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玉米铁还原酶基因ZmFRO2的功能分析
被引量:
2
1
作者
乔孟欣
李素贞
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期9-20,共12页
Fe是植物生长发育过程中最重要的微量元素之一,植物缺铁会导致叶片黄化,进而影响产量。植物吸收转运铁共有两种机理,即机理I和机理II,相应的植物称为机理I植物和机理II植物,机理I植物主要包括双子叶植物和非禾本科单子叶植物,机理II植...
Fe是植物生长发育过程中最重要的微量元素之一,植物缺铁会导致叶片黄化,进而影响产量。植物吸收转运铁共有两种机理,即机理I和机理II,相应的植物称为机理I植物和机理II植物,机理I植物主要包括双子叶植物和非禾本科单子叶植物,机理II植物主要包括禾本科植物。铁还原酶基因FRO(Ferric reduction oxidase)作为机理I植物中的关键基因已在多种植物中被发现与研究,包括禾本科植物水稻。为了解该基因在玉米中的功能,对玉米铁还原酶基因ZmFRO2进行了基因功能的分析,包括生物信息学分析、表达模式分析及亚细胞定位分析,证明了ZmFRO2具有铁还原酶的结构基础且与OsFRO1、MtFRO2、AtFRO6和AtFRO7具有较近的亲缘关系,ZmFRO2定位在质膜与胞质,该基因主要在叶片中大量表达,且该基因的表达受缺铁先诱导后抑制。另外,通过农杆菌介导的方法获得了过表达ZmFRO2玉米植株,对其进行铁还原酶活力及锌铁含量测定发现过表达ZmFRO2能够提高玉米根部铁还原酶活力,根部、叶片和籽粒的铁含量均有不同程度的升高。通过这些分析和测定为之后基因功能的深入研究奠定基础,进而为提高玉米铁含量提供新的功能基因和新途径。
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关键词
铁还原酶基因
ZmFRO2
功能验证
缺铁胁迫
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职称材料
植物YSL家族基因研究进展
被引量:
5
2
作者
刘元峰
李素贞
+1 位作者
郭晋杰
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期1-9,共9页
黄色条纹蛋白(Yellow stripe-like protein,YSL)是广泛存在于植物中的重金属吸收、转运蛋白,主要参与植物Fe^(3+)的吸收及对Fe^(2+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、Ni^(2+)和Mn^(2+)等金属离子的转运。目前,对于黄色条纹蛋白在植物体内的表达模式...
黄色条纹蛋白(Yellow stripe-like protein,YSL)是广泛存在于植物中的重金属吸收、转运蛋白,主要参与植物Fe^(3+)的吸收及对Fe^(2+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、Ni^(2+)和Mn^(2+)等金属离子的转运。目前,对于黄色条纹蛋白在植物体内的表达模式,亚细胞定位以及突变体等方面的研究揭示了其在植物生长发育过程中的作用。综述了近年来关于YSL基因在植物中的研究进展,旨为研究植物吸收铁的作用机理及生物强化谷物籽粒中的铁含量奠定基础。
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关键词
铁
黄色条纹蛋白
铁吸收
金属转运体
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职称材料
植物铁还原酶基因FRO的研究进展
被引量:
2
3
作者
乔孟欣
李素贞
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期162-171,共10页
铁(Fe)是植物生长必需的微量元素,适宜的铁含量有利于植物的正常生长和发育。在吸收铁这一生理过程中,禾本科植物和非禾本科植物吸收铁的价态不同,并且铁在植物体内的运输过程也存在着二价与三价铁的相互转化。铁还原酶基因(Fe^3+chelat...
铁(Fe)是植物生长必需的微量元素,适宜的铁含量有利于植物的正常生长和发育。在吸收铁这一生理过程中,禾本科植物和非禾本科植物吸收铁的价态不同,并且铁在植物体内的运输过程也存在着二价与三价铁的相互转化。铁还原酶基因(Fe^3+chelate reductase,FRO)具有将三价铁还原成二价铁的功能。因此,在分子水平上研究FRO的具体功能具有非常重要的意义。综述了拟南芥、番茄、大豆、水稻、花生及蒺藜苜蓿等FRO基因在亚细胞定位、还原对象、诱导条件及调控或影响因素等方面的研究进展,以期为后续研究铁的吸收机制奠定理论基础。
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关键词
铁
铁还原酶
铁还原酶基因
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职称材料
玉米花期性状的全基因组关联分析
被引量:
9
4
作者
李真
刘文童
+5 位作者
杨硕
郭晋杰
赵永锋
黄亚群
陈景堂
祝丽英
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期37-45,共9页
花期性状是玉米的重要性状,与熟期、散粉结实率和产量关系密切,对玉米品种选育至关重要。为探究玉米花期性状的遗传基础,本研究以248份遗传多样性丰富的玉米自交系作为关联群体,通过2017年和2018年在河北保定和辛集的田间试验调查抽雄...
花期性状是玉米的重要性状,与熟期、散粉结实率和产量关系密切,对玉米品种选育至关重要。为探究玉米花期性状的遗传基础,本研究以248份遗传多样性丰富的玉米自交系作为关联群体,通过2017年和2018年在河北保定和辛集的田间试验调查抽雄期、散粉期、吐丝期和散粉吐丝间隔期4个花期相关性状,利用分布于全基因组的83057个SNP标记进行关联分析。结果表明,4个花期相关性状的基因型、年份、地点、基因型与地点的互作、基因型与年份的互作均达到极显著水平;抽雄期、散粉期、吐丝期的遗传率分别为71.77%、71.27%、73.93%,并且两两性状间呈极显著正相关,散粉吐丝间隔期遗传率为62.50%,仅与吐丝期呈极显著正相关;4个花期性状共检测到18个SNPs-性状关联(共涉及16个SNP位点),单个位点的表型贡献率范围为5.46%~28.36%,仅1个位点在不同性状中检测到;筛选到81个候选基因,其中36个在GO分析中具有功能注释。潜在候选基因GRMZM5G877647编码early flowering 4蛋白,参与光周期的调节;GRMZM2G173630编码类赤霉素受体蛋白参与植物激素信号转导;GRMZM2G001139、GRMZM2G375707编码与花器官建成的MADS转录因子。这些潜在候选基因为解析玉米花期性状遗传基础和分子辅助选择育种提供参考。
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关键词
玉米(Zea
mays
L.)
花期性状
全基因组关联分析
候选基因
原文传递
两种密度条件下玉米雄穗分枝数全基因组关联分析
被引量:
5
5
作者
杜宇茜
杨莎
+4 位作者
祝丽英
赵永锋
黄亚群
陈景堂
郭晋杰
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第18期5970-5977,共8页
玉米雄穗分枝数是产量的重要影响因子之一。为剖析高、低两种密度条件下雄穗分枝数的遗传基础,以248份优良玉米自交系构成的自然群体为研究材料,2014年和2015年分别在高、低两种密度条件(105 000株/公顷, 75 000株/公顷)进行雄穗分枝数...
玉米雄穗分枝数是产量的重要影响因子之一。为剖析高、低两种密度条件下雄穗分枝数的遗传基础,以248份优良玉米自交系构成的自然群体为研究材料,2014年和2015年分别在高、低两种密度条件(105 000株/公顷, 75 000株/公顷)进行雄穗分枝数的表型鉴定。利用R软件中的‘lme4’程序包对雄穗分枝数的最优线性无偏估计值(BLUP)进行计算,结合分布于全基因组的10 684个单核苷酸多态性(SNPs)标记进行全基因组关联分析。结果表明,随着种植密度的增加,雄穗分枝数有减少的趋势,且两种密度条件下遗传力均较高。同时,两种密度条件下共检测到26个与其显著关联的SNP位点,分布于玉米1号、2号、3号、5号、6号、7号、8号、9号、10号染色体。其中,低密条件下检测到12个SNP位点,高密条件下检测到14个SNP位点,5个SNP位点在两种密度条件下均被检测到,6个SNP位点在高密条件下单个位点解释的表型变异大于10%。除此之外,并确定了4个候选基因,编码产物分别为含CHASE结构域的组氨酸激酶(Histidine kinase)蛋白,富含亮氨酸重复序列(leucine rich repeat, LRR)的蛋白,含有ZF-HD结构域的蛋白和磷酸果糖激酶。采用全基因组关联分析,挖掘在两种密度条件下均检测到的与雄穗分枝数显著相关的一致性可靠标记位点以及在高密条件下特异表达且单个位点解释的表型变异均大于10%的SNP位点,并鉴定相关候选基因,为不同密度条件玉米雄穗性状相关基因的克隆提供关键的理论依据。
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关键词
玉米
雄穗分枝数
种植密度
全基因组关联分析
候选基因
原文传递
题名
玉米铁还原酶基因ZmFRO2的功能分析
被引量:
2
1
作者
乔孟欣
李素贞
陈景堂
机构
河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室
中国
农业
科
学院
生物技术研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第11期9-20,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31671768)。
文摘
Fe是植物生长发育过程中最重要的微量元素之一,植物缺铁会导致叶片黄化,进而影响产量。植物吸收转运铁共有两种机理,即机理I和机理II,相应的植物称为机理I植物和机理II植物,机理I植物主要包括双子叶植物和非禾本科单子叶植物,机理II植物主要包括禾本科植物。铁还原酶基因FRO(Ferric reduction oxidase)作为机理I植物中的关键基因已在多种植物中被发现与研究,包括禾本科植物水稻。为了解该基因在玉米中的功能,对玉米铁还原酶基因ZmFRO2进行了基因功能的分析,包括生物信息学分析、表达模式分析及亚细胞定位分析,证明了ZmFRO2具有铁还原酶的结构基础且与OsFRO1、MtFRO2、AtFRO6和AtFRO7具有较近的亲缘关系,ZmFRO2定位在质膜与胞质,该基因主要在叶片中大量表达,且该基因的表达受缺铁先诱导后抑制。另外,通过农杆菌介导的方法获得了过表达ZmFRO2玉米植株,对其进行铁还原酶活力及锌铁含量测定发现过表达ZmFRO2能够提高玉米根部铁还原酶活力,根部、叶片和籽粒的铁含量均有不同程度的升高。通过这些分析和测定为之后基因功能的深入研究奠定基础,进而为提高玉米铁含量提供新的功能基因和新途径。
关键词
铁还原酶基因
ZmFRO2
功能验证
缺铁胁迫
Keywords
iron reductase gene
ZmFRO2
function verification
iron deficiency stress
分类号
S513 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
植物YSL家族基因研究进展
被引量:
5
2
作者
刘元峰
李素贞
郭晋杰
陈景堂
机构
河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期1-9,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31671768)
河北省研究生创新资助项目(2015-2016)
文摘
黄色条纹蛋白(Yellow stripe-like protein,YSL)是广泛存在于植物中的重金属吸收、转运蛋白,主要参与植物Fe^(3+)的吸收及对Fe^(2+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、Ni^(2+)和Mn^(2+)等金属离子的转运。目前,对于黄色条纹蛋白在植物体内的表达模式,亚细胞定位以及突变体等方面的研究揭示了其在植物生长发育过程中的作用。综述了近年来关于YSL基因在植物中的研究进展,旨为研究植物吸收铁的作用机理及生物强化谷物籽粒中的铁含量奠定基础。
关键词
铁
黄色条纹蛋白
铁吸收
金属转运体
Keywords
iron
yellow stripe-like protein
iron acquisition
metal transporter
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
植物铁还原酶基因FRO的研究进展
被引量:
2
3
作者
乔孟欣
李素贞
陈景堂
机构
河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期162-171,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31671768)
文摘
铁(Fe)是植物生长必需的微量元素,适宜的铁含量有利于植物的正常生长和发育。在吸收铁这一生理过程中,禾本科植物和非禾本科植物吸收铁的价态不同,并且铁在植物体内的运输过程也存在着二价与三价铁的相互转化。铁还原酶基因(Fe^3+chelate reductase,FRO)具有将三价铁还原成二价铁的功能。因此,在分子水平上研究FRO的具体功能具有非常重要的意义。综述了拟南芥、番茄、大豆、水稻、花生及蒺藜苜蓿等FRO基因在亚细胞定位、还原对象、诱导条件及调控或影响因素等方面的研究进展,以期为后续研究铁的吸收机制奠定理论基础。
关键词
铁
铁还原酶
铁还原酶基因
Keywords
iron
Fe^3+chelate reductase
FRO
分类号
Q94 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
玉米花期性状的全基因组关联分析
被引量:
9
4
作者
李真
刘文童
杨硕
郭晋杰
赵永锋
黄亚群
陈景堂
祝丽英
机构
河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期37-45,共9页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0101204
2017YFD0101202)
河北省高等学校科学技术研究重点项目(ZD2017037)共同资助
文摘
花期性状是玉米的重要性状,与熟期、散粉结实率和产量关系密切,对玉米品种选育至关重要。为探究玉米花期性状的遗传基础,本研究以248份遗传多样性丰富的玉米自交系作为关联群体,通过2017年和2018年在河北保定和辛集的田间试验调查抽雄期、散粉期、吐丝期和散粉吐丝间隔期4个花期相关性状,利用分布于全基因组的83057个SNP标记进行关联分析。结果表明,4个花期相关性状的基因型、年份、地点、基因型与地点的互作、基因型与年份的互作均达到极显著水平;抽雄期、散粉期、吐丝期的遗传率分别为71.77%、71.27%、73.93%,并且两两性状间呈极显著正相关,散粉吐丝间隔期遗传率为62.50%,仅与吐丝期呈极显著正相关;4个花期性状共检测到18个SNPs-性状关联(共涉及16个SNP位点),单个位点的表型贡献率范围为5.46%~28.36%,仅1个位点在不同性状中检测到;筛选到81个候选基因,其中36个在GO分析中具有功能注释。潜在候选基因GRMZM5G877647编码early flowering 4蛋白,参与光周期的调节;GRMZM2G173630编码类赤霉素受体蛋白参与植物激素信号转导;GRMZM2G001139、GRMZM2G375707编码与花器官建成的MADS转录因子。这些潜在候选基因为解析玉米花期性状遗传基础和分子辅助选择育种提供参考。
关键词
玉米(Zea
mays
L.)
花期性状
全基因组关联分析
候选基因
Keywords
Maize(Zea mays L.)
Flowering time related traits
GWAS
Candidate gene
分类号
S513 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
两种密度条件下玉米雄穗分枝数全基因组关联分析
被引量:
5
5
作者
杜宇茜
杨莎
祝丽英
赵永锋
黄亚群
陈景堂
郭晋杰
机构
河北农业大学农学院国家玉米改良中心河北分中心河北省作物种质资源实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第18期5970-5977,共8页
基金
河北省高等学校科学技术研究重点项目(ZD2017037)
国家重点研发计划(2016YFD0101204-3
+2 种基金
2017YFD01101202)
河北省科技计划项目(14226305D-5
16226323D-2)共同资助
文摘
玉米雄穗分枝数是产量的重要影响因子之一。为剖析高、低两种密度条件下雄穗分枝数的遗传基础,以248份优良玉米自交系构成的自然群体为研究材料,2014年和2015年分别在高、低两种密度条件(105 000株/公顷, 75 000株/公顷)进行雄穗分枝数的表型鉴定。利用R软件中的‘lme4’程序包对雄穗分枝数的最优线性无偏估计值(BLUP)进行计算,结合分布于全基因组的10 684个单核苷酸多态性(SNPs)标记进行全基因组关联分析。结果表明,随着种植密度的增加,雄穗分枝数有减少的趋势,且两种密度条件下遗传力均较高。同时,两种密度条件下共检测到26个与其显著关联的SNP位点,分布于玉米1号、2号、3号、5号、6号、7号、8号、9号、10号染色体。其中,低密条件下检测到12个SNP位点,高密条件下检测到14个SNP位点,5个SNP位点在两种密度条件下均被检测到,6个SNP位点在高密条件下单个位点解释的表型变异大于10%。除此之外,并确定了4个候选基因,编码产物分别为含CHASE结构域的组氨酸激酶(Histidine kinase)蛋白,富含亮氨酸重复序列(leucine rich repeat, LRR)的蛋白,含有ZF-HD结构域的蛋白和磷酸果糖激酶。采用全基因组关联分析,挖掘在两种密度条件下均检测到的与雄穗分枝数显著相关的一致性可靠标记位点以及在高密条件下特异表达且单个位点解释的表型变异均大于10%的SNP位点,并鉴定相关候选基因,为不同密度条件玉米雄穗性状相关基因的克隆提供关键的理论依据。
关键词
玉米
雄穗分枝数
种植密度
全基因组关联分析
候选基因
Keywords
Maize
Tassel branch number
Plant density
Genome-wide association study (GWAS)
Candidate gene
分类号
S513 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米铁还原酶基因ZmFRO2的功能分析
乔孟欣
李素贞
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
下载PDF
职称材料
2
植物YSL家族基因研究进展
刘元峰
李素贞
郭晋杰
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
5
下载PDF
职称材料
3
植物铁还原酶基因FRO的研究进展
乔孟欣
李素贞
陈景堂
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
4
玉米花期性状的全基因组关联分析
李真
刘文童
杨硕
郭晋杰
赵永锋
黄亚群
陈景堂
祝丽英
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
原文传递
5
两种密度条件下玉米雄穗分枝数全基因组关联分析
杜宇茜
杨莎
祝丽英
赵永锋
黄亚群
陈景堂
郭晋杰
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
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