中草药渣发酵工艺及其在动物生产中的应用

目前,中草药提取后剩余的中草药渣主要以堆放、燃烧等方式进行废弃处理,已造成严重的环境污染和资源浪费。研究表明,中草药渣中含有丰富营养价值及多种活性物质,其经发酵处理后可作为一种健康的、新型的饲料替代品或添加剂产品应用到畜牧生产中。本文通过对中草药渣的发酵工艺、作用特点及其在动物生产中的应用进行综述,为发酵中草药渣在动物养殖中应用研究提供理论参考。

鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒相关的关键基因挖掘

为深入了解分析鸡IFITM/IFIT基因家族的特性,以禽流感病毒攻毒后的鸡RNA-seq数据为研究对象,通过加权基因共表达网络分析,构建了鸡的肺组织对不同亚型禽流感免疫反应的加权基因共表达网络,并对其模块进行了性状关联性分析与功能富集分析,进而筛选出鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒胁迫相关的枢纽基因。结果显示:鸡IFITM/IFIT基因家族成员中,IFITM2,IFITM3和IFIT5基因参与应答禽流感病毒诱发的免疫反应。其中,IFIT5基因属于H5N1病毒早期免疫应答模块的枢纽基因,在H5N1病毒诱发的早期免疫通路中发挥重要作用。

鸡TLR1A基因正选择nsSNP与沙门氏菌易感性的关联性研究

为探究鸡TLR1A基因正选择nsSNP位点与沙门氏菌易感性的关联,挖掘其潜在的功能性位点,本研究利用多种生物信息学方法对ChTLR1A的21个nsSNP位点及基因的选择压力进行综合分析,筛选ChTLR1A正选择nsSNP功能性位点,深入分析其与鸡沙门氏菌易感性之间的相关性。结果显示,rs739087452(I388L)和rs313678806(C815R)在种上及种内均受到正选择作用,且rs739087452(I388L)位点的变异使其蛋白稳定性降低。rs313678806(C815R)与鸡沙门氏菌的易感性显著相关(P<0.001),C/C基因型为沙门氏菌抵抗型,表明rs313678806(C815R)可能是影响鸡沙门氏菌易感性的重要功能性SNP。本实验结果可为TLR1A基因标记在鸡抗病育种中的利用提供参考依据。

貉肉骨粉对冬毛期雄性蓝狐生长性能、营养物质表观消化率、氮代谢和血清生化指标的影响

试验旨在探究日粮中使用不同水平貉肉骨粉替代鱼粉对冬毛期蓝狐生长性能、营养物质表观消化率、氮代谢及血清生化指标的影响。选取120日龄、初始体重为(6.33±0.03)kg的健康雄性蓝狐90只,随机分为6组,每组15个重复,每个重复1只。对照组(Ⅰ组)饲喂基础饲粮,试验组分别用3%(Ⅱ组)、6%(Ⅲ组)、9%(Ⅳ组)、12%(Ⅴ组)和15%(Ⅵ组)的貉肉骨粉替代基础饲粮中鱼粉。预试期7 d,正试期80 d。结果表明:①各组末体重、平均日增重、平均日采食量和料重比差异不显著(P>0.05),Ⅴ组体长显著高于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅵ组(P<0.05),Ⅴ组鲜皮长显著高于Ⅲ组(P<0.05)。②Ⅴ组干物质表观消化率显著高于Ⅱ、Ⅲ组(P<0.05),Ⅵ组粗蛋白表观消化率显著高于Ⅱ组(P<0.05),各组粗脂肪表观消化率差异不显著(P>0.05)。③各组氮摄入量、粪氮排出量、尿氮排出量、氮沉积、净蛋白利用效率和蛋白质生物学价值差异不显著(P>0.05)。④Ⅴ组血清尿素氮(BUN)含量显著低于Ⅰ、Ⅱ组和Ⅲ组(P<0.05),各组血清白蛋白(ALB)、总蛋白(TP)、谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、胆固醇(CHO)、高密度脂蛋白(HDL)、低密度脂蛋白(LDL)、三酰甘油(TG)及葡萄糖(GLU)的含量差异均不显著(P>0.05)。综合各项指标,在冬毛期蓝狐饲料中使用貉肉骨粉,添加量为12%时各项指标最优。

鸡TLR1A基因2个SNP位点功能分析及与坝上长尾鸡沙门氏菌感染抗性的相关分析

为确定鸡TLR1A基因g.926G>A和g.1076G>C等2个nsSNP位点多态性及其功能意义,采用CRS-PCR-RFLP方法检测了310只坝上长尾鸡(阳性127只,阴性183只)TLR1A基因2个nsSNP位点的多态性、二者与沙门氏菌抗性的关联,并对其进行生物信息学与适应性进化分析。结果表明,g.926G>A(S309N)和g.1076G>C(R359P)与鸡沙门氏菌易感性显著相关(P<0.05)。其中,S309N在种间种内水平均受到正选择压力;R359P在种内受到正选择压力。二者均具有有害性,且后者蛋白稳定性较低。鸡TLR1A基因的g.926G>A和g.1076G>C位点可作为鸡抗病育种中潜在的功能性位点。

北极狐源唾液乳杆菌ZJBF005的分离鉴定与体外益生功能的评价

本研究旨在从健康北极狐肠道中分离和鉴定具有益生菌潜能的乳酸菌,并对其体外益生功能进行评价。对分离菌株进行生理生化和16S rRNA鉴定,测定其生长曲线、产酸和耐酸曲线,测定该菌的胆盐耐受性以及在人工胃液和人工肠液中的存活率,分别采用牛津杯琼脂扩散法和纸片扩散法检测该菌的抗菌活性和抗生素敏感性。最后选取20只雌性昆明小鼠,随机分为2组(每组10只),对照组灌胃生理盐水,试验组灌胃唾液乳杆菌(1×10^(9) CFU/mL),试验期7 d。结果表明:结合16S rRNA和生理生化鉴定结果将其命名为唾液乳杆菌ZJBF005,该菌在MRS培养基中生长迅速,具有较强的产酸能力;在pH 4~7培养液之间生长良好,培养液pH低于2生长受到抑制;在人工胃液、人工肠液中培养3 h后的存活率分别为40.96%和86.70%;可在0.2%的胆盐环境中生长;可抑制沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的生长;对四环素、庆大霉素、万古霉素、磷霉素、阿奇霉素、甲氧苄啶和甲硝唑等抗生素不敏感;灌胃后的小鼠体重变化正常、无死亡、剖检无病理性变化。综上所述,来自健康北极狐肠道的唾液乳杆菌ZJBF005具有良好的益生菌特性,可作为益生菌的备选菌株。

鸡IFIT5基因编码区多态性及生物信息学分析

为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测序结果为1 411 bp;经分析得到完整的IFIT5 CDS区为1 440 bp,共编码479个氨基酸,测序比对结果准确。IFIT5蛋白为不稳定的、小分子的、非分泌型的亲水蛋白,且具有磷酸化和糖基化位点;二级结构主要以α-螺旋为主,结构域以TPR结构域为主。研究发现了12个SNP,其中SNP1(g.405 G>A)和SNP9(g.1 124 G>A)在原鸡为A,在家鸡中已固定为G;只有SNP8(g.110 8 A>G)和SNP12(g.1 273 A>G)位点具有中度多态性,其他位点是低度。12个SNP位点中存在4个nsSNP位点(D370N、Y375C、N402K和G425R)。其中D370N、Y375C和N402K位点被预测为有害性位点;并且D370N和N402K突变可能改变相关氨基酸的氢键数目和蛋白的高级结构,进而影响蛋白的结构和功能。这些nsSNP位点,特别是D370N和N402K可尝试作为鸡先天免疫的候选分子标记,为遗传资源的保护及抗病性分子育种提供理论依据。

过氧化氢酶对生长前期乌苏里貉生长性能、消化代谢、血清生化和免疫指标的影响

试验旨在研究日粮中添加过氧化氢酶(catalase,CAT)对生长前期雄性乌苏里貉生长性能、营养物质消化率、氮代谢、血清生化和免疫指标的影响。随机选取(60±5)日龄健康、体重相近的雄性乌苏里貉60只,随机分为4组,每组15只貉,每个重复1只貉。分别饲喂含CAT 0(1组)、0.10%(2组)、0.15%(3组)、0.20%(4组)的试验饲粮,预试期7 d,正试期82 d。试验期间每组随机选取8只乌苏里貉采用全收粪法进行消化代谢试验。结果表明:(1)2组末重(FBW)、平均日增重(ADG)均显著高于1组(P<0.05),料重比(F/G)显著低于1组(P<0.05);(2)2组的粗蛋白(CP)消化率极显著高于1组(P<0.01);2组的粗脂肪(EE)消化率极显著高于1组(P<0.05),对干物质(DM)消化率、氮沉积没有显著影响(P>0.05);(3)CAT组血清中尿素氮(urea nitrogen,UREA)的含量显著低于1组(P<0.05);2、3组血清中碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)含量极显著低于1组(P<0.01);1组的谷草转氨酶(aspartate aminotransferase,AST)与其他几组均有极显著差异(P<0.01),3组与4组之间有极显著差异(P<0.01),且与2组有显著差异(P<0.05);(4)3、4组血清中免疫球蛋白A(immunoglobulin A,IgA)含量极显著高于1组(P<0.01);2、4组的血清中免疫球蛋白G(immunoglobulin G,IgG)含量极显著高于1组(P<0.01);2、3组血清中脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)含量极显著低于1组(P<0.01);CAT组血清中肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)含量极显著低于1组(P<0.01)。结果表明,本试验条件下,饲粮中添加适量的CAT可以提高生长前期乌苏里貉的生长性能、EE消化率,改善血清生化指标,提高乌苏里貉机体免疫力。综合各项指标,CAT在生长前期乌苏里貉日粮中的最佳添加量为0.1%。

鸡IFITM3基因编码区克隆及生物信息学分析

为探究鸡IFITM(Interferon-Induced Transmembrane,IFITM)3基因SNPs(Single Nucleotide Polym orphisms,SNPs)位点的多态性,挖掘其潜在的功能性位点,本研究对鸡IFITM3基因编码区进行克隆,结合多种生物信息学方法对蛋白nsSNPs(nonsense-SNPs, nsSNPs)位点及基因的选择压力进行综合分析。结果显示:本研究克隆了IFITM3基因编码区,为414 bp,共编码137个氨基酸;该蛋白质为稳定的、非分泌型、疏水性小分子跨膜蛋白,并具有磷酸化、糖基化、棕榈酰化修饰位点。本研究发现5个SNP,其中SNP1在测序鸡种中已经固定,不具有多态性;其余4个SNP的多态性在测序鸡种的群体中存在差异,且都属于中性位点。分析发现:鸡IFITM3基因存在2个nsSNPs位点,其中V103I突变对蛋白的影响程度低,是非保守性的中性位点。H126P突变可能改变位点的氢键数目降低蛋白的分子间作用力,影响蛋白空间结构的稳定性。IFITM3编码区序列十分保守,在禽类的选择压力分析中,只检测到120V位点。综上所述,H126P位点可作为优良鸡种免疫分子选育的潜在功能性位点。

鸡NLRs基因家族鉴定、系统进化及表达分析

为深入了解鸡NOD样受体(NLRs)家族基因特性,利用生物信息学方法通过保守结构域搜索鉴定了鸡的NLRs基因,分析NLRs基因理化性质、基因结构、系统进化关系、正选择作用、共线性关系和表达情况。结果显示:共鉴定出5个鸡NLRs基因,分别命名为chNLRC5、chNLRC3、chNLRP3、chNLRX1、chNOD1,分布在5条染色体上,编码734~1 862个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为82 842.01~207 969.52 ku,等电点为5.48~8.64;chNLRC5、chNOD1和chNLRP3为酸性蛋白,chNLRC3和chNLRX1蛋白呈碱性,只有chNOD1为稳定蛋白,5个成员均为亲水蛋白,5个基因结构差别显著,分别含有48、20、7、7、11个外显子;系统进化树显示,NLRs基因家族分为5个分支,鸡、绿头鸭、火鸡和日本鹌鹑NLR基因间存在较强的共线性关系;对各成员进行选择压力分析结果鉴定出13个正选择位点;鸡回肠和肺组织中检测到NLR基因表达。研究表明正选择效应在NLRX1、NOD1、NLRC5基因作用明显,NLRC5在鸡回肠和肺组织中为表达活跃的功能基因。

鸡TRAFs家族成员鉴定及生物信息学分析

利用基因组数据库(ensemble数据库),以分子生物学手段对鸡TRAFs家族进行了成员鉴定和生物信息学分析。通过Pfam蛋白家族数据库下载TRAF(PF00917,PF02176)的隐马可夫模型,利用TBtools工具在鸡基因组中比对,同时利用Pfam,SMART工具进一步验证,采用MEGA,MEME,TBtools等工具分析鸡TRAFs家族成员蛋白理化性质,构建系统进化树,分析其基因结构,直系、旁系同源基因,定位染色体。本次研究在鸡基因组中鉴定获得了7条鸡TRAFs,命名为ChTRAF1~ChTRAF7。ChTRAF蛋白长度跨度较大,是不稳定蛋白且均为亲水蛋白。ChTRAF1,ChTRAF6,ChTRAF7蛋白的pI小于7,证明其可能是酸性蛋白。该基因家族分为7个亚家族,分别含有1个TRAF,基因结构及蛋白结构域差别显著。鸡、鸭和鹅等3个物种间TRAFs家族成员存在共线性,提示TRAFs家族在物种间进化具有一定保守性。

孵化期LED绿光照射对坝上长尾鸡胚胎期肌纤维发育的影响

为探讨单色绿光对坝上长尾鸡肉蛋兼用型品种鸡胚胎期肌肉发育的影响,选用160个的受精卵随机分成4组,试验组用波长为(525±10)nm的绿光照射12 h黑暗12 h的连续光照模式,光照度分别为弱光组30~80 lx,中光组90~140 lx,强光组150~200 lx;对照组始终保持黑暗。分别在12,14,16,18,20胚龄随机取3个种蛋,取胚胎的腿肌、胸肌制作石蜡切片,测量各胚龄腿肌和胸肌组织纤维的直径和横截面积。结果表明:20胚龄时,经中光组照射孵化的坝上长尾鸡腿肌肌纤维直径和横截面积、胸肌肌纤维直径显著高于其余3组(P<0.05),而经强光组照射孵化的坝上长尾鸡胸肌肌纤维直径和横截面积均显著小于黑暗组(P<0.05)。孵化期使用中光组(90~140 lx)绿光照射可以促进鸡胚胎期肌纤维发育,而强光组(150~200 lx)绿光照射对坝上长尾鸡胚胎期胸肌肌纤维发育有一定的抑制作用。

鸡STAT家族成员鉴定及生物信息学分析

为了揭示鸡STAT基因家族的生物学功能,利用在线网站和软件对鸡STAT家族成员进行了鉴定并从理化性质、基因结构、进化关系、染色体定位及二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,鸡STAT基因家族有5个成员,分别命名为ChSTAT1,ChSTAT2,ChSTAT3,ChSTAT4,ChSTAT5A。它们都是酸性、不稳定的亲水蛋白,分布在7,27,33等3条染色体上。根据多物种STAT蛋白进化树分析该基因分为5个亚家族,分别含有1个STAT基因,不同亚家族基因结构、蛋白保守结构域均有差异,分支较近的成员间相似性较强。二级结构预测显示,成员均含有α-螺旋、β-折叠、延伸链和无规则卷曲。鉴定出鸡STAT家族包含5个成员,且成员间结构相对较为保守。

鸡胚卵巢基因共表达网络模块的构建及功能分析

为构建鸡胚卵巢的基因共表达网络模块,挖掘鸡卵巢发育相关功能基因,通过加权重基因共表达网络分析(WGCNA),利用鸡胚卵巢转录组测序数据构建了共表达模块,并对模块进行生物学过程、KEGG通路和蛋白互作网络分析,筛选出与鸡卵巢发育密切相关的枢纽基因。结果表明:共鉴别出8个共表达模块,对其中6个模块进行富集性分析并选出2个特征性模块:青色和红色,选出模块的候选枢纽基因进行蛋白互作网络分析并筛选出2个模块的枢纽基因,分别是:CDC5L和PLG;并从鸡两侧卵巢发育角度对2个模块进行了功能分析。

日粮不同铜水平对育成期乌苏里貉生长性能及血清生化指标的影响

试验研究饲粮中不同铜水平对育成期雄性乌苏里貉生长性能、血清生化及抗氧化能力的影响。随机选取(60±5)日龄健康的雄性乌苏里貉105只,采用单因子试验设计,随机分为7组,每组15个重复,每个重复1只。分别饲喂蛋氨酸铜含量为0 (Ⅰ组)、20 (Ⅱ组)、30 (Ⅲ组)、40 (Ⅳ组)、50 (Ⅴ组)、60 (Ⅵ组)、200 mg/kg (Ⅶ组)的试验饲粮。预试期7 d,正式试验期47 d。结果显示,试验34~47 d,Ⅰ组的乌苏里貉平均日增重(ADG)低于其余各组,Ⅱ组ADG最大。I组血清中碱性磷酸酶(ALP)活性显著低于除Ⅱ组外的其他各组(P<0.05)。Ⅶ组血清中乳酸脱氢酶(LDH)与谷丙转氨酶(ALT)活性显著高于其他各组(P<0.05)。Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ组血清中总超氧化物歧化酶(T-SOD)、铜锌超氧化物歧化酶(Cu-Zn SOD)与铜蓝蛋白(CP)含量均显著高于Ⅰ组(P<0.05)。试验表明,在育成期乌苏里貉日粮中添加30~50 mg/kg蛋氨酸铜能够提高平均日增重与抗氧化能力,为减少铜对环境的污染,推荐添加含量为30 mg/kg。

调控鸡黑色素生成相关基因共表达网络的构建

为了挖掘与鸡黑色素生成有关的基因,研究通过对NCBI网站公布的12份惠阳髯毛鸡羽毛毛囊的转录组数据进行了基因差异表达分析,并结合黑色素生成相关通路中的基因构建了共表达网络。结果显示:共筛选出了74个差异基因和100个通路基因用于权重基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA),在分析得到的5个模块中,青色模块与羽色表型显著相关(R=0.94,P<0.01)。对该模块进行hub基因挖掘,共获得16个hub基因。对该模块进行GO,KEGG富集分析,发现被显著富集的αMSH/MC1R,WNT/β-catenin信号通路参与了黑色素生成的调控。综合基因差异表达,WGCNA,GO和KEGG多种分析方法,筛选出基因WNT1在黑色素生成中起关键作用。

鸡羽色研究现状及发展

从羽色形成机理,羽色相关基因定位,鸡MC1R,TYR和ASIP基因的研究等方面对家鸡羽色研究现状进行了综述,并对鸡羽色特征与其行为、生理、生产性能的关系研究进行了展望。

鸡GATA基因家族鉴定及生物信息学分析

为了解鸡GATA(ChGATA)家族基因特性,利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定,分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系。结果表明,共鉴定出6个ChGATA基因,不均匀地分布在5条染色体上。根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2—ChGATA6和ChTRPS1。理化性质分析结果显示,ChGATA均为无稳定的亲水蛋白质,且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质。二级结构预测分析结果显示,ChGATA主要由无规则卷曲组成。保守结构域分析结果显示,ChGATA均包含ZnF;ATA结构域。系统进化分析结果显示,ChGATA基因家族可分为3个亚群,且同一亚群的基因结构相似、蛋白质三级结构相似、相互作用蛋白质较一致、亲缘关系较近。

益生菌维护肠道健康及抗病毒作用研究进展

动物肠道存在复杂的微生物群落,适宜的微环境有利于多种肠道微生物的定植生长。肠道健康是保证动物机体健康的基础,也是当前国内外学者所关注的热点问题。益生菌是对肠道健康有益的微生物,在改善动物肠道健康领域具有极大的潜力。益生菌对病原微生物侵袭有一定的抑制作用,对部分病毒也具有一定的预防及清除作用,但不同菌株作用效果存在较大差异。作者首先将益生菌对肠道健康的保护概括为益生菌抑制病原菌入侵和定植、改善肠道屏障功能、维持肠道健康菌群、提高机体免疫力4种方式,并探讨了不同菌株的作用方式;其次简述了益生菌抗肠道病毒的作用机制,其中,益生菌通过间接方式调节机体免疫是其抗病毒的主要方式;最后讨论了近年来益生菌在轮状病毒、流行性腹泻病毒和传染性胃肠炎病毒中应用的研究进展,并对益生菌的发展前景进行了展望,以期为益生菌在改善动物肠道健康的研究及产品的开发方面提供一定的参考依据。

饲粮添加甲酸钙对老龄蛋鸡生产性能和鸡蛋品质的影响

[目的]甲酸钙作为小分子质量的有机钙源,在改善蛋鸡生产方面具有很好的应用潜力。本研究旨在揭示饲粮添加甲酸钙对老龄蛋鸡生产性能、血液指标和鸡蛋品质的影响及适宜添加水平。[方法]试验采用单因子试验设计,选取360只62周龄健康海兰褐蛋鸡,随机分入4个处理组,每处理6个重复,每重复15只鸡。对照组饲喂基础饲粮,试验组分别饲喂以0.5%、1.0%和2.0%甲酸钙部分替代石粉的基础饲粮,各组饲粮的钙水平相同。正式期12周,每天记录产蛋情况,每周结料。在试验第2、4、6和8周测定鸡蛋品质相关指标;试验结束时,每重复取1只蛋鸡,采集血样,测定血常规和血清生化指标,然后屠宰测定脏器系数和胫骨质量。[结果]与对照组相比,饲粮添加甲酸钙对蛋鸡生产性能、第2和4周蛋品质无影响(P>0.05),但增加了第8和12周的蛋壳比、蛋壳厚度和蛋壳强度(P<0.05),其中0.5%添加水平效果最佳;降低了蛋鸡血液中中性粒细胞含量(P<0.05),增加了血红蛋白含量、红细胞压积及单核白细胞、嗜碱性粒细胞含量(P<0.05);降低了蛋鸡血清总蛋白、球蛋白、白蛋白和肌酐含量(P<0.05),增加了总胆红素含量(P<0.05);蛋鸡胰腺、脾脏、腿肌和胫骨指数均无显著差异(P>0.05),但胫骨断裂所需做功有增加的趋势(0.05<P<0.1)。[结论]饲粮添加甲酸钙部分替代石粉不影响老龄蛋鸡生产性能,且能改善蛋鸡的健康和蛋壳品质,推荐添加量为0.5%。