目的:基于网络药理学与分子对接技术分析当归芍药散治疗卵巢癌(ovarian cancer)的药理机制。方法:结合文献和中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP...目的:基于网络药理学与分子对接技术分析当归芍药散治疗卵巢癌(ovarian cancer)的药理机制。方法:结合文献和中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)对当归芍药散成分和作用靶点进行检索,将药物靶点和Genecards数据库所载卵巢癌靶标进行对比,结果输入STRING数据库,并在Cytoscape3.8.0软件中制作网络图。采用Rstudio软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。利用PyMOL软件对排名前5位的活性成分和核心靶标进行分子对接可视化分析。结果:筛选共得药物活性成分70个,涉及VEGFA、RELA、PTGS2、MMP9、TP53、JUN、PGR等98个作用靶标;GO功能富集分析、KEGG信号通路富集结果显示:当归芍药散治疗卵巢癌主要通过药物反应、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、雌二醇反应等调节磷酸酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase-Akt signal transduction pathway/protein kinase B,PI3K/Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)等信号通路;分子对接结果表明黄芩素、鞣花酸与靶标蛋白有较好的结合活性。结论:当归芍药散治疗卵巢癌可能与VEGFA、TP53、PTGS2、PGR等作用靶标及调节PI3K-Akt、MAPK、VEGF等信号通路有关,黄芩素、鞣花酸可能是其发挥作用的主要成分。展开更多
文摘目的:基于网络药理学与分子对接技术分析当归芍药散治疗卵巢癌(ovarian cancer)的药理机制。方法:结合文献和中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)对当归芍药散成分和作用靶点进行检索,将药物靶点和Genecards数据库所载卵巢癌靶标进行对比,结果输入STRING数据库,并在Cytoscape3.8.0软件中制作网络图。采用Rstudio软件进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。利用PyMOL软件对排名前5位的活性成分和核心靶标进行分子对接可视化分析。结果:筛选共得药物活性成分70个,涉及VEGFA、RELA、PTGS2、MMP9、TP53、JUN、PGR等98个作用靶标;GO功能富集分析、KEGG信号通路富集结果显示:当归芍药散治疗卵巢癌主要通过药物反应、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、雌二醇反应等调节磷酸酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase-Akt signal transduction pathway/protein kinase B,PI3K/Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)等信号通路;分子对接结果表明黄芩素、鞣花酸与靶标蛋白有较好的结合活性。结论:当归芍药散治疗卵巢癌可能与VEGFA、TP53、PTGS2、PGR等作用靶标及调节PI3K-Akt、MAPK、VEGF等信号通路有关,黄芩素、鞣花酸可能是其发挥作用的主要成分。