建立基于脱氧次黄嘌呤核苷修饰等位基因PCR方法检测EGFR基因热点突变

目的建立基于脱氧次黄嘌呤修饰等位基因特异荧光聚合酶链反应(d I-AS-PCR)方法,检测表皮生长因子受体(EGFR)基因热点突变L858R和19del(2235~2249,2236~2250)。方法设计包含扩增EGFR基因L858R和19del热点突变在内的特异性引物、荧光探针和内参体系;且特异检测基因突变的等位基因PCR引物3’-末端n-1或n-2位置采用脱氧次黄嘌呤(d I)修饰。建立标准品和质控样品,应用荧光PCR检测,并分析结果。结果 d I-AS-PCR能够在野生型背景下检测低于0.1%的突变,对50例肺癌临床样本进行检测,有9例(18%)EGFR基因发生L858R突变,14(28%)例19del基因突变。EGFR基因热点突变率为46%,其检测结果与DNA测序完全一致。结论基于d I-AS-PCR技术的特异荧光PCR检测EGFR基因热点突变,敏感性高,特异性强,可以应用于临床EGFR基因突变检测,指导个性化用药及酪氨酸激酶抑制剂(TKI)治疗耐药监测。