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利用核心SNP标记划分辽宁省常用玉米自交系杂种优势群的研究
被引量:
11
1
作者
姜思奇
郭瑞
+5 位作者
张敖
赵艳贺
时免免
邓丽霞
崔震海
阮燕晔
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期17-23,共7页
利用3个密度的SNP标记对44份玉米自交系进行杂种优势群划分,包括8份对照自交系和36份辽宁省常用育种自交系。利用56k玉米芯片共筛选得到了46 899个高质量的SNP标记,作为高密度SNP标记划分杂种优势群,然后筛选1 008、101个SNP标记分别作...
利用3个密度的SNP标记对44份玉米自交系进行杂种优势群划分,包括8份对照自交系和36份辽宁省常用育种自交系。利用56k玉米芯片共筛选得到了46 899个高质量的SNP标记,作为高密度SNP标记划分杂种优势群,然后筛选1 008、101个SNP标记分别作为中密度和低密度SNP标记用于分群。结果表明,部分自交系的遗传相似度达到90%以上,不宜作为不同自交系进行育种应用。3个密度下的SNP标记都有效地将待测玉米自交系划分为4个杂种优势群,分别为瑞德群、兰卡斯特群、旅大红骨与塘四平头混合群以及类PH4CV群。对比高密度SNP标记,利用中低密度SNP标记划分的杂种优势群内部分自交系间的遗传距离发生变化,不能精确解析杂种优势群群内自交系的亲缘关系。划分杂种优势群可以采用中低密度的SNP育种芯片;群内自交系亲缘关系的区分应该采用高密度SNP芯片。
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关键词
玉米
单核苷酸多态性
杂种优势群
遗传相似度
聚类分析
原文传递
题名
利用核心SNP标记划分辽宁省常用玉米自交系杂种优势群的研究
被引量:
11
1
作者
姜思奇
郭瑞
张敖
赵艳贺
时免免
邓丽霞
崔震海
阮燕晔
机构
沈阳农业大学/辽宁省植物基因工程技术中心
河北省承德市滦平县北山新区农牧局
出处
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期17-23,共7页
基金
辽宁省科技攻关项目“基于DOUGLAS基因型分析平台的玉米SNP标记体系的构建与优化”(2015103001)
文摘
利用3个密度的SNP标记对44份玉米自交系进行杂种优势群划分,包括8份对照自交系和36份辽宁省常用育种自交系。利用56k玉米芯片共筛选得到了46 899个高质量的SNP标记,作为高密度SNP标记划分杂种优势群,然后筛选1 008、101个SNP标记分别作为中密度和低密度SNP标记用于分群。结果表明,部分自交系的遗传相似度达到90%以上,不宜作为不同自交系进行育种应用。3个密度下的SNP标记都有效地将待测玉米自交系划分为4个杂种优势群,分别为瑞德群、兰卡斯特群、旅大红骨与塘四平头混合群以及类PH4CV群。对比高密度SNP标记,利用中低密度SNP标记划分的杂种优势群内部分自交系间的遗传距离发生变化,不能精确解析杂种优势群群内自交系的亲缘关系。划分杂种优势群可以采用中低密度的SNP育种芯片;群内自交系亲缘关系的区分应该采用高密度SNP芯片。
关键词
玉米
单核苷酸多态性
杂种优势群
遗传相似度
聚类分析
Keywords
Maize
Single Nucleotide Polymorphism(SNP)
Heterosis Croup
Genetic Similarity
Cluster Analysis
分类号
S513.035.3 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用核心SNP标记划分辽宁省常用玉米自交系杂种优势群的研究
姜思奇
郭瑞
张敖
赵艳贺
时免免
邓丽霞
崔震海
阮燕晔
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
11
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