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2016~2021年我国猪伪狂犬病病毒的分子流行病学调查与分析
被引量:
9
1
作者
郭镇洋
赵静
+17 位作者
付军
许浒
李超
李宛生
孙琪
裴艳艳
龚帮俊
王倩
周国辉
汤艳东
冷超粮
王永杰
陈长青
安同庆
蔡雪辉
张洪亮
田志军
彭金美
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期122-128,155,共8页
为探究近几年猪伪狂犬病病毒(PRV)在我国的流行情况及遗传演化特征,本研究对2016年~2021年采自全国17个省、市和自治区的2299份临床样品经PCR检测,并利用PCR扩增阳性样品中的PRV gB、gE和gC基因并测序,采用MegAlign分析三者与GenBank登...
为探究近几年猪伪狂犬病病毒(PRV)在我国的流行情况及遗传演化特征,本研究对2016年~2021年采自全国17个省、市和自治区的2299份临床样品经PCR检测,并利用PCR扩增阳性样品中的PRV gB、gE和gC基因并测序,采用MegAlign分析三者与GenBank登录的PRV参考株相应基因序列的同源性;利用MEGA 7.0分别构建上述3个基因的遗传进化树,并采用MegAlign分析gB、gE和gC蛋白氨基酸序列的差异,分析其遗传演化及分子特征的变化。结果显示,共扩增出24份PRV阳性样品,阳性率约1.04%,且不同年份及不同地区均有PRV的检出。PRV gB、gE和gC基因序列的同源性及遗传进化分析结果显示,3个基因及其编码氨基酸序列均与2011年以来的PRV变异株同源性最高,且均属于基因Ⅱ型PRV变异株;氨基酸序列比对结果显示,与基因Ⅰ型PRV相比,所测PRV gB、gE和gC中均存在特征性氨基酸突变位点:gB氨基酸序列aa75~aa77连续缺失3个氨基酸(SPG),aa93~aa94连续插入2个氨基酸(DG);gE氨基酸序列在aa48和aa496各插入1个氨基酸(D);gC氨基酸序列在aa63~aa69连续插入7个氨基酸AAASTPA。此外,本研究通过比对国内外经典株以及2011年以来国内PRV gE蛋白的氨基酸序列,确定了不同亚型PRV(即指基因Ⅱ型PRV变异株和经典株)的分子特征即基因Ⅱ型PRV变异株:gE aa496为“D+”或aa496为“D-”+aa448“I”;基因Ⅱ型PRV经典株:gE为aa496“D-”+aa448“V/A”。上述结果表明,我国现阶段仍以基因Ⅱ型PRV变异株的流行为主,进一步明确了不同基因型和亚型PRV的分子特征,对了解我国PRV的流行现状及当前流行株的分子特征具有重要意义,为PRV诊断试剂的研发及PR的防控提供了参考。
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关键词
猪伪狂犬病病毒
变异株
遗传演化
分子特征
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题名
2016~2021年我国猪伪狂犬病病毒的分子流行病学调查与分析
被引量:
9
1
作者
郭镇洋
赵静
付军
许浒
李超
李宛生
孙琪
裴艳艳
龚帮俊
王倩
周国辉
汤艳东
冷超粮
王永杰
陈长青
安同庆
蔡雪辉
张洪亮
田志军
彭金美
机构
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
南阳师范学院
河北省威远药业有限公司
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期122-128,155,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1800800)
黑龙江省重大项目(2022ZX02B13)
+1 种基金
黑龙江省自然科学基金(YQ2019C028)
中国博士后科学基金(2020M680788)。
文摘
为探究近几年猪伪狂犬病病毒(PRV)在我国的流行情况及遗传演化特征,本研究对2016年~2021年采自全国17个省、市和自治区的2299份临床样品经PCR检测,并利用PCR扩增阳性样品中的PRV gB、gE和gC基因并测序,采用MegAlign分析三者与GenBank登录的PRV参考株相应基因序列的同源性;利用MEGA 7.0分别构建上述3个基因的遗传进化树,并采用MegAlign分析gB、gE和gC蛋白氨基酸序列的差异,分析其遗传演化及分子特征的变化。结果显示,共扩增出24份PRV阳性样品,阳性率约1.04%,且不同年份及不同地区均有PRV的检出。PRV gB、gE和gC基因序列的同源性及遗传进化分析结果显示,3个基因及其编码氨基酸序列均与2011年以来的PRV变异株同源性最高,且均属于基因Ⅱ型PRV变异株;氨基酸序列比对结果显示,与基因Ⅰ型PRV相比,所测PRV gB、gE和gC中均存在特征性氨基酸突变位点:gB氨基酸序列aa75~aa77连续缺失3个氨基酸(SPG),aa93~aa94连续插入2个氨基酸(DG);gE氨基酸序列在aa48和aa496各插入1个氨基酸(D);gC氨基酸序列在aa63~aa69连续插入7个氨基酸AAASTPA。此外,本研究通过比对国内外经典株以及2011年以来国内PRV gE蛋白的氨基酸序列,确定了不同亚型PRV(即指基因Ⅱ型PRV变异株和经典株)的分子特征即基因Ⅱ型PRV变异株:gE aa496为“D+”或aa496为“D-”+aa448“I”;基因Ⅱ型PRV经典株:gE为aa496“D-”+aa448“V/A”。上述结果表明,我国现阶段仍以基因Ⅱ型PRV变异株的流行为主,进一步明确了不同基因型和亚型PRV的分子特征,对了解我国PRV的流行现状及当前流行株的分子特征具有重要意义,为PRV诊断试剂的研发及PR的防控提供了参考。
关键词
猪伪狂犬病病毒
变异株
遗传演化
分子特征
Keywords
porcine pseudorabies virus
variants
phylogenetic analysis
molecular characteristics
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2016~2021年我国猪伪狂犬病病毒的分子流行病学调查与分析
郭镇洋
赵静
付军
许浒
李超
李宛生
孙琪
裴艳艳
龚帮俊
王倩
周国辉
汤艳东
冷超粮
王永杰
陈长青
安同庆
蔡雪辉
张洪亮
田志军
彭金美
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
9
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