辽宁锡伯族人群15个STR基因座的遗传多态性及与其他民族之间关系的研究

目的探索辽宁锡伯族15个常染色体基因座(D3S1358,TH01,D21S11,D18S51,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,CSF1PO,vWA,D8S1179,TPOX,D2S1338,D19S433,FGA)的遗传多态性,分析14个群体间的遗传关系,建立辽宁锡伯族群体的遗传学基础数据,为群体遗传学和法医学应用提供依据。方法采集辽宁锡伯族150名无关个体口腔黏膜细胞,Chelex 100法提取DNA,应用荧光标记法进行PCR扩增,扩增产物在Li-COR 4300基因分析仪上电泳,E-seq分析软件进行基因型分型,应用PowerStats V1.2软件计算各基因座的相关群体遗传学参数,计算14个群体间的遗传距离,用Neighbor-Joining法构建系统发生树。结果 15个STR基因座在辽宁锡伯族群体中具有遗传多态性,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。累积非父排除率(CPE)为0.999 991 636 8,累积个人识别能力(TDP)为0.999 999 999 999 999 146 51。辽宁锡伯族与国内及来自亚洲群体的亲缘关系较近,而与来自大洋洲的澳大利亚群体亲缘关系较远。结论辽宁锡伯族群体15个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力,可为法医学亲子鉴定、个体识别及群体遗传学研究提供依据。

中国辽宁锡伯族群体3个短串联重复位点的遗传多态性分析

背景：对常染色体STR基因座的多态性的研究可为法医学亲权鉴定提供基础数据。目的：探索辽宁锡伯族D16S539,THO1,D13S3173个常染色体基因座的遗传多态性,建立锡伯族群体的遗传学基础数据。方法：采集辽宁省沈阳市新城子区黄家乡锡伯族中小学的150名中小学生口腔黏膜细胞,Chelex100法提取DNA,进行荧光标记PCR扩增,产物在Li-COR4300基因分析仪上进行电泳,E-seq分析软件计算扩增产物片段相对大小,进行基因型分型。调查辽宁地区锡伯族群体3个STR基因座等位基因频率,进行遗传多态性分析。结果与结论：辽宁锡伯族群体中3个STR基因座具有遗传多态性,其基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。辽宁锡伯族群体中3个STR基因座的杂合度分布在0.769~0.810;个人识别力分布在0.824~0.929,累积个人识别能力为0.999;多态信息量分布在0.650~0.790;非父排除率分布在0.565~0.790,累积非父排除率为0.979。说明辽宁锡伯族群体3个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力,可为法医学亲子鉴定和个体识别及移植配型等遗传学研究提供依据。

土茯苓通过槲皮素抑制黄嘌呤氧化酶降尿酸

目的 土茯苓具有降尿酸作用,但其发挥作用的有效成分和机制仍不清楚,本研究基于黄嘌呤氧化酶(xanthine oxidase,XO)尿酸代谢靶点探讨土茯苓降尿酸有效活性小分子及其作用机制。方法 通过TCMSP数据库构建土茯苓的小分子成分配体库,从PDB蛋白数据库获得人源黄嘌呤氧化酶3D接受体结构,分子对接计算结合能,筛选土茯苓抑制黄嘌呤氧化酶的潜在活性小分子,观察2D分子间相互作用。将人肾小管上皮细胞(HK-2)分为空白组、高尿酸血症模型组及低中高剂量实验药物组,采用微量法尿酸检测试剂盒检测细胞外液尿酸含量,结合细胞水平降尿酸作用分析黄嘌呤氧化酶钼蝶呤疏水通道口袋关键相互作用氨基酸。结果 分子对接结果显示,土茯苓中的6个小分子成分(2R,3R)-2-(3,5-dihydroxyphenyl)-3,5,7-trihydroxychroman-4-one,taxifolin,(-)-taxifolin,quercetin,naringenin和cis-Dihydroquercetin与XO通往钼蝶呤疏水通道的活性位点有良好结合能力。细胞实验结果显示,槲皮素、花旗松素和柚皮素均具有一定程度的浓度依赖性降尿酸作用,三者相比,槲皮素具有更好的抑制尿酸合成作用。分子相互作用分析发现,影响降尿酸靶点作用效果的关键是与通往钼蝶呤疏水通道的GLN870和ASP871氨基酸形成氢键,同时与CYS648形成疏水作用。结论 土茯苓主要成分槲皮素,花旗松素和柚皮素是发挥降尿酸作用的关键小分子,以槲皮素为最强。黄嘌呤氧化酶结构中通往钼蝶呤疏水通道的GLN870、ASP871和CYS648是影响XO尿酸合成的关键氨基酸靶点。

中国人DNA修复基因XRCC1 Pro206Pro和Gln632Gln单核苷酸多态与肺癌发生风险

目的:DNA修复系统基因在维持基因组整体性及预防癌变过程中起着重要作用。碱基切除修复是DNA修复途径之一,主要切除DNA分子的小型损伤。XRCC1蛋白分子是碱基切除修复途径的重要组成成分。本研究探讨了DNA修复基因XRCC1 Pro206Pro与Gln632Gln单核苷酸多态与肺癌发生风险。方法:采用PCR-RFLP分型技术,分析中国东北地区汉族群体中247例肺癌患者与253例正常对照者的XRCC1 Pro206Pro和Gln632Gln多态/单体型与肺癌易感性及其与吸烟之间的关联。肺癌病例与正常对照者在年龄(±3岁)、性别及民族方面相配对。结果:XRCC1 Pro206Pro(G)变异等位基因携带者与AA野生等位基因纯合子个体相比较,有1.96倍高的肺癌发生风险(ad-justedOR=1.96,95%CI=1.26～3.06,P=0.003)(OR值经吸烟史校正)。对于XRCC1 Gln632Gln单一位点研究,未发现有统计学意义。分层分析未观察到基因型与吸烟史之间可能的基因与环境的相互作用。两个SNPs之间存在强烈的连锁不平衡(D’=0.807,P=3.1e-115),单体型在肺癌组与对照组之间的总体分布有极显著性差异(P=2.25e-06)。单体型2(Pro206Pro(A)-Gln632Gln(G)是抗风险性单体型(OR=0.66,95%CI=0.45～0.96,P=0.03),而单体型4(Pro206Pro(G)-Gln632Gln(G)是高风险性单体型(OR=16.09,95%CI=3.89～66.53,P=3.09e-07),这表明了基因与基因之间的相互作用对于复杂疾病研究的重要性。结论:XRCC1Pro206Pro等位基因及含其等位基因的单体型可能在肺癌的发生过程中起着重要作用。

大豆小分子多肽制备工艺和质量标准的研究

采用酶法水解脱脂豆饼粕制备具有生物活性的大豆小分子多肽,确定了先以粗胰酶预酶解5%豆饼粕蛋白,再以中性微生物蛋白酶进一步水解提取大豆小分子多肽的工艺流程。粗胰酶酶解最佳条件:添加量为9 000 U.g-1,酶解温度55℃,pH8.5,时间6 h。中性微生物蛋白酶水解粗胰酶乳最佳条件为:加酶量8 500 U.g-1,pH7.5,温度45℃,时间2 h。在此条件下,肽得率可达到73.98%。同时还构建了大豆小分子活性多肽的质量检测标准。

改良溴化乙锭染色法快速检测基因组DNA

目的探讨一种耗时少、检出率高的基因组DNA检测方法。方法采用改良的溴化乙锭染色法检测提取到的样本基因组DNA。采用分光光度仪进行敏感性验证,聚合酶链式反应确认该方法能否用来检测PCR产物。结果改良的溴化乙锭染色法显著减少基因组DNA的上样量,提高基因组DNA的检测敏感性,节省操作时间,无需loading buffer,并可粗略估计基因组DNA浓度。结论改良的溴化乙锭染色法只适用于初筛样本基因组DNA,不能用于评估DNA片段的长度。

辽宁锡伯族五项舌运动类型

目的 :研究辽宁锡伯族人群卷舌、叠舌、翻舌、尖舌、三叶舌5项舌运动类型特点,探讨锡伯族人群与其他族群的亲缘关系,为研究锡伯族群体遗传学积累资料。方法 :对辽宁沈阳新城子区234例(男为120例,女为114例)锡伯族学生5项舌运动类型进行研究。采用类间平均连锁法,对14个族群进行聚类分析,探讨族群间亲缘关系。结果 :辽宁锡伯族卷舌、叠舌、翻舌、尖舌、三叶舌运动类型出现率分别为96.58%、32.05%、51.28%、73.08%、3.84%,5项舌运动类型出现率性别间无差异。卷舌分别与翻舌、叠舌和尖舌,翻舌分别与叠舌和三叶舌,叠舌分别与尖舌和三叶舌基因间存在基因相互的关系。舌运动类型与国内民族比较,卷舌、翻舌、叠舌、尖舌构成比处于较高水平,三叶舌构成比处于较低水平。聚类分析结果表明,辽宁锡伯族的舌运动类型出现率与锦州汉族最为接近。结论 :辽宁锡伯族5项舌运动类型与国内族群舌运动相比,卷舌、翻舌、叠舌运动、尖舌类型运动能力较强,三叶舌类型运动能力比较弱,辽宁锡伯族与锦州汉族亲缘关系最近。

辽宁省锡伯族及汉族惯用手基因频率的分布

目的抽样调查了沈阳市新城子区两个群体锡伯族及汉族惯用手的特征,对惯用手基因频率的分布进行了同民族不同性别间及两个民族之间的X^2检验比较分析,为人类群体遗传学研究提供资料。方法采用多项观察(如使用剪刀、投球、使筷、写字等)综合得出结论。左手灵巧者则为左惯用手(L型),若右手灵巧则为右惯用手(R型)。结果辽宁锡伯族惯用手显性基因频率A=0.8517、隐性基因频率a=0.1483。辽宁汉族惯用手显性基因频率A=0.7895,隐性基因频率a=0.2105。结论辽宁锡伯族、汉族男、女群体基因频率分布无显著差异(P>0.05),两个民族间惯用手基因频率分布有显著差异(P<0.05)。

辽宁省锡伯族6项不对称行为特征

2017年10月调查了辽宁沈阳市郊锡伯族中学学生6项不对称行为特征(利眼、扣手、交叉臂、交叉腿、利足、起步类型).研究结果显示:(1)辽宁锡伯族男性的利眼、扣手、交叉臂、交叉腿L型率均略低于女性的L型率;男性的起步类型、利足L型率均略高于女性的L型率,但总体其6项不对称行为特征的出现率均无性别间差异(P>0.05).(2)辽宁锡伯族与国内其他15个少数民族其6项不对称行为特征出现率分别依次比较结果显示,有显著性差异(P<0.05)或极显著性差异(P<0.01).(3)辽宁锡伯族其6项不对称分布特征指标间的相关性分析显示,扣手与利眼、扣手与交叉臂、扣手与交叉腿、交叉臂与交叉腿、起步类型与交叉臂、起步类型与交叉腿、起步类型与利足均存在相关性(P<0.05或P<0.01).(4)辽宁锡伯族等16个族群间关系远近聚类分析提示,16个民族分成4组,辽宁锡伯族与鄂温克族最为接近.

果蝇信息和种系资源的获得

黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)作为理想的模式生物已被广泛应用于生物学和医学等领域的研究。在国际一体化网络时代的今天,海量的实验数据和信息不断涌现。目前,国际上一些知名的果蝇网站和种系资源中心可提供丰富的在线信息,极大地方便了科研工作者进行相关领域的科研成果查询和获得果蝇种系资源。本文就常用的果蝇网站作一综述,为我国从事果蝇研究的科研工作者提供信息查询参考。

骨桥蛋白与前列腺癌关系的研究进展

前列腺癌（prostatic cancer，PCa）是男性最常见的恶性肿瘤之一，占癌症死因的第2位，约占所有癌症患者的40％。近年来随着生活条件的改善和人口老龄化，其发病率有明显增加的趋势且因通常生长缓慢，病程较长，患者常常在发病数年之后才出现明显的症状或体征。发病隐匿，多数患者就诊时大多已经转移。大约40％的局限性PCa患者在经过第1次治疗后都会复发，

Chelex100法提取的口腔黏膜细胞DNA在STR分析中的研究

目的探讨Chelex100法提取口腔黏膜细胞DNA在STR分析中应用的可靠性。方法优化采集口腔黏膜细胞,Chelex100法提取DNA,检测OD260/OD280比值及浓度,以DNA为模板,荧光标记法进行PCR扩增,基因分析仪上电泳,E-seq分析软件进行基因型分析。结果 Chelex100法提取口腔黏膜细胞DNA,OD260/OD280比值:1.397±0.0062(1.23~1.52),浓度:63.039±3.116 ng/μL(26.7~315.9ng/μL),PCR扩增电泳无非特异性带,在Li-COR 4300基因分析仪上电泳,E-seq分析软件进行基因型分析,满足了STR基因型分析研究。结论优化采集口腔黏膜细胞及DNA提取方法,具有快速、简便、经济特点,其提取到DNA的纯度及产量,通过对STR基因型分析结果验证本研究样本DNA是可靠的。

辽宁锡伯族与汉族达尔文结节的基因频率

目的调查辽宁锡伯族与汉族人群达尔文结节遗传性状的分布特点。方法参照吴汝康等《人体测量方法》和邵象清《人体测量手册》方法,对辽宁省沈阳市沈北新区黄家乡锡伯族九年一贯制学校锡伯族与汉族中学生的达尔文结节进行调查,分析了两个群体的基因频率。结果有达尔文结节对无达尔文结节为显性性状,辽宁锡伯族达尔文结节显性基因频率为0.3698,达尔文结节隐性基因频率为0.6302,辽宁汉族达尔文结节显性基因频率为0.2174,达尔文结节隐性基因频率为0.7826。结论辽宁锡伯族群体男女间达尔文结节基因频率分布无显著差异(P>0.05),辽宁汉族群体男女间达尔文结节基因频率分布无显著差异(P>0.05),辽宁锡伯族与汉族间达尔文结节基因频率分布有极显著性差异(P<0.01)。与国内其他民族相比,辽宁锡伯族达尔文结节基因频率处于中等水平。

肾结石疾病相关蛋白的大数据分析

目的本研究拟利用大数据分析方法发现影响肾结石形成的核心蛋白。方法收集已发现的人类肾结石相关蛋白质信息,组入人类蛋白质相互作用数据库,构建肾结石蛋白质相互作用网络,通过网络拓扑分析方法计算Node Degree和Betweeness Centrality,获得蛋白在相互作用网络中的重要程度排序,执行聚类分析显示这些蛋白参与信号通路情况,根据蛋白排序和参与信号通路的数量确定核心蛋白。Microarray数据分析验证核心蛋白基因在肾结石患者的表达情况。进一步使用SIFT,PolyPhen2,phD-SNP和MutPred四种生物学软件分析核心蛋白基因的致病性nsSNPs。结果构建一个包含812个蛋白质的肾结石相互作用网络,拓扑分析获得其中32(3.9%)个关键蛋白,聚类分析发现这些关键蛋白参与55条信号通路,根据蛋白重要程度及参与信号通路的多少对核心蛋白进行排序,发现MAPK1是一个最核心蛋白,参与其中34条信号通路。Microarray数据分析发现MAPK1在肾结石患者肾乳头组织中下调表达。In silico分析识别MAPK1基因中有3个高可信度的致病性ns SNPs。结论MAPK1是一个肾结石疾病相互作用蛋白网络的核心蛋白,在肾结石患者中下调表达,其高致病性nsSNP可能影响MAPK1与疾病的风险。我们的发现可能为肾结石治疗新药开发提供一个新的靶点,并为今后更深入的肾结石机制研究提供基础。

辽宁锡伯族与汉族鼻尖形态基因频率的分布

目的通过调查辽宁省沈阳市沈北新区黄家乡锡伯族中学11-16岁锡伯族与汉族中学生的鼻尖形态特征,分析了锡伯族与汉族两个群体的鼻尖形态基因频率。方法采用吴汝康等《人体测量方法》和邵象清《人体测量手册》方法,观察受试者鼻尖形态。结果辽宁锡伯族鼻尖显性基因频率A=0.0617,鼻尖隐性基因频率a=0.9383,辽宁汉族鼻尖显性基因频率A=0.1008,鼻尖隐性基因频率a=0.8992。结论辽宁锡伯族群体男女间基因频率分布无显著差异(P>0.05),辽宁汉族群体男女间基因频率分布无显著差异(P>0.05),辽宁锡伯族汉族间鼻尖形态基因频率分布有显著性差异(P<0.05)。与国内其他民族相比,辽宁锡伯族鼻尖形态基因频率处于中等水平。