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基于网络药理学与分子对接探究苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制
被引量:
1
1
作者
房思远
赵子玉
+4 位作者
荣轩
朱永明
张世佳
李育明
赵兵令
《中国兽药杂志》
2023年第11期31-39,共9页
为了探讨苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制,试验通过网络药理学和分子对接的方法进行研究。首先筛选TCMSP数据库中苦参、虎杖、黄芪、菟丝子、益母草五味药材的成分和靶点,利用Uniprot数据库对靶标进行规范化处理,利用Cytoscape ...
为了探讨苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制,试验通过网络药理学和分子对接的方法进行研究。首先筛选TCMSP数据库中苦参、虎杖、黄芪、菟丝子、益母草五味药材的成分和靶点,利用Uniprot数据库对靶标进行规范化处理,利用Cytoscape 3.8.2建立药物-有效活性成分-靶点网络图。由GeneCards、OMIM、CTD数据库收集鸡输卵管炎的靶点。利用微生信在线平台制作鸡输卵管炎和苦虎益母口服液的韦恩图,找到共同靶点。由STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络互作图,并通过Cytoscape 3.8.2可视化。再使用DAVID在线工具对重叠靶标进行基因本体(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用AutoDock Tools软件对核心成分和靶点进行分子对接验证。预测苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的活性成分有74种,对应靶点77个,1137个鸡输卵管炎靶点,35个共同靶点。PPI网络显示涉及的关键靶点是雌激素受体1(ESR1)、细胞周期调节因子(CCND1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。GO功能富集分析筛选符合伪发现率<0.05的条件后得到相关条目8个。生物过程(biological process,BP)涉及到白细胞介素-18、巨噬细胞活化、免疫反应、细胞对异生刺激的反应、RNA聚合酶II启动子转录正调;细胞组分(cellular component,CC)涉及到细胞外间隙;分子功能(molecular function,MF)涉及到干扰素-γ受体结合、细胞因子。KEGG富集分析表明苦虎益母口服液发挥作用的通路主要有细胞衰老、细胞周期和Toll样受体信号通路。分子对接结果表明苦虎益母口服液有效活性成分槲皮素、山奈酚和木犀草素与关键靶点ESR1、CCND1和VEGFA的结核活性较好,结合能均小于0 kJ/mol。苦虎益母口服液多种有效成分可能作用于多个靶点,通过参与多种信号通路对鸡输卵管炎发挥作用。
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关键词
网络药理学
分子对接
苦虎益母口服液
鸡输卵管炎
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接探究苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制
被引量:
1
1
作者
房思远
赵子玉
荣轩
朱永明
张世佳
李育明
赵兵令
机构
河北
农业大学中兽医学院
河北
维尔
利
动物药业集团
有限公司
河北
省中兽药产业技术研究院
河北维尔利生物科技有限公司
出处
《中国兽药杂志》
2023年第11期31-39,共9页
基金
河北省中兽药产业技术研究院建设补助经费(225790267H)
石家庄市禽用中药产业技术研究院(238790749A)
河北省功能性饲料添加剂技术创新中心建设补助经费(217790537H)。
文摘
为了探讨苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制,试验通过网络药理学和分子对接的方法进行研究。首先筛选TCMSP数据库中苦参、虎杖、黄芪、菟丝子、益母草五味药材的成分和靶点,利用Uniprot数据库对靶标进行规范化处理,利用Cytoscape 3.8.2建立药物-有效活性成分-靶点网络图。由GeneCards、OMIM、CTD数据库收集鸡输卵管炎的靶点。利用微生信在线平台制作鸡输卵管炎和苦虎益母口服液的韦恩图,找到共同靶点。由STRING数据库构建蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络互作图,并通过Cytoscape 3.8.2可视化。再使用DAVID在线工具对重叠靶标进行基因本体(GO)以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用AutoDock Tools软件对核心成分和靶点进行分子对接验证。预测苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的活性成分有74种,对应靶点77个,1137个鸡输卵管炎靶点,35个共同靶点。PPI网络显示涉及的关键靶点是雌激素受体1(ESR1)、细胞周期调节因子(CCND1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。GO功能富集分析筛选符合伪发现率<0.05的条件后得到相关条目8个。生物过程(biological process,BP)涉及到白细胞介素-18、巨噬细胞活化、免疫反应、细胞对异生刺激的反应、RNA聚合酶II启动子转录正调;细胞组分(cellular component,CC)涉及到细胞外间隙;分子功能(molecular function,MF)涉及到干扰素-γ受体结合、细胞因子。KEGG富集分析表明苦虎益母口服液发挥作用的通路主要有细胞衰老、细胞周期和Toll样受体信号通路。分子对接结果表明苦虎益母口服液有效活性成分槲皮素、山奈酚和木犀草素与关键靶点ESR1、CCND1和VEGFA的结核活性较好,结合能均小于0 kJ/mol。苦虎益母口服液多种有效成分可能作用于多个靶点,通过参与多种信号通路对鸡输卵管炎发挥作用。
关键词
网络药理学
分子对接
苦虎益母口服液
鸡输卵管炎
Keywords
network pharmacology
molecular docking
Kuhu Yimu oral liquid
chicken salpingitis
分类号
S858.2 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学与分子对接探究苦虎益母口服液治疗鸡输卵管炎的作用机制
房思远
赵子玉
荣轩
朱永明
张世佳
李育明
赵兵令
《中国兽药杂志》
2023
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