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甲状腺癌差异表达基因的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
盛福梅
连旭
韩崇旭
《实用临床医药杂志》
CAS
2021年第10期1-5,10,共6页
目的通过生物信息学方法筛选女性甲状腺癌(THCA)发生发展关键枢纽基因(Hub基因),探讨女性THCA发病机制。方法根据性别将1780例诊断为THCA患者分为男性组(n=300)和女性组(n=1480)。通过GEO芯片数据集GSE29265获取2组甲状腺癌及正常组织...
目的通过生物信息学方法筛选女性甲状腺癌(THCA)发生发展关键枢纽基因(Hub基因),探讨女性THCA发病机制。方法根据性别将1780例诊断为THCA患者分为男性组(n=300)和女性组(n=1480)。通过GEO芯片数据集GSE29265获取2组甲状腺癌及正常组织数据信息。分别筛选出2组癌组织、相对正常组织的差异表达基因(DEGs);构建DEGs的蛋白互作网络,并筛选Hub基因;采用基因本体(GO)数据库及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析THCA女性组Hub基因。结果分析发现女性THCA发病率是男性的4.93倍。女性组和男性组分别筛选出163个、165个差异表达为4倍以上的DEGs,以及分别筛选出10个、8个Hub基因,其中2组共有Hub基因4个,女性组特有Hub基因6个。女性组163个基因中,参与女性THCA生物学过程及相关信号通路的Hub基因有8个。结论PROM1、EVA1A、PRSS23、ITGA2、NCAM1和KIT为女性THCA中特有的DEGs,其可能将成为女性THCA患者潜在的治疗靶点。
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关键词
甲状腺癌
女性
生物信息学
差异表达基因
基因本体
京都基因与基因组百科全书
下载PDF
职称材料
题名
甲状腺癌差异表达基因的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
盛福梅
连旭
韩崇旭
机构
扬州大学
医学院
扬州大学
医学院
附属六合
医院
检验
科
江苏省苏北人民医院/扬州大学临床医学院医学检验科
出处
《实用临床医药杂志》
CAS
2021年第10期1-5,10,共6页
基金
国家重点基础研究发展(973计划)计划资助项目(2015CB755400)
江苏省苏北人民医院院级扶持技术项目(fcjs201748)。
文摘
目的通过生物信息学方法筛选女性甲状腺癌(THCA)发生发展关键枢纽基因(Hub基因),探讨女性THCA发病机制。方法根据性别将1780例诊断为THCA患者分为男性组(n=300)和女性组(n=1480)。通过GEO芯片数据集GSE29265获取2组甲状腺癌及正常组织数据信息。分别筛选出2组癌组织、相对正常组织的差异表达基因(DEGs);构建DEGs的蛋白互作网络,并筛选Hub基因;采用基因本体(GO)数据库及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析THCA女性组Hub基因。结果分析发现女性THCA发病率是男性的4.93倍。女性组和男性组分别筛选出163个、165个差异表达为4倍以上的DEGs,以及分别筛选出10个、8个Hub基因,其中2组共有Hub基因4个,女性组特有Hub基因6个。女性组163个基因中,参与女性THCA生物学过程及相关信号通路的Hub基因有8个。结论PROM1、EVA1A、PRSS23、ITGA2、NCAM1和KIT为女性THCA中特有的DEGs,其可能将成为女性THCA患者潜在的治疗靶点。
关键词
甲状腺癌
女性
生物信息学
差异表达基因
基因本体
京都基因与基因组百科全书
Keywords
thyroid carcinoma
female
bioinformatics
differentially expressed genes
Gene Ontology
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
分类号
R736.1 [医药卫生—肿瘤]
R34 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲状腺癌差异表达基因的生物信息学分析
盛福梅
连旭
韩崇旭
《实用临床医药杂志》
CAS
2021
1
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职称材料
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