猪Mitf基因的比较基因组学和进化分析

Mitf(Microphthalmia-associtated transcription factor)是小眼畸形相关转录因子,在黑色素细胞的发育、分化和功能调节上起着重要作用,同时还参与了其它3种细胞包括肥大细胞、破骨细胞和眼色素上皮细胞的发育和分化。针对猪的Mitf基因,从GenBank核酸数据库和proenseml网站下载4条猪的含有Mitf基因片段的基因组序列与牛、人、鼠3种物种的Mitf基因组序列进行比较基因组分析,结果发现,下载的猪Mitf基因组序列或没有排序,或存在一定错误排列。通过生物信息学和比较基因组分析,将猪Mitf基因的基因组序列进行重新组装,得到由6条有序基因组片段组成的较为完整的Mitf基因组序列,并根据人类Mitf基因的转录本信息推测出5种不同猪Mitf基因的转录本。进化分析表明,在人类、小鼠、猪、牛、马和狗中,猪和牛Mitf基因的进化关系最近,提示做猪基因的生物信息学分析可借鉴牛的基因分析结果。

太湖猪内四元杂交组合与外三元杜长大组合比较试验

以中国优良地方猪种———太湖猪为母本,用新美系杜洛克、德系抗应激皮特兰、加系双肌臀大白猪和新丹系长白猪等西方瘦肉型猪种作为父本进行土四元配套杂交组合试验,并与杜长大洋三元杂交组合进行比较.结果表明,除生长性能外,太湖猪土四元杂交组合在繁殖性能和肉质特性方面有突出表现;尤其是长大杜太的总产仔数和产活仔数分别达到14.51和13.86头,肌肉失水率6.58%,均优于杜长大(P<0.01或P<0.05),且肌肉脂肪含量适中(3.32%),是较为理想的杂交组合.

影响分娩母猪母性行为因素的探讨

分娩母猪母性行为的好坏直接影响到仔猪的成活率,尤其是一些母性行为失常的母猪直接咬死、踩死、压死仔猪,给养猪业造成巨大的经济损失。母猪分娩是受多种因素如神经、内分泌和胎儿等多方面影响和调控的一个复杂过程。近几年,虽然许多专家对分娩的机理进行研究,但到目前为止对造成母猪母性行为失常原因及机理的了解还不是很清楚。就分娩环境、机体内分泌、母猪遗传背景及产仔经验等影响分娩母猪母性行为的4个主要因素进行综述和讨论。

二花脸猪四元杂交组合与杜长大三元杂交组合比较试验报告

以中国优良地方猪种——二花脸猪为母本,用新美系杜洛克、德系抗应激皮特兰、加系双肌臀大白猪和新丹系长白猪等西方瘦肉型猪种作为父本进行土四元配套杂交组合试验,并与杜长大洋三元杂交组合进行比较.结果表明,除生长性能外,二花脸猪土四元杂交组合在繁殖性能和肉质特性方面有突出表现,甚至优于杜长大,尤其是以长大杜二组合的杂交效果较为理想.

利用Excel电子数据表计算遗传相似系数的方法

利用分子标记技术对生物物种群进行类群分类时,一般需要通过分析电泳图谱获得0/1矩阵,通过统计计算来得到其遗传相似系数和遗传距离指数。科学工作者常借助计算器徒手计算,容易出错,速度又慢。本文介绍一种以MicrosoftExcel电子数据表为平台,能较轻松又准确地根据0/1矩阵实现遗传相似系数和遗传距离指数计算的操作方法。

FS2M01.pl,转换片段大小表为0/1矩阵的Perl脚本

用Perl语言编写了一个脚本———FS2M01.pl来实现片段大小表向0/1矩阵的转换,解决了由人工方法将遗传图谱的位点信息转换成0/1矩阵的问题。

含太湖猪血缘的四元商品瘦肉猪杂交组合的研究与推广

以太湖猪为母本、抗应激皮特兰或杜洛克为第一父本、无氟烷基因的长大或大长公猪为第二父本的土四元杂交组合,经过示范与推广,结果表明:杜(皮)太二元母猪初配情期受胎率87.88%,经产母猪情期受胎率达到95.16%,窝均产仔13.72头,产活仔13.29头,35d断奶窝重112.99kg;长大杜(皮)太等四元杂交瘦肉猪日增重684.44g,料重比2.96∶1,瘦肉率61.91%;且无应激现象的发生,肉质正常,经济效益和社会效益非常显著。

猪13号染色体q41区的3个功能基因STS多态性与产肠毒素大肠杆菌F4ab／ac易感性相关

由产肠毒素大肠杆菌(Escherichia coli)F4(ETEC F4)引起的断奶前仔猪腹泻病是一种常见细菌感染病,对养猪业造成了巨大经济损失.编码ETECF4ab/ac受体的位点已被定位于猪(Sus scrofa)13号染色体(SSC13)q41区域,S0075为最紧密连锁的标记之一.本研究从S0075侧翼染色体区域选择了SLC12A8,MYLK和KPNA13个基因,建立猪特异性序列标签位点(STS).利用白色杜洛克×二花脸资源家系群体中的ETECF4ab/ac侵染抗性和易感个体,通过比较测序法,建立了这3个基因的STS,并鉴别到7个单核苷酸多态位点.进一步检测了白色杜洛克×二花脸资源家系群体祖代、亲本代和755头F2个体在SLC12A8g.159A>G,MYLKg.1673A>G和KPNA1g.306A>G多态位点的基因型.传递不平衡检测(TDT)分析表明:这些多态位点和相应的单倍型与ETEC F4ab/ac(特别是F4ac)刷状缘黏附表型存在显著相关,表明这些多态位点和单倍型与ETEC F4ab/ac受体的编码基因因果突变存在连锁不平衡.本研究进一步证实了SSC13q41存在ETEC F4ab/ac侵染易感性的遗传位点,为ETEC F4ab/ac受体基因的精细定位提供了新型多态标记.