。
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关键词
食管鳞状细胞癌
长链非编码RNA
芯片
分子标志物
原文传递
长链非编码RNA MIR200CHG结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶促进乳腺癌细胞的侵袭
2
作者
成道福
韦达
唐莉
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2022年第9期1677-1679,共3页
目的观察长链非编码RNA微小RNA-200c和微小RNA-141宿主基因(MIR200CHG)结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGDH)对乳腺癌细胞侵袭的影响。方法采用RNA pull-down实验结合质谱分析MIR200CHG与UGDH之间的相互作用;用实时定量聚合酶链反应和蛋白...
目的观察长链非编码RNA微小RNA-200c和微小RNA-141宿主基因(MIR200CHG)结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGDH)对乳腺癌细胞侵袭的影响。方法采用RNA pull-down实验结合质谱分析MIR200CHG与UGDH之间的相互作用;用实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹分析MIR200CHG表达下调对UGDH mRNA和蛋白的影响;用Transwell实验分析MIR200CHG结合UGDH对乳腺癌细胞侵袭能力的影响。组间比较采用配对t检验。结果UGDH蛋白通过肽段VLIGGDETPEGQR和LAANAFLAQR与MIR200CHG结合,且仅在MIR200CHG正义链结合的蛋白液中检测到UGDH蛋白。下调MCF7细胞中的MIR200CHG使实验组中UGDH蛋白表达低于阴性对照组(0.38±0.09比1.00±0.03,t=11.320,P<0.01);挽救MCF7-sh细胞中的UGDH表达使实验组中发生侵袭的细胞比例高于阴性对照组(5.34±1.06比1.00±0.20,t=6.967,P<0.01),同时实验组中基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9和波形蛋白表达高于阴性对照组,分别为(1.96±0.23比1.01±0.04,t=7.064,P<0.01)、(1.75±0.17比1.00±0.05,t=7.330,P<0.01)和(1.63±0.17比1.02±0.02,t=6.158,P<0.01)。结论MIR200CHG可能通过结合UGDH蛋白促进乳腺癌细胞的侵袭。
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关键词
乳腺癌
长链非编码RNA
尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶
侵袭
原文传递
小肠腺癌卵巢转移6例诊治分析
3
作者
王健
胡清月
胡清
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2022年第5期368-369,共2页
回顾性分析6例小肠腺癌卵巢转移患者的临床资料。6例女性患者原发灶病理类型以小肠中低分化腺癌为主,卵巢转移灶有3例双侧转移,3例单侧转移。所有患者均行小肠原发灶切除以及转移灶的全部或部分切除术,有4例患者行化疗。全组患者随访时...
回顾性分析6例小肠腺癌卵巢转移患者的临床资料。6例女性患者原发灶病理类型以小肠中低分化腺癌为主,卵巢转移灶有3例双侧转移,3例单侧转移。所有患者均行小肠原发灶切除以及转移灶的全部或部分切除术,有4例患者行化疗。全组患者随访时间为6~28个月,3例患者死亡,3例患者目前存活。小肠腺癌卵巢转移在临床罕见,缺乏特异性临床表现,手术和化疗是目前常用的治疗方式,可能会使患者生存获益。
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关键词
卵巢转移
小肠腺癌
低分化腺癌
部分切除术
诊治分析
临床资料
病理类型
生存获益
原文传递
题名
长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌患者外周血中的表达
被引量:
1
1
作者
胡云
曹秀峰
唐薇薇
机构
江苏省肿瘤医院江苏省肿瘤防治研究所南京医科大学附属肿瘤医院普外科
南京
市第一
医院
南京医科大学
附属
南京
医院
肿瘤
外科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期745-747,共3页
基金
国家自然科学基金项目(81672423)。
文摘
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ~Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ~Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例,采用TRIzol试剂提取总RNA,将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA,纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交。两两比较筛选出相对表达量比值在2倍以上且差异有统计学意义的lncRNA作为差异表达的lncRNA。应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证lncTCONS00011689在ESCC样本中的表达情况,并分析其与ESCC患者临床病理特征及预后的关系,随访日期截止2019年12月31日。应用GraphPad Prism 5.0统计学软件分析,采用配对t检验和Log-rank生存分析。结果在组别1比对照组中上调的lncRNA有1 620条,下调的lncRNA有102条。在组别2比对照组中上调的lncRNA有17条,下调的lncRNA有129条。在组别2比组别1中上调的lncRNA有9条,下调的lncRNA有73条。生信数据分析显示这些差异表达基因的功能与细胞间相互作用、代谢、免疫应答、细胞黏附分子等功能均具有显著相关(r>0.99,P<0.05)。不同组别差异表达的lncRNA与差异表达的mRNA共表达分析显示表达结果中关联度最大的前1 000个关系对(r>0.99,P<0.05)。lncTCONS00011689在ESCC患者血浆中表达与正常人比较明显降低,其在ESCC患者血浆中的表达为5.12±0.31,在正常人血浆中的表达为4.03±0.26,差异有统计学意义(t=2.187,P<0.05)。lncTCONS00011689与ESCC临床TNM分期呈负相关(t=2.716,P<0.05),而与年龄、性别、分化程度以及淋巴结转移均无明显相关(P>0.05)。随访结果显示lncTCONS00011689表达低的ESCC患者总生存期相比于高表达的患者更短(F=0.048,P<0.05)。结论建立不同分期的ESCC患者外周血中差异lncRNA表达谱。lncTCONS00011689可作为食管鳞癌诊断、分期及预后监测的血浆分子标志物。
关键词
食管鳞状细胞癌
长链非编码RNA
芯片
分子标志物
Keywords
Esophageal squamous cell carcinoma
Long non-coding RNA
Microarray
Molecular biomarker
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
长链非编码RNA MIR200CHG结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶促进乳腺癌细胞的侵袭
2
作者
成道福
韦达
唐莉
机构
江苏省
肿瘤
医院
江苏省
肿瘤
防治
研究所
南京医科大学
附属
肿瘤
医院
检验科
江苏省肿瘤医院江苏省肿瘤防治研究所南京医科大学附属肿瘤医院普外科
出处
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2022年第9期1677-1679,共3页
基金
国家自然科学基金(81802898)
江苏省自然科学基金(BK20181090)。
文摘
目的观察长链非编码RNA微小RNA-200c和微小RNA-141宿主基因(MIR200CHG)结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGDH)对乳腺癌细胞侵袭的影响。方法采用RNA pull-down实验结合质谱分析MIR200CHG与UGDH之间的相互作用;用实时定量聚合酶链反应和蛋白质印迹分析MIR200CHG表达下调对UGDH mRNA和蛋白的影响;用Transwell实验分析MIR200CHG结合UGDH对乳腺癌细胞侵袭能力的影响。组间比较采用配对t检验。结果UGDH蛋白通过肽段VLIGGDETPEGQR和LAANAFLAQR与MIR200CHG结合,且仅在MIR200CHG正义链结合的蛋白液中检测到UGDH蛋白。下调MCF7细胞中的MIR200CHG使实验组中UGDH蛋白表达低于阴性对照组(0.38±0.09比1.00±0.03,t=11.320,P<0.01);挽救MCF7-sh细胞中的UGDH表达使实验组中发生侵袭的细胞比例高于阴性对照组(5.34±1.06比1.00±0.20,t=6.967,P<0.01),同时实验组中基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9和波形蛋白表达高于阴性对照组,分别为(1.96±0.23比1.01±0.04,t=7.064,P<0.01)、(1.75±0.17比1.00±0.05,t=7.330,P<0.01)和(1.63±0.17比1.02±0.02,t=6.158,P<0.01)。结论MIR200CHG可能通过结合UGDH蛋白促进乳腺癌细胞的侵袭。
关键词
乳腺癌
长链非编码RNA
尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶
侵袭
Keywords
Breast cancer
Long noncoding RNA
Uridine diphospho-glucose dehydrogenase
Invasion
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
小肠腺癌卵巢转移6例诊治分析
3
作者
王健
胡清月
胡清
机构
江苏省肿瘤医院江苏省肿瘤防治研究所南京医科大学附属肿瘤医院普外科
江苏省
肿瘤
医院
江苏省
肿瘤
防治
研究所
南京医科大学
附属
肿瘤
医院
肿瘤
内科
出处
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2022年第5期368-369,共2页
文摘
回顾性分析6例小肠腺癌卵巢转移患者的临床资料。6例女性患者原发灶病理类型以小肠中低分化腺癌为主,卵巢转移灶有3例双侧转移,3例单侧转移。所有患者均行小肠原发灶切除以及转移灶的全部或部分切除术,有4例患者行化疗。全组患者随访时间为6~28个月,3例患者死亡,3例患者目前存活。小肠腺癌卵巢转移在临床罕见,缺乏特异性临床表现,手术和化疗是目前常用的治疗方式,可能会使患者生存获益。
关键词
卵巢转移
小肠腺癌
低分化腺癌
部分切除术
诊治分析
临床资料
病理类型
生存获益
分类号
R735.32 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌患者外周血中的表达
胡云
曹秀峰
唐薇薇
《中华实验外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
原文传递
2
长链非编码RNA MIR200CHG结合尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶促进乳腺癌细胞的侵袭
成道福
韦达
唐莉
《中华实验外科杂志》
CAS
北大核心
2022
0
原文传递
3
小肠腺癌卵巢转移6例诊治分析
王健
胡清月
胡清
《中华普通外科杂志》
CSCD
北大核心
2022
0
原文传递
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