要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探...要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数组间差异显著(P<0.05),提示采用不同试剂盒可能对高通量测序分析结果产生影响。宁都黄鸡肠道微生物组成丰富,共检测到21个门、50个纲、80个目、134个科、268个属,相对丰度较高的菌群是拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria),相对丰度较高的前3个属分别是甲烷杆菌属(Methanobrevibacter)、理研菌科RC9肠菌群(Rikenellaceae RC9 gut group)和拟杆菌属(Bacteroides)。宁都黄鸡盲肠菌群组成特征再次证明了宿主系统发生地位对肠道菌群结构起到的重要影响作用。展开更多
为了研究成熟期鸡冠不同表型与骨形态发生蛋白2(Bone Morphogenetic Protein 2,BMP2)之间的关系,实验选取16周龄不同冠型的宁都黄鸡公鸡,量取鸡冠性状指标,利用苏木素伊红染色(Hematoxylin-Eosin staining,HE)观察不同冠型组织学差异,...为了研究成熟期鸡冠不同表型与骨形态发生蛋白2(Bone Morphogenetic Protein 2,BMP2)之间的关系,实验选取16周龄不同冠型的宁都黄鸡公鸡,量取鸡冠性状指标,利用苏木素伊红染色(Hematoxylin-Eosin staining,HE)观察不同冠型组织学差异,通过免疫组织化学方法观察BMP2在不同冠型中的表达。结果表明:宁都黄鸡公鸡细齿冠的冠高、冠长、冠厚的指标均显著低于其他冠型,外周真皮层的血管均比其他冠型少,且外周层与中间层较为致密,而肥厚冠、三叉冠和双叉冠的外周层中小静脉呈扩大状态,可形成窦状血管网,中间层较为松散;BMP2在细齿冠中的表达量极显著高于其他冠型,在生发层的表达是由深层向浅层逐渐降低,且BMP2可在鸡冠血管内皮细胞中表达。说明BMP2对鸡冠的分化发育具有负调控作用,对鸡冠血管的分化具有一定影响。展开更多
文摘要获得高质量的测序结果,一个重要的前提是提供高质量的DNA样品。该研究旨在比较4种样本预处理方法和目前国内通用的3种试剂盒对于盲肠内容物基因组DNA提取的质量,并通过扩增子测序结果分析宁都黄鸡盲肠菌群组成及其多样性,为进一步探索肠道微生物在宁都黄鸡生长中的作用,乃至未来禽微生态制剂的研发奠定基础。结果表明:QIAGEN、BioTeke或BIOMIGA公司试剂盒提取的基因组DNA用于扩增子测序,所得肠道微生物菌群Beta多样性分析结果无显著差异(P>0.05),而Shannon指数和Simpson指数组间差异显著(P<0.05),提示采用不同试剂盒可能对高通量测序分析结果产生影响。宁都黄鸡肠道微生物组成丰富,共检测到21个门、50个纲、80个目、134个科、268个属,相对丰度较高的菌群是拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria),相对丰度较高的前3个属分别是甲烷杆菌属(Methanobrevibacter)、理研菌科RC9肠菌群(Rikenellaceae RC9 gut group)和拟杆菌属(Bacteroides)。宁都黄鸡盲肠菌群组成特征再次证明了宿主系统发生地位对肠道菌群结构起到的重要影响作用。
文摘为了研究成熟期鸡冠不同表型与骨形态发生蛋白2(Bone Morphogenetic Protein 2,BMP2)之间的关系,实验选取16周龄不同冠型的宁都黄鸡公鸡,量取鸡冠性状指标,利用苏木素伊红染色(Hematoxylin-Eosin staining,HE)观察不同冠型组织学差异,通过免疫组织化学方法观察BMP2在不同冠型中的表达。结果表明:宁都黄鸡公鸡细齿冠的冠高、冠长、冠厚的指标均显著低于其他冠型,外周真皮层的血管均比其他冠型少,且外周层与中间层较为致密,而肥厚冠、三叉冠和双叉冠的外周层中小静脉呈扩大状态,可形成窦状血管网,中间层较为松散;BMP2在细齿冠中的表达量极显著高于其他冠型,在生发层的表达是由深层向浅层逐渐降低,且BMP2可在鸡冠血管内皮细胞中表达。说明BMP2对鸡冠的分化发育具有负调控作用,对鸡冠血管的分化具有一定影响。