水稻粉质胚乳突变体cse的表型分析及基因定位

利用突变体挖掘与稻米品质相关基因,有助于阐明与品质相关的淀粉和贮藏蛋白生物合成的调控机制,促进水稻优质育种。通过筛选中花11组织培养突变体库,获得具有粉质、垩白和皱缩外观胚乳的突变体cse(chalkiness and shrunken endosperm),并进行籽粒表型鉴定和理化性质分析。通过F2群体分析cse遗传行为和目的基因的图位克隆,利用qRT-PCR分析基因的时空表达模式。与野生型相比,突变体的农艺性状和淀粉理化性质均有显著差异,突变体淀粉颗粒呈不规则球型,且相互间隙较大。遗传分析表明,突变体性状受单隐性核基因控制。借助图位克隆将候选基因定位在4号染色体长臂端Os4-14-8和Os4-15之间的40kb范围内。测序结果表明,定位区间内仅有一个编码TPR蛋白的候选基因LOC_Os04g55230发生了突变。第1个外显子处缺失3个碱基GGC,导致一个甘氨酸缺失,第14个外显子处存在1个碱基G替换成碱基A,导致精氨酸突变为赖氨酸。qRT-PCR结果表明,LOC_Os04g55230在授粉后14d的胚乳中表达量达到最大值。突变的LOC_Os04g55230为已报道基因OsFLO2/OsCNY8的新等位基因,但突变体与已知的OsFLO2突变体表型不完全相同,cse籽粒伴有皱缩外观,有效分蘖数、贮藏蛋白和脂肪酸含量等均显著增加。