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基于高通量转录组探索CCNB1、ASPM在糖尿病足溃疡治疗的应用
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作者 阎复利 楚俞君 高永昌 《临床医学进展》 2024年第6期963-974,共12页
背景:糖尿病足溃疡是糖尿病患者常见的并发症,其危害性不容小觑,然而其分子机制尚不完全清楚。方法:利用GEO数据库中的糖尿病足溃疡数据集GSE143735,通过limma包筛选差异表达基因(DEGs),并进行功能富集分析和GSEA。利用WGCNA构建共表达... 背景:糖尿病足溃疡是糖尿病患者常见的并发症,其危害性不容小觑,然而其分子机制尚不完全清楚。方法:利用GEO数据库中的糖尿病足溃疡数据集GSE143735,通过limma包筛选差异表达基因(DEGs),并进行功能富集分析和GSEA。利用WGCNA构建共表达网络,筛选重要模块,再通过STRING数据库构建PPI网络。通过Cytoscape可视化并获取靶点基因。通过基因表达量热图展示核心基因在糖尿病足溃疡和正常样本中的表达差异。miRNA预测网站用于找出调节靶点基因的miRNA。结果:发现了1778个差异表达基因。功能富集分析表明这些基因主要涉及伤口愈合、细胞连接等生物学过程。WGCNA和PPI网络分析鉴定了CCNB1和ASPM等核心基因,并通过热图展示其在疾病样本中的低表达。miRNA预测进一步揭示了这些基因在糖尿病足溃疡中的潜在作用。结论:CCNB1和ASPM在糖尿病足溃疡中低表达,它们可能在糖尿病足溃疡的发展中发挥重要作用。 展开更多
关键词 糖尿病足溃疡 分子机制 差异表达基因 靶点基因
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CCNB1、KIF23作为骨肉瘤的核心生物标志物的探索研究
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作者 刘磊 刘夏丞 高永昌 《临床医学进展》 2024年第5期162-177,共16页
目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差... 目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差异基因列表,并进行GOKEGG和GSEA富集分析,构建PPI网络获取核心差异基因,并制作核心基因的表达热图。使用CIBERSORT软件包进行免疫浸润分析,获得了全基因表达矩阵的免疫细胞的比例结果和免疫细胞组分间的共表达模式图,用于研究在免疫系统治疗干预下,对于骨肉瘤的疾病进程的影响。还获取了在CTD网站中,我们找到了与核心基因的最相关的疾病。TargetScan用于筛选调节中枢DEG的miRNA。结果:共获得了1342个差异基因,富集结果显示差异表达基因主要富集在细胞激活、分泌颗粒、脂质结合、细胞周期、P53信号通路。构建了PPI网络,获得了核心基因KIF23、CCNB1,绘制了核心基因在基因表达矩阵中的表达差异情况,结果显示KIF23、CCNB1在骨肉瘤和正常组织中具有显著差异。并在CTD网站中查找到了KIF23、CCNB1和骨肉瘤、肿瘤、炎症等疾病有关。结论:CCNB1和KIF23的高表达可能导致细胞周期的异常,促进骨肉瘤细胞的异常增殖和侵袭,在骨肉瘤的发生发展过程中发挥重要的作用,CCNB1和KIF23的表达越高,则骨肉瘤的预后越差。 展开更多
关键词 骨肉瘤 生物信息学 CCNB1 KIF23
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一体化链式护理对晚期胃癌患者的影响
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作者 邵力威 刘夏丞 高永昌 《临床医学进展》 2024年第6期867-870,共4页
晚期胃癌指肿瘤侵犯浆膜层及邻近组织,并且出现了转移,患者的护理和治疗一直是医学界和临床实践中的重要挑战。随着医疗体系的不断发展和患者护理理念的演变,一体化链式护理模式作为一种综合性护理模式,在晚期胃癌患者中得到了广泛应用... 晚期胃癌指肿瘤侵犯浆膜层及邻近组织,并且出现了转移,患者的护理和治疗一直是医学界和临床实践中的重要挑战。随着医疗体系的不断发展和患者护理理念的演变,一体化链式护理模式作为一种综合性护理模式,在晚期胃癌患者中得到了广泛应用。该综述旨在系统整理一体化链式护理对晚期胃癌患者的影响,并评估其在提高患者康复、生存质量以及整体医疗效果方面的作用。 展开更多
关键词 一体化链式护理 晚期胃癌 预后
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