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小麦属植物叶绿体基因组结构的比较分析
被引量:
4
1
作者
苏宁
何兆峰
+4 位作者
欧平和
杨玉存
王鹏程
崔立操
聂小军
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期55-64,共10页
为了从叶绿体角度解析小麦属植物的起源进化关系,以14个小麦属植物叶绿体基因组为对象,利用比较基因组分析方法,比较了小麦属植物的叶绿体基因组基因含量、序列变异、结构特性、进化关系和RNA编辑的异同。结果发现,14个小麦属植物叶绿...
为了从叶绿体角度解析小麦属植物的起源进化关系,以14个小麦属植物叶绿体基因组为对象,利用比较基因组分析方法,比较了小麦属植物的叶绿体基因组基因含量、序列变异、结构特性、进化关系和RNA编辑的异同。结果发现,14个小麦属植物叶绿体基因组大小相近,结构特征比较保守,但基因数量存在一定的差异,主要是由于tRNA的数目不一致引起的;IR区的伸缩分析发现硬粒小麦和乌拉尔图小麦在IRb-SSC边界基因存在明显的差异,其他麦类作物间差异很小;基于叶绿体全基因组的系统进化分析发现,有AABB基因型的物种聚在一起,而AAGG型的单独为一支,基本反映了其系统进化关系;对这14个叶绿体基因组的RNA编辑位点进行了预测和比较分析,发现有35个编辑位点在所有小麦属物种中均发生,同时还鉴定到多个物种特异的编辑位点,为从RNA编辑角度解析小麦属植物的系统进化关系提供了重要数据。
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关键词
小麦属
叶绿体
比较基因组学
RNA编辑
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职称材料
题名
小麦属植物叶绿体基因组结构的比较分析
被引量:
4
1
作者
苏宁
何兆峰
欧平和
杨玉存
王鹏程
崔立操
聂小军
机构
西北农林科技
大学
农
学院
江西农业大学生命科学学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期55-64,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31771778)
西北农林科技大学大学生创新创业项目(2201810712149)。
文摘
为了从叶绿体角度解析小麦属植物的起源进化关系,以14个小麦属植物叶绿体基因组为对象,利用比较基因组分析方法,比较了小麦属植物的叶绿体基因组基因含量、序列变异、结构特性、进化关系和RNA编辑的异同。结果发现,14个小麦属植物叶绿体基因组大小相近,结构特征比较保守,但基因数量存在一定的差异,主要是由于tRNA的数目不一致引起的;IR区的伸缩分析发现硬粒小麦和乌拉尔图小麦在IRb-SSC边界基因存在明显的差异,其他麦类作物间差异很小;基于叶绿体全基因组的系统进化分析发现,有AABB基因型的物种聚在一起,而AAGG型的单独为一支,基本反映了其系统进化关系;对这14个叶绿体基因组的RNA编辑位点进行了预测和比较分析,发现有35个编辑位点在所有小麦属物种中均发生,同时还鉴定到多个物种特异的编辑位点,为从RNA编辑角度解析小麦属植物的系统进化关系提供了重要数据。
关键词
小麦属
叶绿体
比较基因组学
RNA编辑
Keywords
Triticum species
Chloroplast genome
Phylogenomics
RNA editing
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦属植物叶绿体基因组结构的比较分析
苏宁
何兆峰
欧平和
杨玉存
王鹏程
崔立操
聂小军
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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