暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp。用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目14种鱼类的COI序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COI基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高为97.6%,与同目不同科的矛尾翻车鲀和翻车鲀的同源性为76.5%和75.4%。根据暗纹东方鲀与其他1 314种鱼的COI基因序列同源性所建立的进化树,与传统的分类地位基本吻合。推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构。

CD81外显子6、7、8在中国人丙型肝炎病毒感染中单核苷酸多态性的研究

目的 探讨 CD81在中国人丙型肝炎病毒 (hepatitis C virus,HCV)感染中是否存在遗传易感性。方法 针对人和非洲绿猴的 CD81有 4个氨基酸位点 (16 3、186、188、196 )不同 ,而非洲绿猴不感染HCV,以正常人群和 HCV感染阳性患者的基因组 DNA为研究对象 ,用 PCR结合 DNA测序的方法对以上 4个氨基酸对应的 CD81基因位点进行分析。结果 在 CD81外显子 6、7、8没有发现单核苷酸多态性 ;尽管在一部分内含子 6和 3′端调控区发现了 3个多态位点 :110 2 8G/ T、1186 0 C/ T、1196 0 G/ A,但它们与HCV的感染无关 (P>0 .0 5 )。结论 未见 CD81外显子 6、7、8与 HCV感染的易感性相关 ;由于 CD81蛋白的其它位点在种间是高度保守的 ,因此在中国人群中 CD81蛋白的多态性稀少或不存在。