-
题名PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定
- 1
-
-
作者
赵阿妮
朱丽媛
吴朝
刘雪梅
阴彬
张靖
-
机构
中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
河北北方学院病理及病理生理学实验室
-
出处
《基础医学与临床》
CSCD
北大核心
2013年第6期694-698,共5页
-
基金
国家自然科学基金(31071203)
-
文摘
目的从EST鉴定入手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA。方法首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱。结果筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式。结论使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘。找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs。
-
关键词
ESTS
生物信息学分析
LONG
noncoding
RNA
筛选
鉴定
表达谱分析
-
Keywords
ESTs
bioinformatic analysis
long noncoding RNA
screening
identification
expression
-
分类号
R346
[医药卫生—基础医学]
-